Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1144259), страница 20

Файл №1144259 Диссертация (Структурные характеристики белков, вовлечённых в нейродегенеративные процессы, определяющие особенности их межмолекулярных взаимодействий) 20 страницаДиссертация (1144259) страница 202019-06-23СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 20)

Возможно, это сопровождается изменением олигомерного состоянияS1R и может представлять интерес для дальнейших исследований.Важным свойством липидных мембран, построенных из более сложныхсмесей (например, липидов, содержащих насыщенные и ненасыщенные ацильныехвосты и холестерин) является образование двух несмешивающихся жидкихлипидных фаз: упорядоченной и разупорядоченной. Под упорядоченной фазой влитературе, как правило, подразумевают липидные рафты. Рафты могутфункционировать как сигнальные «платформы», за счет физико-химическихсвойств бислоя привлекать одни белки и исключать другие. В контекстебиологической функции рецептора сигма-1, наличие рафтовых микродоменовнеобходимо для правильной коммуникации между ЭР и митохондриями. Можнопредположить, что подобное белок-липидные взаимодействия стабилизируютобразованные липидные микродомены.- 111 -Таким образом, полученные нами экспериментальные данные на ГОЛпозволяют выдвинуть обоснованную гипотезу о том, что S1R являетсяорганизатором и стабилизатором рафтовых микродоменов в клетке.4.3.2 Внутриклеточная локализация рецептора сигма-1 обусловленаналичием холестерин-узнающих последовательностейВрезультатеанализааминокислотныхпоследовательностейбылопредположено наличие стерол-связывающего участка в составе трансмембраннойспирали рецептора.

Интересно, что последовательность RR ранее была описана влитературе как сигнал удержания S1R в ЭР через COPI-опосредованныймеханизм возврата из аппарата Гольджи в ЭР [155, 259]. В данной работе быловпервые показано, что CARC-последовательности в составе трансмембранногоучастка рецептора отвечают за правильную внутриклеточную локализацию S1R.Путем Было продемонстрировано, что замена любых остатков, необходимых дляузнавания холестерина, или внесение инсерций, разобщающих CARC-мотив,приводит к диффузному перерапределению рецептора в ЭР. На примере мутантнаR7ER8E было биохимически показано, что мутация по участку CARC приводит кперераспределению рецептора из МАМ в ЭР.

Таким образом, впервые былопоказано, что S1R локализуется в определенных областях ЭР благодаря не белокопосредованномумеханизму,аблагодаряпрямымбелок-липиднымвзаимодействиям.Впредыдущихисследованияхрецепторабылиописаныдвапредполагаемых сайта связывания холестерина [223]. Однако, согласно недавноопределенной кристаллической структуре S1R, обе последовательности находятсявдали от мембрано-связанных участков белка [154]. Кроме того, ни для одной изописанных последовательностей не было показано, что она определяетвнутриклеточную локализацию рецептора.

Таким образом, описанные ранеепоследовательности могут представлять собой вторичные, или дополнительныехолестерин-связывающие последовательности, в то время как мотив, описанный внастоящейработе,представляетсяглавнойстуктурнойдетерминантной,определяющей правильное внутриклеточное позиционирование белка.- 112 -4.3.3 Сигма-1 рецептор как основной рафтовый организаторэндоплазматического ретикулумаПредыдущие исследования сигма-1 рецептора действительно согласуются смеханизмом действия S1R, описанным в настоящей работе. В ряде статей былопоказано, что S1R может оказывать влияние на внутриклеточную локализациюрафт-ассоциированных белков-маркеров и стабильность меж-органелльныхконтактов.

Например, нокдаун гена S1R в первичной культуре нейронов приводилк потере ЭР-митохондриальных контактов [260]. В клеточной линии нокдаунрецептора приводил к перераспределению белков, локализующихся в рафтах(таких как флотиллин, Erlin 2 (ER-lipid raft associated protein 2) и кавеолин) в нерафтовые мембраны, а также сопровождался нарушениями везикулярноготранспортамеждуклеточнымикомпартментами[261].Такимобразом,существующие данные показывают, что отсутствие S1R приводит к глобальнымперестройкам в мембранном составе на клеточном уровне; а наличие рафторганизующих свойств рецептора, описанных в данной работе, позволяет, такимобразом, объяснить многозадачность S1R и многообразие наблюдаемыхклеточных эффектов.В данной работе предложена механистическая модель, объясняющаямеханизм функционирования S1R.

Последовательность событий в присутствиирецептора сигма-1 в мембране, содержащей рафтовые, нерафтовые липиды ихолестерин, может быть графически проиллюстрирована на рис. 8. В случае, еслихолестерола в мембране недостаточно для возникновения фазового разделения,фосфолипиды, сфингомиелины и холестерин распределены в бислое примерногомогенно (рис. 26 А). Холестерин предпочтительно взаимодействует сосфингомиелинами. В присутствии рецептора сигма-1 наблюдается кластеризациярецептора и холестерина, что приводит к увеличению локальной (эффективной)концентрации холестерина (переход из точки Ld в точку Lo на фазовойдиаграмме) (рис.

26 Б). Это способствует разделению фаз на Lo (рафтовую) и Ld(нерафтовую) (рис. 26 В). Рецептор сигма-1 стабилизирует образованныелипидные микродомены.- 113 -Рис. 26. Гипотеза о рецепторе сигма-1 как о организаторе микродоменов и стабилизаторелипидных рафтов (пояснения в тексте).Еслиответнавопросонеобходимостирецепторасигма-1дляперераспределения липидов ЭР получен в данной работе, то вопрос одостаточности рецептора сигма-1 как мембранного организатора остаетсяоткрытым. Мыши, нокаутные по гену SIGMAR1, обладают, тем не менее,достаточно слабо выраженным фенотипом депрессии и устойчивостью к сигмалигандам [262, 263]. Холестерин-связывающие участки рецептора консервативны,но только среди млекопитающих. Эти факты указывают на то, что в клетке,вероятно, существуют компенсаторные механизмы, способные компенсироватьутрату белка в клетке.

Одним из таких механизмов может быть компенсацияуровнейбелковойэкспрессиимембранныхканаловирецепторовдлякомпенсации измененной проводимости последних. Вторым механизмом можетбыть наличие другого белка, сходного по своим функциям с рецептором сигма-1.Как было указано ранее, к классу сигма-рецепторов относят, на настоящиймомент, рецепторы 1- и 2-го подтипов. Ген S2R был клонирован лишь в 2016году, и проведенный анализ первичной а.к. последовательности показал, что- 114 -рецептор S2R представляет собой, предположительно, белок с четырьмятрансмембранными участками [264]. Функция его на настоящий момент неочевидна, а также неизвестна атомная структура, но анализ первичной а.к.последовательности указывает также на наличие тандемных холестеринузнающих мотивов.4.3.4 Модель белок-липидного модулирования ионных каналов черезрецептор сигма-1. Связь с нейродегенеративными заболеваниямиНанастоящиймоментизвестно,чторецепторсигма-1способенмодулировать активность ряда ионных каналов плазматической мембраны и ЭР[265].

Ранее было продемонстрировано, что нокаут гена S1R приводит к потереконтактов между ЭР и митохондриями, и соответствующими нарушениями вкальциевой передаче между двумя клеточными компартментами [260]. На данныймомент, «мультизадачность» функций S1R не может быть объяснена лишьналичием белок-белковых взаимодействий между S1R и белками-партнерами.Например, нередко стимуляция агонистами или сверхэкспрессия приводила кодновременному увеличению токов через одни каналы и угнетению токов черездругие [265]. Большинство белков-партнеров были ко-иммунопреципитированы срецептором S1R только в условиях сверхэкспрессии обоих.

Таким образом,актуальным является поиск единого механизма функционирования S1R в клетке,который бы позволил объяснить большинство имеющихся на настоящий моментэкспериментальных данных.В данной работе впервые предложена гипотеза и рабочая модель о S1Rопосредованном модулировании свойств липидного бислоя, а также полученыпервые экспериментальные подтверждения в ее пользу. Во-первых, былопоказано, что внутриклеточное таргетирование рецептора в МАМ-областисвязано с наличием мотива связывания с холестерином.

Во-вторых, показано, чтобелок-липидныевзаимодействияопределяюткластеризациюрецепторавхолестерин-содержащих мембранах и секвестирование холестерина в эти области.В-третьих, эти данные были подкреплены биохимическими исследованиями белкадикого типа и его мутантных при фракционировании органелл. Кроме того, было- 115 -продемонстрировано, что мутантная форма белка не может компенсироватьутраченную функцию рецептора дикого типа по поддержанию синаптическихконтактов в модельных нейрональных культурах. Эти доводы свидетельствуют впользу того, что S1R является важным рафтовым организатором ЭР.Полученные данные имеют чрезвычайно важное биологическое значение.Известно, что мембранные белки и рецепторы проявляют различные активности вмембранах разного липидного состава.

Некоторые ионные каналы более активныв жидкой липидной фазе при низкой концентрации холестерина [266-268]. Другиеионные каналы более активны в рафтовых доменах с высокой концентрациейхолестерина [269, 270]. Рецептор сигма-1 функционирует, по-видимому, путемперераспределения холестерина (и, возможно, других типов липидов) междусвободной от холестерина жидкой липидной фазой и рафтовой фазой ЭР, и,косвенно,такжеплазматическоймембраной,дифференциальноиразнонаправлено регулируя многие мембранные каналы и рецепторы. Следующийпример иллюстрирует наблюдаемые эффекты рецептора сигма-1 на различныхпредставителях группы калиевых каналов плазматической мембраны.

Все каналынаходятсяврафтахплазматическоймембраныи,какпредполагается,взаимодействуют через трасмембранные домены с рецептором сигма-1 идифференциально модулируются в условиях сверхэкспресии. В качестве примерамодуляции не-рафтовых белков приведен пример кальциевых каналов ПМ (табл.5).Табл. 5. Предполагаемый механизм дифференциального модулированияионных каналов через рецептор сигма-1.КаналМодулирование МодулированиеЛокализациячерез S1RхолестериномKv1.3Инактивация при Инактивацияпри Рафты ПМсверхэкспресииувеличении[163]холестерина [271]Kv1.5Активация при Инактивацияпри Рафты ПМсверхэкспресииуменьшении[151]холестерина [272]Kir2.1Инактивация при Инактивацияпри Рафты ПМсверхэкспресииувеличении- 116 -[273]Кальциевый ИнгибированиеканалL- притипасверхэкспресии[275]холестерина [274]Инактивацияпри Не-рафтовая фазауменьшенииПМхолестерина [276]- 117 -ВЫВОДЫ1.СогласноэкспериментальнорентгеноструктурногоанализаустановленнойструктуресС-концевойпомощьюобластиметодаатаксина-3,полиглутаминовый тракт находится в двух конформациях: свободной петли(кристалл С1) и альфа-спирали (кристалл С2).2.

Структурной особенностью полиглутаминового тракта в альфа-спирально йконформации является то, что она стабилизирована двумя сетями водородныхсвязей: между атомами пептидной группы i и i+4 остатков и между карбокси- иаминогруппами боковых цепей остатков глутамина; при этом водородные связимежду боковыми цепями ориентированы параллельно оси альфа-спирали.3. Вновь разработанное пептоидное соединение HNP1 связывается с N-концевойобластью хантингтина с микромолярной аффинностью (Kd=20 мкМ).4. В микромолярных концентрациях HNP1 ингибирует агрегацию мутантногохантингтина в клетках линии HEK293T (снижение в 2,2 раза, p<0.0001). HNP1являетсянейропротекторомвкортико-стриатальноймоделиболезниХантингтона, восстанавливая плотность дендритных шипиков нейронов.5.РеконструированныйS1Rравномернораспределеннаповерхности«гигантских» одномембранных липосом, полученных из липида ДОФХ, икластеризуется в двухкомпонентной липидной смеси, содержащей холестерин.6.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
7021
Авторов
на СтудИзбе
260
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее