Семинар (1) (1123614), страница 2
Текст из файла (страница 2)
Тиаминпирофосфат - коферментреакциидекарбоксилирования.Образованиеэтанола:алкогольдегидрогеназная реакция. Судьба этанола в печени и эпителиижелудка.Окисление пирувата до ацетил-СоА - первая стадия дыхания.Пируватдегидрогеназный комплекс (ПДК) как мультиферментная система:ферменты (в том числе и регуляторные) и коферменты (тиаминпирофосфат,липоевая кислота, FАD+, NAD+, кофермент А) ПДК, пространственнаясборка.1)Пируватдегидрогеназнаяреакциякакпримертиаминпирофосфатзависимогоокислительногодекарбоксилирования:строение фермента, механизм реакции.
2) Дигидролипоилацетилтрансфераза:строениефермента,образованиеацилтиоэфира.3)Дигидролипоилдегидрогеназная реакция, строение фермента. Регуляция ПДКчерез регуляторные ферменты – киназу пируватдегидрогеназы и фосфатазуфосфопируватдегидрогеназы (прямая, аллостерическая - субстратами ипродуктами, непрямая - через обратимое фосфорилирование, ионами Са2+).Природа необратимости превращения пирувата в ацетил-СоА. Суммарноеуравнение реакций, катализируемых ПДК.Цикл ди- и трикарбоновых кислот (цикл Кребса): локализация, общаясхема и последовательность реакций. 1) Образование цитрата, основныесвойства цитратсинтазы.
2) Образование изоцитрата, основные свойствааконитазы. 3) Изоцитратдегидрогеназная реакция как пример Ме 2+зависимого декарбоксилирования (1-е декарбоксилирование в цикле Кребса):основные свойства изоцитратдегидрогеназы, ее регуляция. 4) αКетоглутаратдегидрогеназный (α-КДК) (2-е декарбоксилирование в циклеКребса (тиаминпирофосфатзависимое, окислительное)); сходства и различияПДК и α-КДК. 5) Сукцинил-СоА-синтетазная реакция как пример реакциисубстратного фосфорилирования, основные свойства фермента (другиепримеры субстратного фосфорилирования).
6) Сукцинатдегидрогеназнаяреакция: локализация фермента, FAD как кофермент реакции. 7) Гидратацияфумарата, основные свойства фумаразы. 8) Малатдегидрогеназная реакция:обратимость реакции, ее направление в клетке, кофермент. Общаястехиометрия цикла Кребса и окислительного декарбоксилированияпирувата. Обратимые и необратимые реакции цикла Кребса.
Регуляция циклаКребса. Субстратное обеспечение цикла Кребса (анаплеротические реакции).Взаимосвязь цикла Кребса с другимиметаболическими путями.Биологическая роль цикла Кребса. Глиоксалатный цикл как модификацияцикла Кребса у растений и микроорганизмов.Перенос восстановительных эквивалентов в виде NADH из цитоплазмыв матрикс митохондрий: глицерофосфатный и малатаспартатный челноки.Анаэробные превращения углеводов. Превращение углеводов в печени.Роль фосфорных соединений в метаболизме углеводов. Реакцииобразования фосфорных соединений с высоким потенциалом переносафосфорильных остатков на примере реакций метаболизма углеводов.Представители основных классов ферментов на примере реакцийметаболизма углеводов.ЛИТЕРАТУРА1. Ленинджер А. Основы биохимии.
тт. 1-3, М., Мир, 1985.2. Нельсон Д., Кокс М. Основы биохимии Ленинджера. Том 1-2. Основыбиохимии. Строение и катализ. М., Бином. Лаборатория знаний, 2011.3. Lehninger, Nelson, Cox / Ленинджер, Нельсон, Кокс - Lehninger Principles ofBiochemistry 5th Fifth Edition / Биохимия по Ленинджеру 5 изд. (2008)4. Lehninger A.L., Nelson D.L., Cox M.M. Principles of biochemistry. N.-Y.,1993. http://www.bioinfo.org.cn/book/biochemistry 2 изд.5. Garret R.H., Grisham C.M.
Biochemistry. 2005.6. Биохимия. Учебник для ВУЗов под ред. Е.С. Северина, М., ГЭОТАРМедиа, 20057. Страйер Л. Биохимия. тт. 1-3, М., Мир, 1985.8. Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. М., Медицина, 1998.9. Комов В.П., Шведова В.Н. Биохимия. М., Дрофа, 2008.10.Марри Р., Греннер Д., Мейес П., Родуэлл В. Биохимия человека. М.,Мир, 1993.11.Эллиот В., Эллиот Д. Биохимия и молекулярная биология.
М., МАИКНаука/Интерпериодика, 2002.12.Кольман Я., Рем К.-Г. Наглядная биохимия. М., Мир, 2000.13.Бохински Р. Современные воззрения в биохимию. М., Мир, 1987.14.Степанов В.М. Молекулярная биология. Структура и функции белков.М., Высшая школа, 1996.15.Диксон М., Уэбб Э. Ферменты. тт. 1-3, М., Мир, 1982.16.Уайт А., Хендлер Ф., Смит Э., Хилл Р., Леман И.
Основы биохимии. тт.1-3, М., Мир, 1981.ФОРМУЛЫ К СЕМИНАРАМКурсивом выделены названия соединений, структуру которых нужнопредставлять, но знать наизусть необязательноФОРМУЛЫ К СЕМИНАРУ №11. Моносахариды: триозы (глицеральдегид и дигидроксиацетон),тетрозы (эритроза, треоза), пентозы (рибоза, дезоксирибоза,рибулоза, ксилулоза), гексозы (глюкоза, фруктоза, манноза,галактоза), гептозы (седогептулоза)2. Глюкозамины, маннозамины, галактозамины и их ацетильныеПроизводные3.
Мурамовая и N-ацетилмурамовая кислоты, Nацетилнейраминовая (сиаловая) кислота4. Дисахариды: мальтоза, изомальтоза, сахароза, лактоза,целлобиоза.5. Полисахариды: гликоген, крахмал, целлюлоза, хитин.ФОРМУЛЫ К СЕМИНАРУ №21. 3-Фосфоглицериновый альдегид, 1,3-фосфоглицериновая кислота,2,3-фосфоглицериновая кислота, фосфоенолпируват, пируват,лактат, оксалоацетат, малат2. Никотиновая кислота (витамин РР), никотинамид, NAD+-NADH,NADP+-NADPH; биотин (витамин Н) - биоцитин3. АМР, сАМР, АDР, АТР, cGMP, GTP, UTP4.
UDP-глюкоза, UDP-галактоза5. Катехол, норадреналин, адреналинФОРМУЛЫ К СЕМИНАРУ №31. Никотиновая кислота (витамин РР), никотинамид, NAD+-NADH,NADP+-NADPH; тиамин (витамин В1) - тиаминпирофосфат;пантотеновая кислота (витамин В3) - кофермент А; рибофлавин(витамин В2) -флавинмононуклеотид – флавинадениндинуклеотид;липоевая кислота; убихинон; аскорбиновая кислота (витамин С)2. 6-Фосфоглюконолактон, 6-фосфоглюконат, рибозо-5-фосфат,рибулозо-5-фосфат, ксилулозо-5-фосфат3.Оксалоацетат, ацетил-СоА, цитрат, изоцитрат, α-кетоглутарат, сукцинат,сукцинил-СоА, фумарат, малат.