Синтез мономеров полиамидных миметиков нуклеиновых кислот и исследование их свойств (1091937), страница 14

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 14)

К суспензии N2-бензилоксикарбонил-О6-бензилгуанин 17 (300 мг, 0.8 ммоль) в 5 млсвежеперегнанного ДМФА при перемешивании добавляли предварительно высушенныйкарбонат калия (111 мг, 0.8 ммоль). Реакционную смесь перемешивали 15 мин прикомнатной температуре, после чего по каплям прибавляли раствор 22a (333 мг, 0.62ммоль) в 5 мл ДМФА. Через 12 ч растворитель удаляли, полученную смесь растворяли в50 мл этилацетата, фильтровали через слой силикагеля (1010 мм) и промывали водой(220 мл) и насыщенным раствором NaCl (220 мл). Органическую фазу сушили надNa2SO4, растворитель удаляли.

Продукт хроматографировали, используя этилацетат вкачестве элюента. Растворитель удаляли, вещество сушили в вакууме (0.5 мм рт. ст.).Выход 200 мг, кристаллы белого цвета (41%). Rf 0.71 (этилацетат); []D20 -1.7 (с 1.0,CH3OH); Тm 47-49оС; 1Н-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): 7.70 (s, 1Н, C8HGua), 7.50-7.30 (m, 15Н,3C6H5), 5.82-5.75 (m, 1H, -CH2CH=CH2), 5.61 (s, 1H, BocNH-), 5.40-4.29 (m, 12H, CH2CH=CH2, 3-CH2Ph, -N(C=O)CH2-(Л), -CH2CH=CH2), 3.99-3.82 (m, 1H, -CH(Gluα)),3.70-3.62 (1H, m, BocHNCH2CH2-), 3.45-3.33 (m, 1H, BocHNCH2CH2-); 3.30-3.18 (m, 2H,BocNHCH2CH2-), 2.50-2.30 (m, 4H, -CH2(Gluγ), -CH2(Gluβ)), 1.39 (9H, s, Boc(tBu)-);13С-ЯМР (СDCl3, 75 МГц): 173.0, 170.2, 167.0, 161.1, 159.3, 156.0, 154.1, 140.0, 136.5, 135.4,131.4, 128.6, 119.3, 80.1, 68.1, 66.9, 66.7, 66.3, 60.09, 48.9, 44.2, 38.8, 30.3, 28.7, 24.0; HRMS(ESI) m/z вычислено для C44H49N7O10Na [M+Na]+ 858.3439, найдено 858.3411.Бензиловыйэфир(S)-4-[N-(трет-бутилоксикарбонил)амино]-5-[N-((N6-бензилоксикарбонил)-аденин-9-ил-ацетил)-N-(аллилоксикарбонил)метиламино]пентановой кислоты (25b).

Карбонат калия (574 мг, 4.16 ммоль) добавляли к раствору 275(1.12 г, 4.16 ммоль) в абсолютном ДМФА (50 мл). Полсе интенсивного перемешивания втечение 5 мин к смеси добавляли раствор 22b (1.5 г, 2.77 ммоль) в абсолютном ДМФА (40мл). Смесь перемешивали в течение 12 ч. Растворитель удаляли, остаток растворяли вэтилацетате (50 мл) и промывали водой (220 мл), насыщенным раствором NaCl (220мл). Органическую фазу сушили над Na2SO4, растворитель удаляли. Продукт выделялипри помощи колоночной хроматографии (элюент: DCM/метанол 25:1) и сушили в вакууме(0.5 мм рт.

ст.). Выход 1.37 г, кристаллы белого цвета (68%). Rf 0.28 (этилацетат); Тm 56-58○C; []D20 -6.7 (с 1.0, CH3OH); 1H-ЯМР (ацетон-d6, 600 MГц) δ 9.77 (s, br, 1H, -NHCbz),8.64-8.58 (d, J = 7.8 Гц, 1H, C2HAde), 8.28-8.18 (d, J = 13.5 Гц, 1H, C8HAde), 7.53-7.28 (m,10H, 2Ph (Cbz, Bzl)), 6.34-6.27 (d, J = 9.4 Гц, 1H, BocNH-), 6.06-5.98 (minor) 5.97-5.86(major) (2m, 1H, -CH2-CH=CH2), 5.52-5.47 (d, J = 16.9 Гц, 1H, -N(C=O)CH2-(Л)), 5.42-5.38 и5.32-5.31 (minor) (m, 2H, -CH2-CH=CH2), 5.37-5.33 (d, J = 16.9 Гц, 1H, -N(C=O)CH2-(Л)),5.30-5.27 (d, J = 1.7 Гц, 2H, -CH2Ph(Cbz)), 5.26-5.16 (major) (m, 2H, -CH2-CH=CH2), 5.155.09 (d, J = 27.9 Гц, 2H, -CH2Ph(Bzl)), 4.75-4.73 (minor) 4.61-4.57 (major) (2m, 2H, -CH2CH=CH2), 4.38-4.31 (d, J = 17.4 Гц, 1Н, -NCH2COOAll), 4.16-4.10 (d, J = 17.4 Гц, 1Н, NCH2COOAll) 4.09-4.02 (major) 3.89-3.82 (minor) (m, 1H, BocNHCH-), 3.77-3.69 (major)3.63-3.43 (minor) (m, 2H, BocNHCHCH2-), 2.62-2.50 (major) 2.49-2.39 (minor) (m, 2H, CH2(Gluγ)), 2.05-1.85 (major) 1.75-1.67 (minor) (m, 2H, -CH2(Gluβ)), 1.47-1.35 (d, J = 19.4Гц, 9H, Boc(tBu)-);13С-ЯМР (ацетон-d6, 150 MГц) δ 172.5, 172.4 (С=O(GluγOBzl)), 169.0,168.5 (C=O(-COOAll), 167.5, 166.9 (-N(C=O)CH2-(Л)), 156.0, 155.8 (C=O(Boc)), 152.3(C4Ade), 151.9 (C2HAde), 151.5 (C=O(Cbz)), 149.5, 149.4 (C6Ade), 144.9, 144.8 (C8HAde),136.6 (-C(Ph)), 132.4, 132.2 (-CH2-CH=CH2), 128.4, 128.1, 128.0, 127.9 (CH(Ph)), 122.2, 122.1(C5Ade), 117.8, 117.3 (-CH2-CH=CH2), 78.6, 78.1 (-C-O(Boc)), 66.7 (-CH2(Cbz)), 65.9, 65.7,65.6 (-CH2-CH=CH2), 65.0 (-CH2(Bzl)), 52.1 (BocNHCH-), 50.9 (BocNHCHCH2-), 49.3, 48.9,48.8 (BocNHCH-), 48.0 (-NCH2COOAll), 44.0, 43.7 (-N(C=O)CH2-(Л)), 30.7, 30.4 (CH2(Gluγ)), 27.8, 27.7 (-CH3(Boc)), 27.4, 27.0 (-CH2(Gluβ)); HRMS (ESI) m/z вычислено дляC37H44N7O9 [M+H]+ 730.3200, найдено 730.3186.Бензиловыйэфир(S)-4-[N-(трет-бутилоксикарбонил)амино]-5-[N-((N2-бензилоксикарбонил-O6-бензил)-гуанин-9-ил-ацетил)-N(аллилоксикарбонил)метиламино] пентановой кислоты (26b).

К суспензии 17 (191 мг,0.51 ммоль) в абсолютном ДМФА (15 мл) добавляли K2CO3 (70 мг, 0.51 ммоль). Послеперемешивания в течение 15 мин к смеси добавляли раствор 22b (228 мг, 0.42 ммоль) вабсолютном ДМФА (15 мл). Смесь перемешивали в течение 12 ч. Растворитель удаляли,остаток растворяли в этилацетате (30 мл) и промывали водой (220 мл), насыщеннымраствором NaCl (220 мл). Органическую фазу сушили над Na2SO4, растворитель удаляли.76Продукт выделяли при помощи колоночной хроматографии (элюент: DCM/метанол 50:3)и сушили в вакууме (0.5 мм рт. ст.).

Выход 180 мг, кристаллы белого цвета (51%). Rf 0.57(этилацетат); Тm 49-51 ○С; []D20 -5.0 (с 1.0, CH3OH); 1Н-ЯМР (ацетон-d6, 600 MГц) δ 9.68(s, 1H, CbzNH-), 8.19-8.01 (d, J = 73.6 Гц, 1Н, C8HGua), 7.75-7.16 (m, 15Н, 3Ph (Bzl, Bzl,Cbz)), 6.78-6.71 (d, J = 9.5 Гц, 1Н, BocNH-), 6.10-5.98 (minor) 5.97-5.86 (major) (2m, 1H, CH2-CH=CH2), 5.72-5.67 (d, J = 16.3 Гц, 1H, -N(C=O)CH2-(Л)), 5.66-5.50 (m, 2H, CH2Ph(Bzl)Gua), 5.42-5.27 (minor) 5.37-5.25 (major) (2m, 2H, -CH2-CH=CH2), 5.24-5.17 (q, J= 12.5 Гц, 2H, -CH2Ph(Cbz)), 5.14-5.05 (q, J = 12.6 Гц, 2H, -CH2Ph(Bzl)), 4.89-4.83 (d, J =16.3 Гц, 1H, -N(C=O)CH2-(Л)), 4.74-4.66 (minor) 4.65-4.57 (major) (2m, 2H, -CH2-CH=CH2),4.52-4.44 (d, J = 17.5 Гц, 1Н, -NCH2COOAll), 4.05-3.97 (d, J = 17.5 Гц, 1Н, -NCH2COOAll),3.88-3.85 (minor) 3.84-3.81 (major) (2d, J = 11.5 Гц, 1H, BocNHCH-), 3.71-3.66 (minor) (dd,J1 = 13.3 Гц, J2 = 5.7 Гц) 3.65-3.61 (major) (dd, J1 = 15.2 Гц, J2 = 4.5 Гц) (1H, BocNHCHCH2-),3.56-5.41 (minor) 3.39-3.29 (major) (2m, 1H, BocNHCHCH2-), 2.77-2.67 (minor) 2.64-2.36(major) (2m, 2H, -CH2(Gluγ)), 2.04-1.94 (major) 1.93-1.63 (2m, 2H, -CH2(Gluβ)), 1.49-0.92 (d,J = 250.1 Гц, 9Н, Boc(tBu)-); 13С-ЯМР (ацетон-d6, 150 MГц) δ 172.7 (С=O(GluγOBzl)), 168.8(C=O(-COOAll), 167.1 (-N(C=O)CH2-(Л)), 160.3 (-CH2Ph(Bzl)Gua), 156.1 (-C=O(Boc)), 153.5(C4Gua), 152.0 (C2HGua), 143.6 (C8HGua), 136.7, 136.6, 136.5 (-C(Ph)), 132.4, 132.3 (-CH2CH=CH2), 128.9, 128.5, 128.4, 128.1, 128.0 (CH(Ph)), 117.8, 117.3 (-CH2-CH=CH2), 116.8(C5Gua), 78.0, 77.6 (-C-O(Boc)), 67.8, 67.2 (-CH2(Bzl)Gua), 66.1 (-CH2(Cbz)), 65.7 (CH2(Bzl)),65.0(-CH2-CH=CH2),52.4(BocNHCH-),48.2(-NCH2COOAll),47.7(BocNHCHCH2-), 42.5 (-N(C=O)CH2-(Л)), 31.0 (-CH2(Gluγ)), 27.8, 27.7, 27.4 (-CH3(Boc)),26.6 (-CH2(Gluβ)); HRMS (ESI) m/z вычислено для C44H50N7O10 [M+H]+ 836.3619, найдено836.3600.-бензиловыйэфирN-[2-(трет-бутилоксикарбонил)аминоэтил]-N-[(О6-бензил)-гуанин-9-ил-ацетил]-L-глутаминовой кислоты (27a).

К суспензии 23a (360 мг, 0.51ммоль) в 4 мл ТГФ в атмосфере аргона последовательно добавляли N-этиланилин (0.32мл, 2.06 ммоль) и [Pd(PPh3)4]о (59 мг, 0.05 ммоль). Через 1 ч реакционную смесь по каплямдобавляли к 100 мл гексана, что приводило к образованию осадка, которыйотфильтровывали, промывали гексаном и хроматографировали, используя этилацетат вкачестве элюента. Растворитель удаляли, вещество сушили в вакууме (0.5 мм рт. ст.).Выход 260 мг, кристаллы желтого цвета (77%). Rf 0.5 (этилацетат); Тm 120-122 ○С; []D20 1.7 (с 1.0, CH3OH); 1Н-ЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц) δ 7.72 (d, J = 6.5 Гц, 1Н), 7.55-7.25 (m,10Н), 7.02 (m, 1H), 6.39 (s, 2H), 5.50 (s, 2H), 5.16-4.99 (m, 3H), 4.89 (s, 1H), 4.31-4.00 (m,1H), 3.52-3.21 (m, 2H), 3.18-2.98 (m, 2H), 2.62 (m, 1H), 2.42-2.19 (m, 2H), 1.98 (m, 1H), 1.41(d, J = 9.2 Гц, 9H); 13С-ЯМР (ДМСО-d6, 75 МГц) δ 172.8, 172.6, 167.7, 166.9, 160.1, 159.8,77155.7, 141.1, 137.0, 136.3, 131.7, 128.9, 128.8, 128.4, 128.1, 121.3, 113.3, 78.2, 77.6, 67.0,65.6, 61.1, 59.8, 46.2, 44.6, 39.7, 31.4, 28.4, 25.0; HRMS (ESI) m/z вычислено для C33H38N7O8[M-H]- 660.2782, найдено 660.2790.-БензиловыйэфирN-[2-(трет-бутилоксикарбонил)аминоэтил]-N-[(N2-бензилоксикарбонил-O6-бензил)-гуанин-9-ил-ацетил]-L-глутаминовой кислоты (28a);К суспензии 24a (164 мг, 0.20 ммоль) в 4 мл ТГФ в атмосфере аргона последовательнодобавляли N-этиланилин (0.12 мл, 0.78 ммоль) и [Pd(PPh3)4]о (23 мг, 0.02 ммоль).

Через 1 чреакционную смесь по каплям добавляли к 100 мл гексана, что приводило к образованиюосадка, который отфильтровывали, промывали гексаном ихроматографировали,используя этилацетат в качестве элюента. Растворитель удаляли, вещество сушили ввакууме (0.5 мм рт. ст.). Выход 136 мг, кристаллы желтого цвета (87%). Rf 0.61(DCM/метанол/уксусная кислота, 9:1:0.1); Тm 116-118 ○С; []D20 -5.0 (с 1.0, CH3OH); 1НЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц) δ 10.35 (d, J = 7.1 Гц, 1H), 7.72 (dd, J1 = 20.6 Гц, J2 = 5.2 Гц, 1Н),7.65-7.12 (m, 15Н), 6.85 (m, 1H), 5.59 (s, 2H), 5.29-4.89 (m, 6H), 4.31-3.99 (m, 1H), 3.05 (m,2H), 2.59 (m, 1H), 2.39 (m, 2H), 1.89 (m, 1H), 1.35 (m, 9H); 13С-ЯМР (ДМСО-d6, 75 МГц) δ173.4, 173.2, 160.2, 160.0, 156.0, 152.3, 137.1, 136.6, 134.9, 131.9, 129.3, 128.7, 128.3, 128.2,116.9, 110.0, 78.4, 78.0, 68.1, 66.1, 65.9, 65.8, 45.0, 38.7, 31.7, 28.9, 25.5; HRMS (ESI) m/zвычислено для C41H44N7O10 [M-H]- 794.3150, найдено 794.3155.Бензиловыйэфир(S)-4-[N-(трет-бутилоксикарбонил)амино]-5-[N-((N6-бензилоксикарбонил)-аденин-9-ил-ацетил)-N-(карбоксиметил)амино]пентановойкислоты (29b); К суспензии 25b (610 мг, 0.84 ммоль) в абсолютном ТГФ (50 мл)последовательно добавляли морфолин (0.73 мл, 8.36 ммоль) и [Pd(PPh3)4]о (96.5 мг, 0.08ммоль) в атмосфере аргона.

Реакционную смесь перемешивали в течение 1.5 ч. прикомнатной температуре. Растворитель удаляли. Остаток растворяли в этилацетате (50 мл)и промывали раствором NaCl (доведенного до pH 3 0.1 M раствором KHSO4) (320 мл),насыщенным раствором NaCl (110 мл). Органическую фазу сушили над Na2SO4,растворитель удаляли. К остатку добавляли диэтиловый эфир (20 мл), полученнуюсуспензию охлаждали при 4°C в течение 12 ч. Образующийся осадок собиралифильтрованием, промывали диэтиловым эфиром и сушили в вакууме (0.5 мм рт. ст.).Выход 565 мг, кристаллы желтого цвета (98%). Rf 0.23 (DCM/метанол/уксусная кислота,9:1:0.1); Тm 156-158 ○С; []D20 +3.3 (с 1.0, CH3OH); 1H-ЯМР (ДМСО-d6, 300 MГц) δ 10.65 (sbr, 1H), 8.62-8.50 (d, J = 9.8 Гц, 1H), 8.34-8.22 (d, J = 14.9 Гц, 1H), 7.51-7.23 (m, 10H), 6.346.27 (dd, J1 = 9.5 Гц, J2 = 8.5 Гц, 1H), 5.30-4.99 (m, 6H), 4.07-3.87 (m, 2H), 3.83-3.71 (m, 1Н),3.51-3.35 (m, 1H), 3.13-2.98 (m, 1H), 2.44-2.21 (m, 2H), 1.83-1.44 (m, 2H), 1.35 (s, 9H); 13СЯМР (ДМСО-d6, 75 MГц) δ 173.0, 172.9, 167.8, 166.5, 156.1, 155.9, 152.9, 152.7, 151.8,78149.8, 149.7, 145.8, 145.5, 136.8, 136.7, 128.8, 128.4, 128.3, 123.3, 78.5, 78.1, 66.6, 65.9, 65.8,52.4, 51.4, 48.7, 44.5, 30.8, 30.7, 28.6, 27.4; HRMS (ESI) m/z вычислено для C34H40N7O9[M+H]+ 690.2887, найдено 690.2881.Бензиловыйэфир(S)-4-[N-(трет-бутилоксикарбонил)амино]-5-[N-((N2-бензилоксикарбонил-O6-бензил)-гуанин-9-ил-ацетил)-N-(карбоксиметил)амино]пентановой кислоты (30b); К суспензии 26b (180 мг, 0.22 ммоль) в абсолютном ТГФ (50мл) последовательно добавляли морфолин (0.21 мл, 2.16 ммоль) и [Pd(PPh3)4]о (25.2 мг,0.02 ммоль) в атмосфере аргона.

Характеристики

Список файлов диссертации