Biokhimia_T3_Strayer_L_1984 (1123304), страница 94
Текст из файла (страница 94)
Sci., 77, 2500-2504.ХемотаксисKoshland D.E., Jr., 1979. A modelregulatorysystem:bacterialchemotaxis, Physiol. Rev., 59, 811-862.Macnab R., Koshland D.E., Jr., 1972.The gradient-sensing mchanism inbacterial chemotaxis, Proc. Nat. Acad.Sci., 69, 2509-2512. (Эти опыты показали, что бактерии определяют временной, а не пространственный градиент.)Springer M.S.,Goy M.F.,Adler J.,1979. Protein methylation in behavioural control mechanisms and insignal transduction, Nature, 280,279-284.Silverman M.R., Simon M.I., 1974.Flagellar rotation and the mechanismof bacterial motility, Nature, 249,73-74.Manson M.D., Tedesco P., Berg C.,Harold F.M., van der Drift C., 1977.A protomotive force drives bacterialflagella, Proc.
Nat. Acad. Sci., 74,3060-3064.Manson M.D.,Tedesco P.M.,Berg H.C., 1980. Energetics of flagellarrotation in bacteria, J. Mol. Biol., 138,541-561.Khan S., Macnab R.M., 1980. Protonchemical potential, proton electricalpotential and bacterial motility, J.Mol.
Biol, 138, 599-614.Stock J.B., Koshland D.E., Jr., 1978.A protein methylesterase involved inbacterial sensing, Proc. Nat. Acad. Sci.,75, 3659-3663.Kondoh H., Ball С.В., Adler J., 1979.Identification of a methyl-acceptingchemotaxis protein for the ribose andgalactosechemoreceptorsofEscherichia coli, Proc. Nat. Acad. Sci.,76, 260-264,Berg H.C, Purcell E.M., 1977. Physicsof chemoreception, Biophys. J., 20,193-219.Ответы на вопросыи задачи2.3.Глава 241.2.3.4.5.6.7.a) TTGATC;б) GTTCGA;в) ACGCGT;г) ATGGTA.а) [Т] + [С] = 0,46.б) [Т] = 0,30; [С] = 0,24; [А] + [G] = 0,46.5,88•103пар оснований.Через 1,0 генерацию половина молекул будет15N — 1 5 N , а другая половина 1 4 N— 1 4 N.
Через2,0 поколения четверть всех молекул будет15N — 1 5 N , остальные три четверти 1 4 N — 1 4 N .Гибридные молекулы 1 4 N — 1 5 N при консервативной репликации обнаруживаться не будут.FAD, CoA, NADP + .ДНК-лигаза релаксирует сверхспирализованную ДНК, катализируя расщепление фосфодиэфирной связи в одной из цепей ДНК. Атакующаягруппа - AMP;онаприсоединяетсяк 5'-фосфорильной группе в месте расщепления.AMP необходим потому, что эта реакция представляет собой обращение заключительнойстадии соединения различных кусков ДНК (см.рис.
24.32 в разд. 24.15).5'-GGCATAC-3'.Глава 251.356а) ДНК-полимераза I представляет собой одну-единственную полипептидную цепь, а РНКполимераза имеет субъединичную структуруα2ββ'σ.б) Предшественниками служат дезоксинуклеозидтрифосфаты, а не рибонуклеозидтрифосфаты.в) Направление синтеза для обоих ферментов5'—>3'.г) ДНК-полимераза I обладает 5'—>3'- и 3'—>—>5'-экзонуклеазными активностями, а РНКполимераза - ни одной из них.д) ДНК-полимераза I осуществляет полуконсервативный синтез, а РНК-полимераза - консервативный.е) ДНК-полимеразе I необходима затравка,а РНК-полимеразе нет.4.5.6.Глава 261.2.3.4.5.6.Leu-Pro-Ser-Asp-Trp-Met-.Poly (Leu-Leu-Thr-Tyr).a) Pro (CCC), Ser (UCC), Leu (CUC) и Phe(UUC). В другом случае последнее основаниекаждого из этих кодонов может быть U.б) Эти С —> U- мутации были вызваны азотистой кислотой.а) Для этого понадобились бы две заменыоснований.б) Arg, Asn, Gln, Gln, Ile, Met или Thr.а) Нет, эта последовательность возникла в результате делеции первого основания приведенной ниже последовательности и вставки другого основания в конце.б)—AGUCCAUCACUUAAU—.Они имеют следующие последовательности:Lys-стоп; -Met-Arg-; -Asn-Gln-.Глава 271.2.3.4.Ответы на вопросы и задачиж) Движущей силой обеих реакций являетсягидролиз пирофосфата.5'-UAACGGUACGAU-3'.2'-ОН группа в составе РНК действует в качестве внутримолекулярного катализатора.
Прищелочном гидролизе РНК образуется 2'3'-циклический промежуточный продукт.Кордицепин обрывает синтез РНК. В цепиРНК, содержащей кордицепин, нет 3'-ОНгруппы.a) pGCp, AGUp, ACp, Up, GUp и С.б) pGp, CAGp, UACUGp и UCв) pGp, САр, Gp, UAp, CUGp и UC.г) pGp, CAp, Gp, Up, Ap, CUp и С.UAGCCUGAAUp.а) Нет; б) нет; в) да.В градиенте будет 4 полосы: легкая; тяжелая;полоса, соответствующая гибриду легкой 30Sи тяжелой 50S-субчастиц; полоса, соответствующая гибриду тяжелой 30S- и легкой 50Sсубчастиц.Расходуется примерно 799 богатых энергиейфосфатных связей: 400 для активирования 200аминокислот, 1 для инициации и 398 для образования 199 пептидных связей.б), в) и е) - механизм 1-го типа; а), г) и д) - механизм 2-го типа.5.6.7.8.Простейшее предположение состоит в том, чтоантикодон ССА триптофановой тРНК мутировал в UCA-кодон, комплементарный UGA.Однако изучение этой измененной тРНК привело к неожиданному результату.
Ее антикодоностался неизменным. Вместо этого произошлозамещение А на G в положении 24. Такимобразом, остаток, расположенный на значительном расстоянии от антикодона в линейнойпоследовательности, может влиять на точностьузнавания кодона.Один из подходов состоит в том, чтобы синтезировать тРНК, к которой присоединен реакционноспособный аналог аминокислоты. Например, бромацетилфенилаланил-тРНК служитреагентом для мечения по сродству Р-участкарибосом E.coli.
См.статью: Oen H., PellegriniМ., Eilat D., Cantor С. R., Ргос. Nat. Acad. Sci.,70, 2799 (1973).Последовательность GAGGU комплементарнапоследовательности пяти оснований на 3'-конце16S-pPHK и расположена на расстоянии нескольких оснований в 5'-сторону от кодонаAUG. Поэтому этот участок служит сигналомначала синтеза белка. Замещение G на А моглобы ослаблять взаимодействие этой мРНКс 16S-pPHK и снижать таким образом эффективность этой последовательности в качествесигнала инициации. Действительно, эта мутация приводит к 10-кратному снижению скорости синтеза белка, кодируемого мРНК. См.статью, в которой подробнее обсуждаютсясвойства этой интересной мутации: Dunn J. J.,Buzash-Pollert E., Studier F.
W., Proc. Nat. Acad.Sci., 75, 2741 (1978).В обоих случаях используются реакции гидролиза: 3'—>5'-экзонуклеазная активность ДНКполимеразы I и гидролиз ошибочного промежуточного продукта аминоацил—AMP поддействием аминоацил-тРНК—синтетазы.Глава 281.а) у i--мутанта нет lac-репрессора. Поэтомутакой мутант конститутивен в отношении синтеза белков lac-оперона.б) Этот мутант конститутивен в отношении2.3.4.5.6.синтеза белков trp-оперона, так как в нем нетtrp-репрессора.в) В этом мутанте арабинозный оперон не экспрессируется, так как для активирования транскрипции необходима Р2-форма araC-белка.г) Этот мутант обладает литическим действием, но не лизогенизирующим, так как онне способен синтезировать λ-репрессор.д) Этот мутант обладает лизогенизирующимдействием, но не способен к литическому действию, так как он не может синтезировать Nбелок - позитивный регуляторный фактор транскрипции.Одна из возможностей состоит в том, что вi S -мутанте образуется измененный lac-репрессор, который почти не имеет сродства к индуктору, но проявляет нормальное сродство к оператору.
Такой lac-репрессор будет связыватьсяс оператором и блокировать транскрипцию даже в присутствии индуктора.У этого мутанта lac-оператор изменен такимобразом, что он не может связывать репрессор.Такая мутация обозначается OC (от англ.operator constitutive - конститутивный оператор).У этого мутанта, видимо, белок, связывающийциклический AMP (БАК), либо имеет измененную структуру (дефектен), либо совсем отсутствует.Клетка E. coli, несущая профаг λ, содержит молекулы λ-репрессора, которые также блокируют транскрипцию предранних генов другихчастиц фага λ.а) Трансляция транскрипта PRE происходитв 5-10 раз быстрее, чем трансляция транскрипта РRM, так как он содержит полноценный сигнал инициации синтеза белка (как это обсуждается в разд.
27.14).б) Более эффективная трансляция транскриптаPRE приводит к быстрому образованию большого количества молекул λ-репрессора, необходимых для установления лизогенного состояния. Обсуждение этого процесса см. в статье:Ptashe M., Backman К., Humagun Z., Jeffrey A.,Maurer R., Meyer В., Sauer R.T., Science, 194,156 (1976).ПРИЛОЖЕНИЯМатематические постоянныеп = 3,14159е = 2,71828lnх = 2,303 lgxСоотношение единиц измеренияПРИЛОЖЕНИЕ АФизические константыи перевод единициз одной системыв другуюЧисловые значения физических константФизическиевеличиныЕдиницы измеренияДлина1 см= 10-2м = 10мм = 104 мкм == 107нм= 108 А = 0,3937 дюймаМасса1 г= 10 кг = 10 мг = 10 мкг= 3,527•10-2 унцийОбъем1 см3 = 10-6 м3 = 103 мм31 мл = 1 см3 = 10-3 л = 103 мкл1 см3 = 6,1•10-2 дюйм3 = 3,53•10-5фут3ТемператураК= °С + 273,15°С=5/9(°F-32)1 Дж = 107 эрг = 0,239 кал = 1 Вт•с1Символ ЗначениеВеличинаАтомная еди- а.е.м.ница массы(Да)(дальтон)Число Авогад- N1,66•10-24 гЭнергия6,022•1023 моль-1kэВ1,381•10-233,298•10-24Дж•К-1кал•К-1Фара- Fдея9,649•104 Кл•моль-12,306•104 кал•В - 1 •экв - 1РадиоактивностьКи3,70•1010Универсальная газоваяпостояннаяR8,314•Дж•моль-1•К-11,987 кал•моль -1 •К -1ПостояннаяПланкаhСкорость све- ста в вакууме61,602 • 10 - 1 9 Дж3,828•10-20 калЧисло31 торр = 1 мм рт.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
