Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1144724), страница 8

Файл №1144724 Диссертация (Молекулярно–генетические и клеточные механизмы дифференцировки симбиотического клубенька) 8 страницаДиссертация (1144724) страница 82019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 8)

Можно было ожидать, что мутанты по генам,кодирующим рецепторы Nod-факторов, будут характеризоваться ярковыраженными фенотипическими проявлениями — отсутствием каких-либоответов на действие Nod-фактора. При исследовании M. truncatula быливыявлены мутанты по локусу Nod factor perception (Mtnfp), которые послеобработки растений экзогенными Nod-факторами не проявляли никакихответных реакций (Amor et al., 2003). У L. japonicus были выявлены двалокуса, мутации по которым приводили к сходному фенотипу с мутациямипо локусу Mtnfp.

Данные гены, получившие обозначение Nod factor receptorkinase 1 и 5 (LjNfr1 и LjNfr5) были клонированы. Они кодируюттрансмембранныесерин/треонинрецептор-подобныекиназысвнеклеточными доменами, содержащих три LysM-мотива (Madsen et al.,2003; Radutoiu et al., 2003). Лишь относительно недавно были полученыданные, подтверждающие связывание LjNfr1 и LjNfr5 с Nod-факторамиОбзор литературы43(Broghammer et al., 2012).

Было показано, что MtNFP является ортологом генагороха PsSym10 и они также кодируют серин/треонин рецептор-подобныекиназы (Arrighi et al., 2006). LysM-мотивы способны связывать соединения,содержащие N-ацетилглюкозамин (Buist et al., 2008), что подтверждаетвозможность рассматривать выявленные киназы в качестве возможныхрецепторов Nod-факторов (Fliegmann, Bono, 2015). У M. truncatula былвыявлен еще один ген, кодирующий предполагаемый рецептор Nod-фактора— MtLYK3 (Limpens et al., 2003), а у гороха его ортолог PsSym37 (Zhukov etal., 2008). У MtNFP и LjNFR5 киназные домены не активны и не способны кавтофосфорилированию (Madsen et al., 2003; Arrighi et al., 2006; Madsen et al.,2011), в то время как MtLYK3 и LjNFR1 являются активными киназами(Mbengue et al., 2010; Madsen et al., 2011) (Рисунок 5).

Было высказанопредположение,чтовыявленныебелкиформируютгетеродимерныерецепторные комплексы: LjNFR1 и LjNFR5 у L. japonicus, MtNFP и MtLYK3у M. truncatula, PsSym10 и PsSym37 у гороха (Oldroyd, 2013).Рисунок 5. — Схематичное представление двух типов LysM-богатыхрецептор-подобных киназПоказан внеклеточный домен, состоящий из 3 лизиновых мотивов(LysM), связанных посредством трансмембранного домена либо сэнзиматически активным цитоплазматическим серин/треонин киназнымдоменом (А), как, например, у MtLYK3, либо с неактивным киназнымдоменом (B), таким как у MtNFP, лишенным фосфат-связывающей петли иактивационной петли и несущим модификацию значимого мотива (NFGвместо DFG) (Fliegmann, Bono, 2015).Обзор литературы44У L.

japonicus оба рецептора: LjNFR1 и LjNFR5 одинаково важны какдля ранних ответов растения на действие Nod-фактора (скручиваниекорневых волосков, активацию делений в коре корня), так и для развитияинфекции (Madsen et al., 2003; Radutoiu et al., 2003). Тем не менее, впоследние годы появились данные, указывающие на различную роль обоихрецепторов в контроле инфекции, что предполагает наличие дополнительныхрецепторов (Fliegmann, Bono, 2015).У M. truncatula, в отличие от L. japonicus, различия между рецепторамибыли выявлены сразу при анализе мутантов в соответствующих генах. Так,мутанты по гену Mtnfp, как уже было отмечено, были полностью лишеныпроявления ответных реакций на действие Nod-фактора (Amor et al., 2003), вто время как у мутантов по гену Mtlyk3 проявлялись ранние ответы надействие Nod-фактора, но блокировалось развитие инфекционного процесса(Catoira et al., 2001; Limpens et al., 2003).

Ранее было показано, что у люцерныпроявление ранних ответов и развитие инфекции определяется различнымикомпонентами Nod-фактора (Ardourel et al., 1994). Так, наличие сульфата навосстанавливающем конце необходимо для активации ранних ответов, адополнительныемодификациинаневосстанавливающемконце(О-ацетилирование и тип жирной кислоты) необходимы для развитияинфекции. Это позволило сформулировать гипотезу о существовании двухрецепторов: «сигнального», контролирующего ранние ответы и рецептора«проникновения», контролирующего процесс инфицирования (Ardourel et al.,1994). На роль «сигнального» рецептора хорошо подходил MtNFP, а на рольрецептора «проникновения» — MtLYK3.

Однако, учитывая, что MtNFP неявляется активной киназой, было предположено, что он выполняет своифункции «сигнального» рецептора в комплексе с еще невыявленнымрецептором (Fliegmann, Bono, 2015).Наличие двух сигнальных путей, активируемых разными рецепторами,было подтверждено существованием помимо кальциевых осцилляций вокругОбзор литературы45ядра, осцилляций кальция в кончике корневого волоска, которые былисвязаны с развитием процесса инфекции (Miwa et al., 2006). Было показано,что активация обоих путей зависит от MtNFP, что позволило предположить,что MtNFP формирует комплекс с MtLYK3, выполняя функции рецептора«проникновения» (Morieri et al., 2013).Предполагается, что у гороха комплекс PsSym10 и PsSym37 выполняетфункцию рецептора «проникновения» (Zhukov et al., 2008), а комплексPsSym10 с рецептор-подобной киназой PsК1 — «сигнального» рецептора(Zhukov et al., 2008; Долгих et al., 2017).1.1.5.

Первичные этапы сигнального пути, активируемого NodфакторамиПомимо описанных ранее рецепторов на плазматической мембранетакже локализуется рецептор-подобная киназа с богатыми лейциномповторами (LRR, от англ. Leucine-rich repeat), кодируемая генами DOES NOTMAKE INFECTION2 (MtDMI2) у M. truncatula (Endre et al., 2002) иSYMBIOSIS RECEPTOR-LIKE KINASE (LjSYMRK) у L. japonicus (Stracke et al.,2002).

У гороха ортологом этих генов является ген PsSym19 (Schneider et al.,1999; Stracke et al., 2002). Данный рецептор должен функционироватьпозднее рецепторов к Nod-фактору, т.к. у мутантов по этим генамсохраняются некоторые ответы на действие Nod-факторов, такие какдеформации корневых волосков (Catoira et al., 2000).

Тем не менее, лиганд,связывающийся c внеклеточным доменом данной киназы, не был выявлен, иее роль остается до конца не ясной (Downie, 2014).Важную роль в рецепции Nod-факторов играют и другие компонентысигнального пути. Так, в клубеньках M. truncatula уже через сутки послеинокуляции значительно усиливается экспрессия гена SYMBIOTIC REMORIN1 (MtSYMREM1) (Lefebvre et al., 2010). Подавление экспрессии этого гена спомощью РНК-интерференции приводило к формированию аномальныхОбзор литературыклубеньковсредуцированной46меристемой,приэтомнаблюдалосьувеличение числа инфекционных нитей, которые сильно ветвились,формировали мешкоподобные структуры (от англ. sac), но абортировались внаружных слоях коры корня.

Все это указывает на потерю инфекционныминитями способности к полярному росту. Транспозоновые мутанты по генуMtSYMREM1 также формировали аномальные клубеньки, в которыхнаблюдалось увеличение зоны инфекции (зональность клубенька будетдетально рассмотрена позднее в разделе 1.1.13), а также нарушен выходбактерий в цитоплазму растительной клетки (Lefebvre et al., 2010).

Былопоказано, что MtSYMREM1 присутствует в особых микродоменах —«липидных рафтах» — мембран инфекционной нити в зоне инфекции, атакже вокруг симбиосомных мембран в зоне азотфиксации. Было такжевыявлено, что MtSYMREM1 взаимодействует с MtNFP, MtLYK3 и MtDMI2,что предполагает, что MtSYMREM1 является адапторным («скаффолд», отангл. scaffold) белком, который определяет пространственную регуляциюрецепторных комплексов во время развития клубенька (Lefebvre et al., 2010).Наряду со специфичным для симбиоза реморином MtSYMREM1 быливыявленыдвафлотиллин-подобныхбелка(MtFLOT2иMtFLOT4),экспрессия генов MtFLOT2 и MtFLOT4 значительно усиливается через одиндень после инокуляции растений (Haney, Long, 2010). Для активацииэкспрессии этих генов недостаточно только действия Nod-факторов, нонеобходим дополнительный невыявленный бактериальный сигнал. MtFLOT4преимущественно локализуетсяв кончикахкорневых волосков приинокуляции S.

meliloti, что возможно связано с его ролью в полярном ростеинфекционной нити (Haney, Long, 2010). Выключение генов MtFLOT2 иMtFLOT4 уменьшало число инфекционных нитей, при этом увеличивалосьчисло абортированных нитей. Было высказано предположение, что MtFLOT2и MtFLOT4 вовлечены в первичную инвагинацию инфекционной нити вОбзор литературы47клетке корневого волоска, а MtFLOT4 необходим еще и для ростаинфекционной нити (Haney, Long, 2010).Было показано, что в корневых волосках MtLYK3 и MtFLOT4локализуются независимо в отсутствии ризобий, но колокализуются приинокуляции, при этом наблюдается их стабилизация в мембране.

Следуетотметить, что позднее MtLYK3 локализуется в мембране инфекционнойнити, что указывает на его возможную роль в развитии инфекции (Haney etal., 2011).В целом можно предположить, что MtLYK3 компартментализуется влипидных рафтах, возможно, взаимодействуя с MtSYMREM1, MtFLOT2 иMtFLOT4. Такого рода компартментализация может быть необходима длясоздания условий для формирования рецепторного комплекса, узнающегоNod-фактор, или для усиления интенсивности сигнала от рецептора,вызывающего ответные реакции на действие Nod-фактора (Oldroyd, 2013).Как уже ранее отмечалось, рецептор-подобная киназа с богатымилейцином повторами MtDMI2 функционирует на более поздней стадии, чемMtNFP и MtLYK3.

Было показано, что MtDMI2 взаимодействует с3-гидрокси-3-глутарил кофермент A редуктазой 1 — ферментом биосинтезамевалоната. Выключение гена MtHMGR1, кодирующего этот фермент, спомощью РНК-интерференции приводило к нарушениям в развитииинфекционного процесса и клубенька в целом (Kevei et al., 2007). Также былопоказано, что выключение MtHMGR1 влияло на ядерные кальциевыеосцилляции.

При этом экзогенная обработка мевалонатом восстанавливалакальциевые осцилляции у растений с выключенным геном MtHMGR1, атакже у мутантов по гену MtDMI2, но не у мутанта по гену MtDMI1,блокированного на более поздней стадии развития, и кодирующегорасположенный на ядерной мембране калиевый канал, необходимый дляактивации кальциевых осцилляций (Venkateshwaran et al., 2015). ТакимОбзор литературы48образом, можно предположить, что активация MtDMI2 при инокуляциирастений ризобиями может временно активировать 3-гидрокси-3-глутарилкофермент A редуктазы 1, что приводит к усилению продукции мевалоната вэпидермальных клетках корня. В свою очередь, мевалонат являетсявторичным мессенджером, передающим сигнал от компонентов сигнальногопути, расположенных на плазматической мембране к ядру, приводя кгенерации внутриядерных и перинуклеарных кальциевых осцилляций(Рисунок 6) (Venkateshwaran et al., 2015). Наличие кальциевых осцилляцийкак в нуклеоплазме, так и в цитоплазме вокруг ядра позволилопредположить, что просвет эндоплазматического ретикулума и просветядерной оболочки являются источниками кальция при генерации осцилляций(Oldroyd, Downie, 2006).

Как уже упоминалось, важную роль в генерациикальциевых осциляций играет расположенный на внешней ядерной мембранекалиевый канал MtDMI1 (Рисунок 6) (Ané et al., 2004; Riely et al., 2007),кодируемый у гороха ортологичным геном PsSym8 (Edwards et al., 2007). В тоже время у L. japonicus имеются два ортолога MtDMI1: LjCASTOR иLjPOLLUX, кодирующие калиевые каналы, для которых первоначально былапоказана локализация не в ядре, а в пластидах. Важно отметить, что, хотяLjCASTOR и LjPOLLUX являются гомологами, они не способны заменитьдруг друга и мутанты по какому-либо из генов LjCASTOR и LjPOLLUXхарактеризуются блоком развития на стадии скручивания корневыхволосков, что может свидетельствовать, что кодируемые ими белкиформируюткомплекс(Imaizumi-Anrakuetal.,2005).Позднеесиспользованием специфичных антител была показана иммунолокализацияLjCASTOR в ядерной оболочке, там же предполагается локализацияLjPOLLUX (Charpentier et al., 2008).Обзор литературы49Рисунок 6.

Характеристики

Список файлов диссертации

Молекулярно–генетические и клеточные механизмы дифференцировки симбиотического клубенька
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6392
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее