Диссертация (Молекулярно-генетические основы ювенильного артрита), страница 12
Описание файла
Файл "Диссертация" внутри архива находится в папке "Молекулярно-генетические основы ювенильного артрита". PDF-файл из архива "Молекулярно-генетические основы ювенильного артрита", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "медицина" из Аспирантура и докторантура, которые можно найти в файловом архиве РНИМУ им. Пирогова. Не смотря на прямую связь этого архива с РНИМУ им. Пирогова, его также можно найти и в других разделах. , а ещё этот архив представляет собой кандидатскую диссертацию, поэтому ещё представлен в разделе всех диссертаций на соискание учёной степени кандидата медицинских наук.
Просмотр PDF-файла онлайн
Текст 12 страницы из PDF
Таким образом, можно предположить наличиемодифицирующей роли у локуса PADI4 rs2240336, способствующего проявлениюпотенциальных эффектов локуса IL6 rs1800795.65(A)(Б)Рисунок 7 ‒ Наиболее удачная модель межгенных взаимодействий приформировании предрасположенности к ЮИА c учетом различий по полу (графы):(A) у девочек; (Б) у мальчиковУ мальчиков наиболее удачной оказалась трехлокусная модель IL10rs1800872 - IL6 rs1800795 - IL2RA rs2104286 (поиск методом «Forced»:скорректированнаясбалансированнаяточностьтестирования–0,61,воспроизводимость – 100%, pcor=0,009) (Рисунок 7-Б).
Взаимодействие локуса IL6rs1800795 с остальными оказалось синергичным и максимально проявилось впаре IL6 rs1800795 - IL10 rs1800872. В то же время исследование комбинациилокусов IL10 rs1800872 - IL2RA rs2104286 показало снижение информационногоприроста. Последующий сравнительный анализ позволил установить, чтокомбинация генотипов CA-GG-AA локусов рассматриваемой модели встречаласьу мальчиков с ЮИА значительно чаще (p=0,0031, pcor=0,0030, OR=4,784, 95% CI1,550-13,370), а комбинация CC-GG-AG – значительно реже (p=0,0045, pcor=0,0052,OR=0,140, 95% CI 0,031-0,578), чем у юношей в контрольной группе.
Следуетотметить, что для отдельных вариантов полиморфных локусов IL10 rs1800872, IL6rs1800795, IL2RA rs2104286 ассоциаций с развитием ЮИА у мальчиков намивыявлено не было, что вновь свидетельствует о важной роли межгенныхвзаимодействий в реализации функциональной роли отдельных генетическихмаркеров.Полученные сведения также подтверждают предположение о наличиисущественных различий в молекулярно-генетических детерминантах, лежащих воснове наследственной предрасположенности к ЮИА у девочек и у мальчиков.66Оценка вклада полиморфизма генов медиаторов иммунного ответа вформирование предрасположенности к РФ-позитивному полиартикулярномуварианту ЮИАПри изучении полиморфного локуса LTA rs909253 оказалось, что все 100%пациентов с РФ-позитивным полиартикулярным вариантом ЮИА имелигетерозиготный генотип LTA rs909253*AG, тогда как в контрольной группеналичие генотипа LTA rs909253*AG было зарегистрировано только у 42,98%индивидов (p=0,007, pcor=0,007, OR=NA (NA – не определен), 95% CI 1,841-NA)(Рисунок 8).
Напротив, генотип LTA rs909253*AA, который отсутствовал упациентов с данной патологией, в контрольной группе наблюдался почти вполовине случаев (49,12%) (p=0,030, pcor=0,031, OR=0,00, 95% CI 0,00-0,745).Наиболее удачной моделью наследования оказалась сверхдоминантная (AG противAA+GG, p=0,0016, OR=NA, 95% CI 0,00-NA). Следует отметить, что выборкапациентовсРФ-позитивнымполиартикулярнымвариантомЮИАбыланебольшой, ввиду чего стратификация по полу не проводилась.РФ-позитивный полиартрит (N=6)rs909253model:o-dom%*100,0Контрольrs755622model:log-ad80,060,0**40,020,0PADI4 rs2240336*AAPADI4 rs2240336*GAPADI4 rs2240336*GGPTPN22 rs2476601*AAPTPN22 rs2476601*GANFKB1 rs28362491*DDPTPN22 rs2476601*GGNFKB1 rs28362491*IINFKB1 rs28362491*IDCTLA4 rs3087243*AACTLA4 rs3087243*GAMIF rs755622 *CCCTLA4 rs3087243*GGMIF rs755622 *GCMIF rs755622 *GGIL10 rs1800872*CAIL10 rs1800872*AAIL6 rs1800795*CCIL10 rs1800872*CCIL6 rs1800795*GCIL6 rs1800795*GGIL2RA rs2104286*GGIL2RA rs2104286*AAIL2RA rs2104286*AGIL2-21 rs6822844*TTIL2-21 rs6822844*GTIL1B rs16944*TTIL2-21 rs6822844*GGIL1B rs16944*CTIL1B rs16944*CCLTA rs909253*GGLTA rs909253*AALTA rs909253*AGTNFA rs1800629*AATNFA rs1800629*GATNFA rs1800629*GG0,0Примечание – Здесь и далее на гистограммах частот генотипов полиморфных локусовзнаком * отмечены генотипы, различия по которым достигли уровня статистической значимости.Рисунок 8 – Распределение частот генотипов изученных локусов у пациентов сРФ-позитивным полиартикулярным вариантом ЮИА и у индивидов контрольнойгруппы67Молекулярно-генетический анализ полиморфного локуса MIF rs755622показал значительное повышение частоты аллеля MIF rs755622*C и снижениечастоты генотипа MIF rs755622*GG при РФ-позитивном полиартикулярномварианте ЮИА, в сравнении с контрольной группой (*С: 50,00% против 21,78%,p=0,031, pcor=0,028, OR=3,591, 95% CI 1,119-11,472; *GG: 16,67% против 60,23%,p=0,042, pcor=0,040, OR=0,132, 95% CI 0,011-0,975 соответственно).
Лог-аддитивнаямодель наследования лучше других отражала полученные результаты, а в качестверискового маркера с аддитивным эффектом в отношении вероятности развития РФпозитивного полиартикулярного варианта ЮИА выступал аллель MIF rs755622*С(2CC+GC против GG, p=0,028, OR=4,03, 95% CI 1,19-13,70).По вариантам локусов TNFA rs1800629, IL1B rs16944, IL2-IL21 rs6822844,IL2RA rs2104286, IL6 rs1800795, IL10 rs1800872, CTLA4 rs3087243, NFKB1rs28362491, PADI4 rs2240336 и гаплотипам локусов TNFA rs1800629 - LTA rs909253различия оказались недостоверными (p>0,05).
Наблюдалась тенденция к болеечастой встречаемости генотипа CTLA4 rs3087243*GG и более редкой ‒ аллеляCTLA4 rs3087243*А при РФ-позитивном полиартикулярном варианте ЮИА, всравнении с контрольной группой (*GG: 83,33% против 42,69%, pcor=0,091; *A:8,33%против34,65%,pcor=0,069соответственно).Крометого,прирассматриваемом варианте ЮИА оказались незначительно повышены частотыаллеля PTPN22 rs2476601*А и гаплотипа TNFA rs1800629*G - LTA rs909253*G(PTPN22 rs2476601*А: 25,00% против 9,38%, pcor=0,095; TNFA rs1800629*G - LTArs909253*G: 50,00% против 16,23%, p=0,100, в сравнении с контрольной группойсоответственно).Оценка вклада полиморфизма генов медиаторов иммунного ответа вформирование предрасположенности к РФ-негативному полиартикулярномуварианту ЮИАБез учета пола существенных различий в распределении изученныхполиморфных вариантов и гаплотипов локусов у пациентов с РФ-негативнымполиартикулярным вариантом ЮИА и в контрольной группе выявлено не было68(p>0,05).
Наблюдалась лишь тенденция к повышению доли генотипа NFKB1rs28362491*ID у пациентов с данной патологией (59,30% против 48,25%, pcor=0,072,в сравнении с контрольной группой соответственно). Следует, однако, отметить,что статистически значимые результаты были получены при проверке рецессивноймодели наследования по локусу TNFA rs1800629 (AA против GG+GA, p=0,043,OR=0,00, 95% CI 0,00-NA). После проведения стратификации по полу наличиеассоциаций с развитием РФ-негативного полиартикулярного варианта ЮИА былоустановлено только для мальчиков (при проверке доминантной моделинаследования по локусу LTA rs909253 – также для девочек).При исследовании полиморфного локуса LTA rs909253 оказалось, что умальчиков с РФ-негативным полиартикулярным вариантом ЮИА генотип LTArs909253*AA встречался значительно реже, чем у юношей в контрольной группе(23,53% против 53,77% соответственно, p=0,034, pcor=0,035, OR=0,265, 95% CI0,090-0,887) (Рисунок 9).
Кроме того, наблюдалась тенденция к повышению частотгенотипа LTA rs909253*AG и аллеля LTA rs909253*G у мальчиков с даннойпатологией (*AG: 64,71% против 37,74%, pcor=0,064; *G: 44,12% против 27,36%,pcor=0,066). Напротив, у девочек с РФ-негативным полиартикулярным вариантомЮИА генотип LTA rs909253*AA встречался несколько чаще, а генотип LTArs909253*AG – несколько реже, чем в контрольной группе, однако различияоказались недостоверными (*AA: 60,87% против 47,03%, pcor=0,058 и *AG: 31,88%против45,34%,pcor=0,053соответственно).Наиболееудачноймодельюнаследования в обоих случаях оказалась доминантная, однако у мальчиков аллельLTA rs909253*G маркировал повышенный, а у девочек – сниженный риск развитияРФ-негативного полиартикулярного варианта ЮИА (AG+GG против АА, p=0,018,OR=3,78, 95% CI 1,16-12,35 и p=0,042, OR=0,57, 95% CI 0,33-0,99 соответственно).При анализе гаплотипов полиморфных локусов TNFA rs1800629 и LTArs909253 было установлено существенное повышение доли гаплотипа G-G умальчиков с РФ-негативным полиартикулярным вариантом ЮИА (32,35% против16,98%, p=0,041, OR=2,36, 95% CI 1,04-5,36, в сравнении с контрольной группойсоответственно).69РФ-негативный полиартрит - мальчики (N=17)rs909253model:dom%100,0rs2104286model:log-adКонтроль - юношиrs1800872model:dom*80,060,0**40,0*20,0PADI4 rs2240336*AAPADI4 rs2240336*GAPADI4 rs2240336*GGPTPN22 rs2476601*AAPTPN22 rs2476601*GANFKB1 rs28362491*DDPTPN22 rs2476601*GGNFKB1 rs28362491*IINFKB1 rs28362491*IDCTLA4 rs3087243*AACTLA4 rs3087243*GAMIF rs755622*CCCTLA4 rs3087243*GGMIF rs755622*GCMIF rs755622*GGIL10 rs1800872*CAIL10 rs1800872*AAIL6 rs1800795*CCIL10 rs1800872*CCIL6 rs1800795*GCIL6 rs1800795*GGIL2RA rs2104286*GGIL2RA rs2104286*AAIL2RA rs2104286*AGIL2-21 rs6822844*TTIL2-21 rs6822844*GTIL1B rs16944*TTIL2-21 rs6822844*GGIL1B rs16944*CTIL1B rs16944*CCLTA rs909253*GGLTA rs909253*AALTA rs909253*AGTNFA rs1800629*AATNFA rs1800629*GATNFA rs1800629*GG0,0Рисунок 9 – Распределение частот генотипов полиморфных локусов у мальчиковс РФ-негативным полиартикулярным вариантом ЮИА и у юношей в контрольнойгруппеПри изучении полиморфного локуса IL2RA rs2104286 наблюдалосьсущественное повышение частоты генотипа IL2RA rs2104286*AА и снижениечастот генотипа IL2RA rs2104286*AG и аллеля IL2RA rs2104286*G у мальчиков сРФ-негативным полиартикулярным вариантом ЮИА, в сравнении с юношамиконтрольной группы (*AA: 94,12% против 65,09%, p=0,021, pcor=0,020, OR=8,58, 95%CI 1,313-92,61; *AG: 5,88% против 32,08%, p=0,039, pcor=0,037, OR=0,132, 95% CI0,012-0,87; *G: 2,94% против 18,87%, p=0,023, pcor=0,023, OR=0,13, 95% CI 0,012-0,724соответственно).
Наиболее удачно приведенные различия отражала лог-аддитивнаямодель наследования, а аддитивный эффект в отношении снижения рискасоответствующей патологии у мальчиков был установлен для аллеля IL2RArs2104286*G (2GG+AG против AA, p=0,0062, OR=0,12, 95% CI 0,02-0,95).При исследовании полиморфного локуса IL10 rs1800872 было показано, чтоу мальчиков с РФ-негативным полиартикулярным вариантом ЮИА аллель IL10rs1800872*А встречался значительно чаще, а генотип IL10 rs1800872*CC –значительно реже, чем у юношей в контрольной группе (*A: 47,06% против 29,25%,p=0,047, pcor=0,046, OR=2,151, 95% CI 1,029-4,375; *CC: 23,53% против 50,94%,70p=0,040, pcor=0,037, OR=0,296, 95% CI 0,101-0,993 соответственно). Лучше другихполученные результаты описывала доминантная модель наследования, согласнокоторой наличие аллеля IL10 rs1800872*А маркирует повышенный риск развитиярассматриваемой патологии у мальчиков (CA+AA против СС, p=0,031, OR=3,37,95% CI 1,03-11,02).Оценка вклада полиморфизма генов медиаторов иммунного ответа вформирование предрасположенности к персистирующему олигоартикулярномуварианту ЮИАПо результатам молекулярно-генетического анализа полиморфного локусаLTA rs909253 было установлено, что при персистирующем олигоартикулярномварианте ЮИА генотип LTA rs909253*GG встречался существенно чаще, чем вконтрольной группе (15,31% против 7,89% соответственно, p=0,033, pcor=0,029,OR=2,108, 95% CI 1,094-4,152) (Таблица 6).