Knudsen - A Biologists Guide to Analysis of DNA - 2002 (522916), страница 2
Текст из файла (страница 2)
1п аг!йгюп, йеу Ьаче депегагег$11 — 20 гпыпагсЬ о!)доа (ММ), ччЫсЬ аге 1г!еп11са! го йе РМ о!)доа ехсерг 1ог йе сепгга1 родоп 13, гчЬеге опе ппс1еог1де Ьаа Ьееп сЬапдег! го Ьа сотр1егпепгагу пас)еог)г!е. Айутегг)х с!а!та айаг йе ММ о!1доа чу!11 Ье аЫе го г)егесг попарес10с апг! Ьас)гдгоипг! ЛуЬпйка11оп, вЫсЬ )а ппрог1апг Гог г)пап!11:у)пд вечеа!с!у ехргеааед тКЬ!Аа. Ноччечег, 1ог ъчеа1с!у ехргеааед тК)ч1Аа ччЬеге йе ядпа1-го-по!хе гаг1о ь япа11еаГ, апЬггасГ)пд тыпассЬ Ггот регХесг тагсЬ агЫа сопяг1егаЫу го ГЬе поье ш йе с!ага (ЯсЛаг!г, ег а! .. 2000). ТЬаг ь Ьесагье хпЬггас11пд опе поьу пшпЬег Ггот апойсг поьу пшпЬег у)е!<Ь а 1Л1гг! пшпЬег чч)й ечеп тоге по!хе.
ТЬе ЬуЬг)г!1ка11оп оГ еасЬ о!гдо Со Ка Сагдег г!ерепг)а оп 1Ь аес)пепсе. АП 11 — 20 РМ ойдоа Гог еасЬ депе Ьаче г)1!Тегепг пег!пепсе, ао йе ЬуЬпка11оп чу!11 пог Ье иш1опп. ТЬаг ь ог" по сопаег!пепсе аа 1опд аа чче ччьЬ го г!егесг оп1у сггалдег ш тКМА сопсепггаГюп Ьесччееп ехребгпепга. Ночч ьпсЬ а сЬапде ь са!си!а!ее! !Тот йе )пгепяпеа о1 йе 22 — 40 ргоЬеа 1ог еасЬ депеа чу!11 Ье сочегег! ш Бес!!оп 3.! . 1п огдег со дегесг ЬуЬг)йкаг1оп оГ а гагдег тКЬ)А Ьу а ргоЬе оп йе сЬгр, йе гагдег шКХА пеег!а го Ье 1аЬе1ег! гч)гЬ а !)иогосЬготе. Аа аЬоччп гп Р1диге !.3, йе агера йот се!1 го сЫр иаиа!!у аге аа Го)!оччя ° Ехггасг гога! КМА гогот се1! (папа!!у ияпд ТИко! ог КЫеаау !с!14). БРОГГЕО АВВАУЯ 7 Рг!и! М1сгоаггау Ргераге Яагпр1е сОССА! !Ъгагу ог Оаао РгоЬеь Тею Кесегепсе ф~ 1.аЬе! вгй а р!оогеьсепг Ьса ьс со ! хе\ НуЬгсд!хе м Бсап ~- ..1 Со ппсгоаггау Р!д.
1.4 ТЬе ьропед апау сесЬпо!оау. А гоЬос Ы пьес! со сгапь!сг ргоЬеь сп ьо1йюп !гот а ппсгойег р!асс со а а1аьь ь1Ые счЬеге сЬеу аге дпед. Ехсгассед псКГСА Ггопс сеаь Ы сопчегсед со сРХА апд !аЬе!ед ССпогеьсепс!у. хасар!е сь !аЬе!ед гед апд сопсго! Ы 1аЬе1ед агееп. Ааег ппхшд. йеу аге ЬуЬпйхед со йе ргоЬеь оп йе Х1аьь ь|Ые. Ааег юаьИпа ач ау ппЬуЬгЫсхед гпасепЫ, йс садр сь ьсаппед счссЬ а сопсосаС !аьег апд йс ппаае апа1ухед Ьу сопсросег. !Бее со1ог р1асе.) ° Орс)опа!: ьо1асе шКЬ!А Ьу ро!уА саП. ° Сопчеп со сГу1 !А ш йе ргеьепсе оГ АпипоаПу1-ЖТР !АА-сП)ТР).
° 1.аЬе1 чг11Ь СуЗ ог Су5 Ппогеьсепс с1уе 1ш1апа со АА-сй)ТР. ° НуЬпйхе !аЬе1ес! пЖЬ!А со д1ааа ь1Ыея. ° 'учаьЬ ппЬуЬг1йкес! шасепа! ачгау. ° Ясап а!Ые апд апа1уке ппаае. ТЬе адчапсаае сошрагес! со АГГушеспх бепеСЬ1рь ь ГЬас уоп сап с1еа1ап апу ргоЬе Гог ьроссша оп ЕЬе аггау. ТЬе с$1ьас1чапсаде ь ГЬас прог!)па ичП пос Ье пеаг! у аь ип1Гопп аь ГЬе сл,гсги аупсЬеякед АГГушеспх сЫрь апд сЬас ГЬе соус оГ оПаоь, Гог сЫрь сопса1пша сЬопьапда оГ ргоЬеь, Ьесошеь ЫаЬ. Ргош а дага апа1уьь рош! оГ ч1есч ГЬе шасп йГГегепсе ь ЕЬас сп ГЬе сЛЬ!А аггау гьпаПу ЬЬе ьашр1е апс1 сЬе сап!го! аге ЬуЬпйкес) со ГЬе хаше сЫР па!па ЙГГегепс НпогосЬгошеь, ччЬегеаь ГЬе АГГушеспх сЫР сап ЬапсПе оп1у опе НпогосЬгоше ьо ссчо сЫра аге гес)шгед со сошраге а аашр1е апд а сопсго1. ТаЫе 1.2 ьЬо л ь ГЬе сштепс регГоппапсс оГ йе про!се!1 апау сесЬпо1оду Вюнпу!а!ее СОМА С!саге нгдг апсааппа епаупге ГАВ) апд Ьгпд го анар!пега!па Ьена АААА ттттт ААААА ТП П ОАТС АААА Огпде Гп па!Ганн !Пасе го!гесаб А апд В~ СТАΠ— АААА 0 АТС ТПТТ С!саге юга оааагоа епгупге ГТЕ! та АВ таа ООАТОСТАОУУУУУУУУУ ССТАООАТСУУУУУУУУУ тр АВ таа ООАТОСТАОХХХХХХХХХ ССТАООАТСХХХХХХХХХ 1.Гян» апд апар1ггу н1дг ргнпеб Аапд В ГУ Онаа ббАТОСТАОХХХХХХХХХУУУУУУУУУСТАббАТСС ССТАООАТСХХХХХХХХХУУУУУУУУУОАТСбТАбб СТАОХХХХХХХХХУУУУУУУУУСТАСХХХХХХХХХУУУУУУУУУСТАСХХХХХХХХХУУУУУУУУУСТАС ОАТСХХХХХХХХХУУУУУУУУУОАТСХХХХХХХХХУУУУУУУУУОАТСХХХХХХХХХУУУУУУУУУОАТО Опаа Онаа Онаа Руд.
1.5 Бсйебта!сс брегу!ем ос БАОЕ Отса!ос)а сЬааес) оп 'ауессб!еасб, е! а!. )995). (Бее со!ог р!а!е.) ТЬе апа!уяа ОС'8АОЕ с1аса 1В япп1аг со сЬе апа!уаса ОГ апау с!ага ссеаспЬесс сЬгоиеЬ ош сЬГВ Ьоо1с ехсерс сЬас сЬе Всабапса) апа1уяа ОС' ядпйсапсе 1В ййегепс (Мап, ес а!., 2000; !.аВЬ, ес а!., 2000; Аис)10, ес а! о 1997). 1.5 ЕХАМРЕЕ: АРРЧМЕТВ1Х Ч8. 8РОТТЕЮ АЙВАЧ8 Оиг 1аЬ Ьаа 1п а со11аЬогабоп (КппсЬеп, ес а1., 2001) реФоппесс ЬосЬ с!)!УА аггау апа!уяа апс1 Айугпеспх СЬ!р апа!уяа ОК Ьшпап Т се!1В 1ОГессес) ъчсЬ Ншпап !тпшпоссеЬС)епсу Чсгпа (Н!Ч). Есаиге 1.б ВЬОУУВ тгт1УА ехггасгес) Ггот сЬе Т се!!В апсс Тыла)сгес) ичсЬ а Осу!УА апау. рсгас, сЬе шйЬСА Ураа СТА~ ААААА ЕЕ ОАТС ттттт ' СТАΠ— ААААА б АТС ТТТГГ ЕБ СТАΠ— — АААА О,О.С Т ПТГ ЕХАМР!.Е! АЕЕУМЕТЯ!Х УЕ.
$РОТТЕОАЯЯАУБ 5 ААААА ТПТГ -Ф\ ААААА ттпт-ю ААААА тп и'-на СТАС АААА И ОАТС ТТТТТ СТАΠ— — ААААА бАТС ТПТГ | С1еаге гога апсЬоппа епгупае 1ао1аге днааа Сопсагепаге апд с1опе Яд. 1.6 сГ|Г|А и|!сгоаггау о! аеас апас|си Ьу Н!Н ш|есиоп. (аее со!ог р|а|е.) сопчеггег) |о сРХА апг) йеп Ь чаа!аЬе!ед чч|Ь а ЛыогосЬгоше. Ч|ге паем а гег) ВиогосЬгоше !ог йе шКХА йа| ч ах ехггасгег) )гош йе Н!Ч-шГесгег) се!1а ! "ехреП|пеп|,*' "кашр1е," ог "|геа|шеп|") апг) ъче ыаед а дгееп ЙиогосЬгоше гог шгхХА йа| чаи ех|гас|е|1 йош йе поп!пКесгег) се!!а ("сои|гор *). Весаиае юе иаед г)!Ггегеп| ))иогосЬгошеа ч е соы!д арр!у Ьой аашр!е ап|1 соп|го1 |о йе ааше сЬ!р чЬеге че Ьаче а1геа|)у про!ге|) ргоЬеа !ог йе депеа ч е ч еге !пгегеагед )п.
Р!доге 1.6 аЬоч а |шсЬ депеа, Айег ЬуЬг!|1!айаг)оп апд чааЬ!пд, йе сЬ~р чаа асаппед апг! йе ыпаде ргосеааед Ьу а сошри|ег. Же сап поч |)е|)псе йе гапо Ьегвееп йе ехргеаяоп оГ еасЬ депе 1п Н!Ч-!пГесге|1 се11а апг) йе депе )п ып!пГесгед се!!а аа йе габо Ьегчееп йе ш|епя|у о! гег) апг) дгееп со1ог.
1Г йе со!ог ь уе1!оч, йеге 1а по сЬапде. !д п ь гей йеге ь ап иргеди!адоп; !Г и ь дгееп йеге ь а г)овпгеды!аг!оп (Р!доге 1.6). %е сап а!ао еяыпа|е шКХА сопсеп|габоп Ггош йе ш|епя|у о)'йе арог. %е гоо1 йе хаше шКЬ!А, ргосе|ьег) и, ап|) рш Ь оп ап Айушегг)х сЬ!р чп|Ь 6800 Ьшпап депеа. г)доге 1.7 аЬоч а раг| оГ йе аиг)асе оГ йь сЬ!р йа| ргоЬеа Гог)|ы опе депе. Ве)оге рышпд и оп йе сЬ|р, йе гпКХА чаи яиммлггч г г Р7и. 1.7 Рап оГ А!Гуле!г1Х СЬ1р РГОЬ1ПЗ опе депе а!Гессен Ьу Н!Ч !пГесбоп.
сопчеггег! го СОХА апс1 ап ш лгт !гапзспрЬоп згер ччаз изег1 со атрИу йе атоипс о!'трхХА. А1)ег 1гадтепгагюп апд !аЬе!шд чч!гЬ а !)иогезсепг ануе, йе затр1е ччаз ЬуЬгЫ)хег! го йе СЫр зигГасе ччЬеге а !оса! о~ 40 о11допис)ео!Ые ргоЬез о!' !епдй 25 аге изег! го г!есесг гЬе ргезепсе апд сопсепггаг!оп оГ еасЬ депе теззепдег. Тччеп!у о!!доз аге сЬозеп 1гот йгТегепг агеаз од йе депе.
ЕасЬ о1йезе о!1доз гз са!1ег! а рег1есг тагсЬ (РМ). Рог еасЬ РМ о!гдо йеге гз ап Ыепг!Са! о!!до чч!1Ь опе ппзтагсЬ аг йе сепгег роыг!оп о1 йе 25- тег. ТЬ)з т)ыпагсЬ (ММ) ойдо !з шс!ис1ес1 со согпрепзасе 1ог попзрес!г1С ЬуЬгЫ!хаг!оп аз чче11 аз сгозз-ЬуЬгЫ1хаг!оп. 1п Р1диге !.7 йе РМ о1!доз агЫ ММ о!!доз аге зЬоччп оп гор од еасЬ ойег.
Хосе йаг Айутегпх с$оез по! изе а гччо-со1ог зузгегп, зо чче Ьаче со пш опе СЫр 1ог йе загпр1е апд опе сЬ)р Гог йе сопсго1. ТЬе сопйг!опз Гог сотраппд йозе гччо СЬ)рз чч!11 Ье дезспЬег! ш а 1асег зесг!оп. 1.6 80ММАВУ Яро!гег! ап ауз аге таг!е Ьу дероз!г!оп оГ а ргоЬе оп а зо! Ы зирроп. А1Тугпегпх СЫрз аге шаде Ьу 118Ьг таз1с сесЬпо!оду. ТЬе !аггег гз еаз)ег го сопсго1 апг$ йеге1оге йе чаг!аг!оп Ьегччееп СЫрз гз ыпа!1ег ш йе !акег гесЬпо1оду. Ярос!ег$ атауз ойег пюге 1)ех1Ь1!!гу, Ьовечег.
Оага апа!уяз г!оез пог <Наг пшсЬ Ьегччееп йе гччо !урез о1 аггауз. Яепа! апа1уяз о1' депе ехргезыоп (ЯАсгЕ) !з уег апойег тегЬог1 1ог апа!ух!пд йе аЬипдапсе о1 тгхХА Ьу зег!иепс!пд сопсагепагег! Ггадтепгз о1 йе!г соггезропйпд СОМА. ТЬе пигпЬег о!' йпез а СОХА 1:гадтепг оссигз ш йе сопсагепагег! зег!иепсе гз ргорогг!опа! со йе аЬипг!апсе о!' Ьз соггезропйпд гпеззепдег. Р!диге 1.8 зЬоччз а зсЬетаг!с очегч!ечч оГ Ьочч опе згаггз чч!1Ь се!1з 1п гччо сИТегепг сопйг)опз (чч!1Ь апет ичгЬоиг Н!Ч Ыгиз, 1ог ехатр!е) апд еаза)з ир чч!1Ь трсХА 1гот еасЬ сопг!!г!оп ЬуЬгЫ1гед го а ОХА аггау.
А!зо зЬоччп !з а !гас!!г!опа! арргоасИог зрогг!пд Й1Тегепсез ш трсХА роро!агюпз, йфегепгга! йзр1ау, ТЫз тейод, ччЬ)СЬ геУез оп де! е1ес!горЬогез!з о1' гас!!о!аЬ!ес! 1гадтеп!з, д!чез оп! у а г!иа!!гаг!че аззезыпепг од ййегепсез 1п тРСХА ехргезяоп апг! Гог йа! геазоп а чч111 по! Ье сочегег) 1иггЬег ш й|з Ьоо1с. уг ытпоэистюи Нпгпап Т се!! Ншпап Т се!! аечегае ггапаспргюп Регегае папхспрг1оп СОХА СОХА аге!у ! 1)уттегеп!1а1 Р1ар1ау ау уи Р1гго ТгапаспрГгоп 1л Рагс Тгапаспргюп сРМА аттау АйууПЕ!Т1Х СгЕПЕСЫр Айутпе!Тух хуепеСЬур р!П.
П8 Очегг1еч ог" пгесаог!а гог согпраппд гпгхМА роро!ааопа !п се!!а ггопг гаго г!11Тегепг сепг!!1!опа. (Бее со!ог р!а1е.) 0 КМА ехпаспоп сйХА Егарпепг апо 1аЬе!, ЬуЬпхахе го апау Спг гг 1аЬе! апо пг 1.аЬ апо' го а ОО е Н!У Р.ХА ехггасаоп — саХА Ргарпепг апг! 1аЬе1, ЬуЬпхахе го апау вивтнпв впгтоутчв гз 1.7 Р1)гаТНЕй !г1ЕА0!р)аа Кппг!аеп, Я., Х!е1аеп, Н.В., Ь!!е1аеп, С., ТЫгаппр, К., В1ош, М., ВПсЬепгкРоптеп, Т., бапПег, 1., гогот)апап, С., апг! Вгппа)г, 8. (2001). Т сеП ггапаспрг!опа! гекропаеа го Н1Ч !пуесг!оп !и чего. Маппаспрг ш ргерагаПоп.