Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1145732), страница 5

Файл №1145732 Автореферат (Разнообразие бактерий в пелагической и придонной зонах пресноводного антарктического озера Радок (оазис Эймери)) 5 страницаАвтореферат (1145732) страница 52019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 5)

Изолят R100B/2 не показал родства ни с другими изолятами, ни склонами 16S рДНК и оказался конспецифичным M. marchantiae.Clone 37R-7Uncult clone (JQ906004)Uncult cloneRhodovarius lipocyclicus (NR 025629)Roseomonas frigidaquae (NR 044455)Clone R6-18αClone R2007-5Mesorhizobium loti (NR 074162)Clone 17R-29Limnohabitans planktonicus (FM165535)R367B/3A cultured clone Pseudomonas azotoformans (JF792088)Acinetobacter calcoaceticus NR 117619/oleivorans (NR 102814)R367B/34-12 cultured cloneR367B/34-9 cultured cloneDesulfomicrobium hypogeium (AF132738)Clone R6-2βproteobacteriaUncult clone (HM129675)R100B/2 cultured clone Methylobacterium marchantiae (AB698714)R13B/21 cultured clone Brevundimonas intermedia (NR 041966)R367B/1A cultured clone Brevundimonas vesicularis (FM955876)γδUncult clone (HQ120615)Clone R6-8/Uncult clone (DQ521525)Clone 0R-16 acI-AIV cladeCandidatus Planktophila limnetica (FJ428831)Clone 0R-2 acI-AVIClone R6-16 unidentified cladeClone 17R-1Mycobacterium pyrenivorans (NR 028970)R367B/33 cultured clone/Arthrobacter agilis (AJ577725)R367B/35 cultured cloneActinobacteriaIlumatobacter fluminis (NR 041633)Microbacterium phyllosphaerae (NR 025405)Clone f3R-35Sediminibacterium salmoneum (NR 044197)Chitinophaga sancti (AB078068)BacteroidetesClone 0R-11Uncult clone (AB660888)Clone 3R-7Uncult clone OD1 (FR848763)Uncult clone (AY922093)OD1Clone 37R-35Algisphaera agarilytica (AB845176)Clone 17R-18Uncult clone (HM127289)Blastopirellula marina (NR 029226)Clone 17R-2Singulisphaera rosea (FN391026)Uncult clone (KF827382)PlanctomycetesUncult clone (HM446087)Clone 17R-13Schlesneria paludicola (NR 042466)0.05Рис.

7. Филогенетическое дерево, показывающее родство выявленных доминантныхбактериальных филотипов и культур с ближайшими родственниками, включая ДНК-клоны, вGenВank. Дерево построено методом ML, число последовательностей – 50, количествофилогенетически информативных сайтов – 356, количество бутстрэп-репликаций – 500.Культуры и филотипы выделены полужирным шрифтом17Значимые находки, имеющие отношение к холодным местообитаниям.Изолят R367B/33 показал близкое родство на уровне вида (99,6 %) с A. agilis.Штаммы этой бактерии были выделены как из осадков Северного Ледовитогоокеана (Yuan et al., 2014), так и из придонных матов некоторых озер,расположенных в Сухих долинах Антарктиды (Rojas et al., 2009).

Изолят R367B/1Aоказался конспецифичным (100 %) штамму B. vesicularis, выделенному изседиментов тающего арктического ледника на архипелаге Шпицберген (Reddy et al.,2009). Единственный из β-протеобактерий филотип 17R-29 был идентифицированкак L. planktonicus. Данный штамм был выделен из пресноводного мезо/эвтотрофного резервуара в Чехии (Kasalický et al., 2010). Выявленный намифилотип f3R-35 оказался конспецифичным (99 %) S.

salmoneum NJ-44T,выделенному из осадков эвтотрофного резервуара в Пекине (Qu and Yuan, 2008).Из эукариот филотип 31R-8 оказался конспецифичным (99,6 % сходства с 18SрРНК) зеленой водоросли M. huancayensi, обнаруженной в оз. Уанкайо, Перу(Krienitz et al., 2011). Филотип 17R-9 был родственен (99,9 % сходства с мтДНК)с пресноводной водорослью N. limnetica.

Штаммы N. limnetica были выявленыв холодном антарктическом оз. Бонней, Сухие долины (Bielewicz et al., 2011),а также в оз. Байкал (Fietz et al., 2005).ЗАКЛЮЧЕНИЕНесмотря на однородность физико-химических параметров, в водном столбеоз. Радок наблюдали выраженную микробную стратификацию как на уровнефилумов – отделов, так и филотипов, в особенности в верхнем и нижнемгоризонтах. Так, Planctomycetes, Viridiplantae и Bacteroidetes были выявлены тольков верхнем и нижнем горизонтах, тогда как класс β-proteobacteria – только в верхнем,а δ-proteobacteria и OD1 – только в нижнем.

Большее микробное разнообразие вверхнем горизонте, в сравнении с глубинами 100 и 200 м, по-видимому, связано сотносительной доступностью солнечной радиации, что благоприятно для развитияпервичных продуцентов и построения элементарных трофических цепочек.Нижний горизонт, близкий к водным осадкам, судя по наличию большого числауникальных филотипов, обладает собственным автохтонным микробнымсообществом.Всего было выявлено 40 филотипов (20 доминантных), принадлежащихпяти филумам бактерий: Actinobacteria, Proteobacteria (α, β и δ), Bacteroidetes,Planctomycetes, OD1, Verrucomicrobia, а также четырем отделам эукариот:Dictyochophyceae, Xanthophyta, Chrysophyceae и Viridiplantae. Из них 33 филотипапоказали ≤ 98 % сходства с ближайшими видами из GenBank и тем самым былиотнесены к новым неизвестным видам микроорганизмов, тогда как 14 филотипов(≤ 90 % сходства) остались неидентифицированными.

Из бактерий превалировалипредставители Actinobacteria. Из них во всех четырех горизонтах преобладалагруппа из трех филотипов, родственных Candidatus P. limnetica. Из эукариот –P. minor (Viridiplantae). Вместе с тем, несмотря на гетерогенность водного столба,доминантные филотипы в горизонтах 100 и 200 м полностью совпали с филотипами,выявленными в верхнем и нижнем горизонтах, кроме одного (R2007-5),идентифицированного нами как Mesorhizobium loti.Сравнение микробного разнообразия, выявленного на основе двух областей(v3–v5 и v4–v8) гена 16S рРНК, показало существенное различие как на уровне18филумов, так и на уровне филотипов. Так, для v3–v5 были выявлены филум OD1 икласс δ-proteobacteria, тогда как для v4–v8 – Planctomycetes, класс β-proteobacteriaи мтДНК страменопилов.

Это указывает на недостаточность использования дляхарактеристики микробного разнообразия только одной области гена 16S рРНК,амплифицированной с любыми из известных универсальных праймеров.ВЫВОДЫ1. В антарктическом пресноводном оз. Радок молекулярно-филогенетическимиметодами путем секвенирования трех различных областей генов 16S рРНК(водный столб и исток р. Межозерной) выявлено микробное разнообразие(34 филотипа бактерий из шести филумов, а также шесть филотипов эукариот(зеленые водоросли и страменопилы). Тридцать три филотипа оказалисьновыми неизвестными видами, 14 филотипов – неидентифицированными.2.

Группа из трех филотипов, близкородственных Candidatus Planktophilalimnetica из Actinobacteria, оказалась наиболее доминирующей во всехизученных горизонтах озера.3. Секвенирование как минимум двух областей (v3–v5 и v4–v8) генов 16S рРНК,амплифицированных в ПЦР, позволило полнее охарактеризоватьбактериальное разнообразие в оз. Радок.4. Бактериальный состав водного столба оз. Радок стратифицирован, несмотря наоднородность физико-химических характеристик.5. Для культивирования бактерий филума Planctomycetes из оз. Радокиспользованные условия оказались непригодными.СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИПубликации в изданиях, рекомендованных ВАК1. Карлов Д.

С., Мари Д., Чувочина М. С., Алехина И. А., Булат С. А. Микробноесообщество водной толщи озера Радок (Восточная Антарктида) с доминированиемактинобактерии “Candidatus” Planktophila limnetica // Микробиология. – 2011. –Т. 80. – № 4. – С. 571–574.2. Karlov D. S. et al. Microbial Communities within the Water Column of Freshwater LakeRadok, East Antarctica: Predominant 16S rDNA Phylotypes and Bacterial Cultures // PolarBiology. – 2016. – DOI: 10.1007/s00300-016-2008-9.Публикации в других изданиях3. Карлов Д.

С., Чувочина М. С., Алехина И. А., Булат С. А. Психрофильныемикробные сообщества в озере Радок, Восточная Антарктида // 1-я Всероссийскаянаучная школа-конференция по астробиологии: «Астробиология: от происхожденияжизни на Земле к жизни во Вселенной». Пущино, 16–19 сентября 2012. – С. 166.4. Karlov D., Marie D., Chuvochina M., Alekhina I., Bulat S.

Microbial Diversity within theWater Column of Freshwater Lake Radok, East Antarctica // 14th International Symposiumon Microbial Ecology. Copenhagen, Denmark, 19–24 August 2012. CT31.5. Karlov D., Marie D., Chuvochina M., Alekhina I., Bulat S. Significant MicrobialStratification of Water Column of Freshwater Lake Radok, East Antarctica with Dominanceof Actinobacterium “Candidatus” Planktophila limnetica // CAREX Conference on Life inExtreme Environments. Dublin, Ireland, 18–20 October 2011.6.

Karlov D., Chuvochina M., Alekhina I., Bulat S. Microbial Diversity of Water Column ofFreshwater Lake Radok, East Antarctica // The 4th International Conference on Polar andAlpine Microbiology. Ljubljana, Slovenia, 4–8 September 2011. – P. 107..

Характеристики

Список файлов диссертации

Разнообразие бактерий в пелагической и придонной зонах пресноводного антарктического озера Радок (оазис Эймери)
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6392
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее