Глик, Пастернак - Молекулярная биотехнология - 2002 (947307), страница 171
Текст из файла (страница 171)
Нуклеаза Я! (В! ппс(еаза) Фермент, специфически де- граднрующий одноцепочечную ДНК. Нуклеозвд (!х!пс)еоыйе) Пуриновое или пирнмиднновое азотистое основание, ковалентно связанное с пятиуглеролным сахаром (пснтозой). Если сахаром является рибоза, то мы имеем дело с рнбонуклеозидом, а сели дсзоксирнбоза, то с дсзоксирибонуклеозидом. Нуклеотид ()х(пс)евое) Нуклеозид, к которому присоединена одна илн более фосфатных групп; присоединение происходит по 5'-углеродному атому сахарного кольца.
Нуклеозиды, связанные с рибозой, называкгтся рнбонуклсозидмонофосфатами (г(ЧМР), рибонуклеозидднфосфатамн (г(ЧОР) или рибонуклеозидтрифосфатами (г)х!ТР). Для нуюгсозидов, связанных с дезоксирибозой, соответствующие названия таковы; дезоксирибонуклеозидмоно-, ди- и трифосфаты (г)(»! М Р, г!)ч О Р, гй«ТР). )х1-конец (~ !егш1пш) Первая аминокислота (или несколько аминокислот) в белковой молекуле. Обратная траискрнптаза (Кетегзе Цвпвсг!Р(аяе) РНК- зависимая ДНК-полимераза, использующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплемснтарной цепи ДНК. Обратная транскрипции — полимеразная цепная реакция (Кетегзе гтапзсбрйоп — ра1ушегазе сйщп геас!юп) Способ получения в большом количестве кДНК, состояц~ий из двух этапов.
Вначале ш И!го сиьпезирук»т кДНК, используя обратную транскриптазу, мРНК в качестве матрншя и ойдо(г!Т) в качестве праймера. Затеи кДНК амплифицируют с помощькг полимеразной цепной реакции (ПЦР), используя два праймера: олин комплементарен участку первой цепи кДНК, а второй — другой пенн, комплементарной первой. Одиоцепочечный разрыв (Рйс1г) Разрыв фосфодиэфирной связи между соседними нуклеотидами в одной цепи ДНК. Словарь терминов 555 Опрашивание по Грану (б>аю агап) Метод окрашиаання микробиологических препаратов, пазноляюший идентифицировать две группы бактерий: грампалажитсльные н граматрицательныс.
Оснонан на различии биохимического состава мембран бактериальных клеток. Олин>иуклеагид, олигомер (Оййопвс1ео(Ые) Короткий (б — 10 нуклсотидон) сегмент одноцспочечной ДНК. Обычно гюлучают химическим путем, Оикозеп (Опсойепе) Гсн, экспрессия которого привалит к неконтролируемой пролиферации (трансформации) клеток. Оператор (Орегагог) Участок ДНК, непосредственно примыкающий к структурному гену и регулирующий его транскрипции> при участии репрессора или активатора. Оперон (Орегон) Участок ДНК, содержащий несколько структурных генон, транскрибируемых с образованием одной пз>лицистронной мРНК.
Онии (Ор!пе) Продукт конденсации аминокислоты с кстокнслотой и сахаром. Оптимизация водопое (Со>Ь>п орйпвха1юп) Модификация колонов данного гена без нзмснсння аминокислотной гюследовательнасти копируемого им белка, направленная на то чтобы колоны эффективно считывались хозяйским орган измом. Отлгпг (Аппеа1ЫИ) Процесс образования двукцепочсчных молекул (ДН К вЂ” ДНК или ДНК вЂ” РНК) из олиночных полинуклсотидных камплсментарных цепей.
Открытая рамка считывания (Орел гааз))пй Гга>ве) Пс>слсдовательность нуклсотилон, не содержащая терминирующих колонов; кодирует полипептид или белок. «Озиечаток пальцев» (П!ЧА ззпйегрг!п1) Набор рестрикционных фрагментов ДНК, характсрнын для данного индивидуума. Для получения «отпечатка» используют либо гель-электрофорсз как таковой, либо в сочетании с (1 ЦР-амплнфикацией. Опвлкнваиие (Верпййоп) Конфигурация, при которой дна мутантных неаллельных гена находятся на разных хромосомах. Аналогично транс-конфигурации.
Си. тиклге Сопряжение. Пакующая клеточная линия (Расйай!пй сей Ипе) Клеточная линия, созданная для продуциронания вирусных частиц, не содержащих инфекционной нуклсиноной кнслазз>ь Палиндром (Ра!!пз)гоше) Учасзок двухцспочечной молекулы ДНК, обе цепи которого обладают одинаковой нуклеотидной последонательностьк> при прочитывании от 5'- к 3'- концу. Такие участки часто распознаются рестрицнрузощими энлонуклсазами типа 1!. Параспоральный кристалл (Рагаарога( сгуз(а)) Плотно упакованные молекулы токсина, синтезирусмые Влезу!из зйлг>ллзецзй прп образовании спор. Пассивный иммунитет (Разике 1ввппп!зу) Форма иммунитета, возникающая при введении в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате актияной иммунизации. Наблюдается также у новорожденных.
Патагенез-зависимый промотор (Ра1Ьойепеа)з-ге1а1ез) ргопзо1нг) Промотор растительных генов, акпзвизируемый при инфицировании растения патогснами. Пепетраптиость (Репе!галсе) Частота проявления данного аллеля в группе родственных организмон. При полной пенстрантности наблюлается проявление аллеля у нссх членов выборки. Пептяд (Рер1Ые) Короткая цепочка аминокислот, со- единенных пептилными связями. Пептиавл-тРНК (РерзЫу)-1И)>(А) Молекула тРНК с нри- саслиненной к ней растущей полипептидной цепью. Пезгпщная аакппиа (Рерййе зассюе) Короткая цепочка из аминокислот, индуцирующая образование антител к специфическому инфекционному агенту. Пептялзюя связь (Рер(Ые ЬзпЫ) Ковалентная связь между сноболнай карбоксильной группой при и-углсродном атоме одной аминокислоты и свободной карбоксильной групгюй при таком жс атоме соседней аминокислоты в полипсптидной цепи.
Первичная культура (Рпюагу свйпге) Культура клеток или тканей, взятых непосредственно от организма. Первичный трапскрипт (Рппюгу 1гапаспр1) Молекула РНК, транскрибиронанная с эукариотического структурного гена и нс подвергшаяся процессингу (т.е. содержащая все экзоны и интроны). Первое аптитело (Рппюгу апИЬоду) Антнтело, связывающееся с молекулой-мишенью при проведении иммунологического анализа (например, с помощью метода Е(.!БА). Периодическая ферментация (Ва1сЬ (еппепгабоп) Культивирование лзикроорганизмов н течение ограничен- 55б Словарь терминов ного интервала времени.
Свежук> среду инокулиру>от посевным ь>атерналом и проводят культивирование в непрерывном режиме, не добавляя новых порций среды и не удаляя продуктов, пока процесс не завершится сам собойх Периодическая фермеитация с лвбавлеинем субстрата (Ред-Вагсб (еппеп1абоп) Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени с псриоличсскнм добавлсним субстрата и сбором продукта только по завершении процесса. Перши>азмагическое пространство (Репр1азпшбс зрасе) Пространство между плазматической мембраной бактериальной клетки и наружной мембраной илн клеточной стенкой. Пиримндниы (Руйпдд1пе) Один из лвух типов азотистых оснований, входящих в сосгав нуклеиновых кислот; к пиримилинам относятся тимин, цитозин и урания.
Второй тип оснований — г>урины; к ним относя >ся аденин и гуанин. Пирогеи (Ругояеп) Вещество, пролуцируемое бактериями и вызывающее повышение температуры у человека. Плазмц>ш (Р(азшЫ) Внсхромосомный генетический элемент, способный к длительному автоно>лному сущсствовани>о и рспликации. Обычно это двухцепочечная кольцевая ДНК длиной 1 — 200 т.п.н. Плазмцла-помошник (Не1рег р(азшЫ) Плазмида, восполняю>цая функции друц>В плазмиды в той жс клетке. Нскоторыс плазмилы-помощники способствук>т переносу неконъюгатнвных плазмил из донорной ктстки в реципиентнук>. 2 мкм-плазмшш (2 рш р!аапдд) Сушесгвув>щая в природных условиях двухцепочечная кольцевая плазмида длиной б3!8 п.н., обнаруженная в ядре 5асс>>агав>>вез сете>дггае.
На сс основе получены многие ила>мидия>е векторы для дрожжевых клеток. Плазмидпая несовместимость (!>(азш!д !псошрайЬ!1Ву) Механизм регуляции числа копий плазмид одного типа в бактсриальнг>й клетке. Обеспсчивает невозможность внугрикчеточного сосуншствования плазмид, принадлежащих к одной группе совместимости. Плазмовирус (Р)азшот(гвз) Генетическая конструкция, которая содержит рстровирусные гены, находящиеся пол контролем 5'-1.ТК-промотора, а также атерапевтичсскн!га ген и ген елц управлясмыс цитомсгаловнрусным промотором. Пластнда (Р(азг)д) Органелла растительных клеток (например, хлоропласт). Многие пластиды имекп собственный геном.
Подвид (ВаЬзр>вс)ез) Группа в прелелах вида, облалающая признаками, не характерными для остальной части членов популяции данного вила. Позитивная регуляция (РоЫйте соп(го1) Тип регуляции, при котором регулируемый ген транскрнбирустсл только в присутствии белка-активатора. Позитивно-негативный агбар (Ропоте-пебабте ае1есбоп) Методика, при которой одновременно происходит отбор клеток, несущих вставку в специфическом хромосомном сайте (позитивный отбор), и «отбраковка» клеток, несущих вставку в другом, нсспсцифичсском сайте. Позитивный отбор (Ров!Вуе ае1есйоп) Отбор клеток по натичию в них марксрного гена, благоприятствующего росту на селективной срелс (напримср, среде с антибиотиком).
Позиционное картироваиие (РоЫВопа! яепе с(оп!пя) Одна из стратегий идентификации гена заболевания в отсутствие ланных о продукте этого гена и каких-либо генов-кандидатов. В подобных случаях сначала опрсдсляк>т хромосомную локализации> (позицию) гена. Затем получая>т гсномные клоны, охватывающие картированный сайт (используя соответствующие маркеры), идентифицируют н анш>изируют присутствующие в них экзоны.
Используя целый ряд л>столов (идентифнкация ОС-островков, улавливание экзонов, секвенированис, компьютерный ацш>из и т.д.), оцрслеляют, какой именно ген ответствен за данное заболевание. Позиционно-кацдидатное иартироваиие (Роз!11ова1-саад!даге депе с!оп(пб) Олна из стратегий идентификации гена заболевания, когда данные о пролуктс этого гена отсутствуют, но ген картирован ятом жс хромосомном районе, что и уже идентифицированные гены и ЕВТ, Сначала анатизиру>от соврсмепныс генетические и транскрипционныс карты, с тем чтобы выявить кодирующис последовательности (гены, внугригсниыс ЕЯТ), находящиеся в этом районе, затем с помощью му>ационного анализа или какими-либо другими методами выявляют экзоны, связанные с данньпл заболсванием.
Полиаденнлироваиие (Ро1уадепу!а(1оп) гцер>аснтативнос присоединение остатков адснина к 3'-концу молекулы эукариотичсской мРНК. Этот богатый адснинолг 3'-конец называется ро!у(А)-хвостом. Словарьтерминов 557 Полнаалентная вакцина (Мп1буа!епг гасс$пе) Вакцина, дяощая иммунный ответ на несколько инфскпнонных агентов илн на разные эпигоны одной молекулы. Поликетндсинтаза (Ро11$«ег!$$е зупгйазе) Фермент, участвующий в биосннтезе поликетидных антибиотиков. Поликетидные антибиотики (Ро1у1«еййе апг!б!ог!сз) Класс антибиотиков, которые образуются в результате последовательной ферментативной конденсации карбоновых кислот (ацечата, пропионата и тш.).
Полилиикер (Ро!у!п$$«ег) Короткий участок ДНК, содержащий несколько уникальных сайгон узнавания для эндонухлсаз; в этн сайты встраивают чужеродную ДНК (осуществляют клонирование). Полимеразная цепная реакция, ПЦР (Ро1уюегазе сйагп геасйоп) Метод амплифнкации специфического сегмента ДНК с помощью тсрмостабильной ДНК-полнмсразы с нсполщованисм олигонуклеотидных ДНК- зондов, комплсментарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим амплифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии цикчичсски повторя$ощихся реакций: деначурацни Д НК, отжига зоилов, синтеза ДН К.
Полиморфизм длины рестриционных фрагментов, ПДРФ (Кез$гюйоп (гайпчепг(епйгй ро!ущогрЫяп; йН.Р) Вариабельность длины фрагментов ДНК, образующихся при се расщеплении рестриктазами. Обусловлена мутационным изменением сайтов рестрикции или появлением новых сайтов. Обнаруживается при разделении фрагментов с помощью гель-элсктрофорсза. Полиморфизм коротких тандемных повторов, ВТ)(Р (Яюгг гапйеш гереа1 ро1упюгрйгяп) Вариабельность блоков из тандемных ди-, три- или тетрануклеотидных повторяющихся элементов по числу этих элементов при частоте астречасмосги блоков в большой популяции не монсе !% ЯТВР-покусы выявляют с поглочцью гсль-электрофореза после проведения ПЦР с использованием праймсров, комплсмснтарных уникальным послсловатсльносгям, фланкирующим данный локус.