Лихорадка долины рифт

         Rift Valley fever (англ.); Rifttalfieber (нем.); Fierve de la Vallee du Rift (франц.)

Лихорадка долины Рифт (ЛДР) - энзоотический гепатит рогатого скота - пре­имущественно остро протекающая болезнь овец, коз и КРС,людей, передающаяся членистоногими и характеризующаяся лихорадкой, некротическим гепатитом, гастроэнтеритом, геморраги­ческим диатезом и высокой смертностью телят и ягнят. У взрослых животных болезнь про­является абортами.

          Распространение. ЛДР зарегистрирована в Кении (в долине Рифт), Уганде, ЮАР, Родезии, Судане, Анголе, Мозамбике, Нигерии, Экваториальной Гвинее. В странах Африки периодически протекает в виде эпизоотии с поражением людей. Например, в 1977 г. во время вспышки заболевания в Египте заболело 200 000 людей, из которых 600 погибло. Особенно выделялась массовостью поражения эпизоотия ЮАР, вызвавшая гибель более 200000 животных, а также заболевание более 30000 человек.

ХАРАКТЕРИСТИКА ВОЗБУДИТЕЛЯ

Вирусную природу болезни доказали в 1931 г. Доубней и Гудзон. Они выделили от больных ягнят возбудитель, установили его фильтруемость и воспроизвели болезнь.

Морфология и химический состав. Это мелкий РНК-содержащий вирус. Размер вирионов 60-75 нм. Установлено различие в размерах вирионов, отличающихся по тропизму. Вирус чувствителен к эфиру и другим жирорастворителям, к фотодинамическому действию метиленовой сини и формальдегиду, инактивируется при 4-5°С. Цитратная вируссодержащая кровь больных животных сохраняет вирулентность не менее 6 мес.., при комнатной температуре не более 1 нед.

Устойчивость.Кислая и щелочная среда действуют на вирус губительно, оптимальный рН является 6,9-7,3. Дезинфицирующие вещества (0,5%-ный р-р едкого натра, 5%-ный р-р фенола и хлорсодержащие препараты) убивают вирус.

Антигенная структура не изучена. Антигенная активность.В крови переболевших животных появляются анти-ГА, ВНА и КСА. ВНА появляются на 4-й день после начала заболевания и сохраняются пожизненно; КСА обнаруживаются к 14-му дню после заражения и сохраняются до 6 мес. и более. Наи­более высокие титры AT к вирусу получены в реакции непрямой ИФ. Изоляты, выделенные во время эпидемий в Египте в 1977 г. и в Мавритании в 1987 г., отличались между собой в АГ-отношении. ЛДР обнаруженая на Мадагаскаре в 1979 г. без какого-либо воздействия на людей и животных. В1990 и 1991 гг. описано несколько вспышек с массовыми абортами у КРС. Во время эпизоотии в районах вспышек обнаружено широкое распространение IgM к вирусу ЛДР.

Антигенная вариабельность и родство. Антигенных вариантов у вируса ЛДР не обна­ружено. Описана интерференция между пантропным штаммом ЛДР и нейротропным виру­сом жёлтой лихорадки, а также вирусом чумы КРС. Штаммы вируса различаются по вирулентности и тропизму; последний признак зависит от метода пассирования.

Рекомендуемые материалы

Гемагглютинирующие свойства. Вирус ЛДР агглютинирует эритроциты цыплят од­нодневного возраста, мышей, морских свинок, а также эритроциты крови человека группы А. Оптимальные условия гемагглютинации эритроцитов однодневных цыплят - рН 6,5 и 25°С. Ингибитор гемагглютинации, содержащийся в нормальной сыворотке крови мышей, исчезает при хранении на холоде. Естественный ГА более эффективен, чем экстрагирован­ный ацетоном и эфиром.

Экспериментальная инфекция. Легко воспроизводится на ягнятах, козлятах, телятах, которые заболевают при введении вируссодержащего материала. При подкожном зараже­нии у овец наблюдалась лихорадка в течение 6 дн, 4 дн вирус обнаруживался в крови, на 9-10-й день вирус из крови исчезал. В нозальном секрете его обна­руживали с 3-го по 12-й день, а в сперме животных - с 8-го по 22-й день после заражения. В сыворотке крови обнаружены ВНА. Способ заражения оказывает существенное влия­ние на течение инфекции. Особенно легко заражаются новорождённые животные. Заражён­ные ягнята гибнут через 24-36 ч после появления первых признаков болезни. Из лаборатор­ных животных к вирусу чувствительны белые мыши, хорьки, белые крысы, хомяки. Кроли­ки и морские свинки невосприимчивы. При экспериментальном заражении КРС у большинства животных развивает­ся лихорадка, виремия и появляются ВНА в высоком титре.

Культивирование. Легко вирус культивируется в организме   1-3-дн мышат. При церебральном, пиретонеальном и внутривенном заражении вирус накапливается в вы­соких титрах. Культивирование на взрослых мышах менее эффективно. При серийном пассировании вируса в мозге мышей происходит его аттенуация. Вирус размножается на КЭ 2-3-й дн возраста при заражении их в желточный ме­шок. В максимальном количестве накапливается на 2-3 день после заражения. В 7-дн КЭ он практически не размножается, зато хорошо репродуцируется в первичных культурах клеток: фибробластах КЭ, почек ягнят, коз, обезьян, хомячков, тестикулярной ткани ягнят, а также в клетках саркомы мышей и крыс, в перевиваемых культурах клеток Чанга, печени человека, ВНК-21 и HeLa. Для накопления вируса в культуре клеток оптимальной дозой яв­ляется 2,5 ЛД_50/мл на клетку. Размножение вируса сопровождается появлением ЦПИ.

Титрование вируса, предварительно адаптированного к культуре клеток, по ЦПД, бляшкообразованию и церебральной патогенности оказалось неравноценным. Наиболее чувствителен интрацеребральный метод заражения 1-3-дн мышат. Титр вируса в этом случае был на 1,5 -2 lg выше, чем в культуре клеток.

ЭПИЗООТОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ

Источники и пути передачи инфекции. Болезнь носит сезонный характер. В дождли­вый период количество больных животных увеличивается. От больного животного к здоро­вому, а также от человека к человеку болезнь не передаётся. Во время эпизоотии наблюдают случаи заболевания людей, особенно пастухов и ветеринарных работников. ЛДР могут за­болеть буйволы и верблюды. Имеются сообщения о заболевании антилоп. В крови в наиболее высоких титрах вирус содержится в период максимального подъёма температуры ( титр вируса в крови овец достигает 10^7,6, а ягнят 10¹⁰ ЛД_50/мл при титровании на мышах ). В более низких титрах его обнаруживают на протяжении всего периода виремии (от 1-2 до 6-8 да), длительность и сроки появления которой зависят от пути проникновения вируса. Последний в высоких титрах также находят в печени и селезёнке. У больного КРС также отмечают высокую виремию (до 10^7,5 -lO^8,0 МЛД_50/мл), В молоке больных живот­ных вирус находится в высокой концентрации.

Спектр патогенности в естественных условиях. В естественных условиях источни­кам инфекции служат больные дикие и домашние животные, обезьяны и человек, а также членистоногие. Доказано, что 6 видов комаров Eretmapodites и 3 вида Aedes служат пере­носчиками и основными хранителями возбудителя ЛДР в природе. В распространении виру­са могут участвовать перелётные птицы и членистоногие, которые, очевидно, служат и ре­зервуаром его в межэпизоотический период. Возможным резервуаром вируса в природе яв­ляются также крысы Arvicannthis abyssinicus, у которых найдены AT. Природный очаг за­болевания - Восточная Африка.

Вирус патогенен для овец, коз, КРС, человека, обезьян, мышей, крыс, хомяков и хорь­ков. Лошади, свиньи и птицы (куры, утки, голуби) невосприимчивы. Болезнь поражает жи­вотных независимо от возраста, но погибает чаще молодняк. Более лёгкое переболевание взрослых животных можно объяснить частичным иммунитетом, который возникает у них вследствие возможного контакта с возбудителем болезни в молодом возрасте.

Клинические признаки и патологоанатомические изменения. Инкубационный пе­риод продолжается 24-72 ч, болезнь протекает различно в зависимости от возраста и вида животных. Новорождённые и молодью животные более чувствительны и тяжелее переносят болезнь, чем взрослые. Летальность среди ягнят и козлят достигает 95%, среди овец и коз -20-30%. У новорождённых ягнят и козлят болезнь протекает сверхостро. При этом видимые слизистые оболочки бледные, наблюдается понос, в фекалиях видна примес.ь крови. Смерть наступает через 24-48 ч после появления первых признаков болезни. У некоторых животных за 12-20 ч перед гибелью появляется рвота. Молодые овцематки абортируют, 20-30% поги­бает. У старых овец, коз и более взрослых телят болезнь чаще протекает подостро. С появ­лением лихорадки животные слабеют, теряют аппетит, на слизистой оболочке носа появля­ются кровянистые выделения. После абортов нередко развиваются осложнения в виде сеп­тических метритов и параметритов. Летальность не повышает 20%. У КРС болезнь чаще протекает бессимптомно. Иногда наблюдается кровавый понос, каловые массы с резким за­пахом. Характерны также обильное слюнотечение и дисгалактия.

Патологоанатомические изменения у ягнят и коз постоянны и характеризуются увеличе­нием и некрозом печени. В начале болезни под печёночной капсулой обнаруживают множе­ственные кровоизлияния, а на поверхности - единичные сероватые некротические участки около 1 мм в диаметре, размер и количество которых в дальнейшем быстро увеличивается. При развития болезни некоторые участки сливаются, и печень приобретает сероватый цвет. При остром течении болезни можно наблюдать геморрагические повреждения слизи­стых оболочек ЖКТ, а также множественные кровоизлияния на селезёнке, почках, лимфо­узлах, семенниках и сердечной мышце.

                                                   ДИАГНОСТИКА

Диагноз ставят на основании эпизоотических данных, клинических признаков болезни, патологоанатомических изменений и результатов лабораторных исследований. Для ЛДР ха­рактерны: большая смертность ягнят, массовые аборты у овец и коров, некротические изме­нения в печени, геморрагический гастроэнтерит у погибших ягнят. Из лабораторных мето­дов диагностики применяют: выделение вируса (взятие материала и заражение мышей, КЭ и культур клеток); биопробу на ягнятах и козлятах с нативным материалом от больного жи­вотного; для обнаружения AT к вирусу ЛДР в сыворотках КРС и овец используется ELISA; по специфичности он оказался равным РН бляшкообразования, а по чувствительности РН превосходит ELISA. Как правило, для выделения вируса используют белых мышей, у кото­рых вирус вызывает летальную инфекцию. К вирусу высокочувствительны хомячки. АГ об­наруживают в РСК, РДП, ИФ (в мазках-отпечатках) и РВИЭ. Идентификацию вируса про­водят в РН, РСК, РГА и её задержки. Для идентификации вируса, выделенного на мышах, наиболее простыми и надежными тестами являются РСК и РДП. При постановке окончательного диагноза необходимо исключить некоторые сходные болезни вирусной этиологии - катаральную лихорадку (синий язык) овец, болезнь Найроби, а также болезнь Вессельборна.

                     ИММУНИТЕТ И СПЕЦИФИЧЕСКАЯ ПРОФИЛАКТИКА

Одной из основных проблем борьбы с ЛДР является быстрое выявление инфицирован­ных животных. Методы серологической диагностики не позволяют достигнуть этой цели, вследствие того, что на ранних стадиях инфекции животные являются серонегативными. Однако AT вируса ЛДР удается обнаруживать в сыворотке крови всех экспериментально за­раженных животных (9).

Переболевшие животные вторично не заболевают. В сыворотке крови реконвалесцентов (овец, КРС, обезьян и человека) появляются ВНА и КСА. Такая сыворотка обладает выра­женным профилактическим действием. Ягнята, родившиеся от переболевшей овцы, в под­сосном периоде иммунны. Попытка иммунизировать овец и КРС против ЛДР впервые была предпринята более 50 лет назад, когда вирулентный штамм вируса был аттенуирован внутримозговыми пассажами на мышах. Нейропатогенный штамм вируса (92-й пассаж) был авирулентным для мышей, обезьян и овец при подкожном введении, но при внутримозговом введении он вызывал гибель овец и обезьян. В дальнейшем этот штамм был дополнительно пассирован 50 раз в КЭ и 10 раз - на мышах. В дальнейшем вакцину готовили из вируса 102-го пассажа на мышах, размноженного в культуре клеток ВНК-21. Вакцина экономична и вызывает длительный иммунитет у овец и КРС после однократного введения. Частичный иммунитет образуется через 6-7 дн. Потомство вакцинированных животных сохраняет ус­тойчивость к заражению вирусом ЛДР в течение 5 мес.. У ягнят, привитых в возрасте до 6 нед., иногда развивается энцефалит. В редких случаях вакцинация вызывает аборты у ов­цематок или аномальное развитие плодов.

В ЮАР и США разработана инактивированная вакцина. Для этого пассированные ви­рулентные штаммы вируса ЛДР выращивали в культуре клеток ВНК-21 и др., инактивировали формалином и добавляли ГОА в качестве адъюванта. Вакцина оказалась иммуногенным препаратом только при двукратной вакцинации. Разработанная в Израиле инактивиро­ванная вакцина с новым адъювантом имела выраженные АГ-свойства. Титр AT в РТГА у овец, привитых вакциной с адъювантом, составлял 1:20480, а у привитых без адъюванта -1:40-1:320 . Потомство от иммунизированных матерей следует иммунизировать с 3-мес. Для пассивной иммунизации новорождённых ягнят используют гипериммунную сыво­ротку КРС. Для активной профилактики ЛДР применяют живые и инактивированные вак­цины. Иммуногенность препарата находится в прямой зависимости от исходного титра вируса в суспензии. Живую вакцину готовят из нейротропного штамма вируса, адаптирован­ного на мышатах. Препарат безвреден для КРС и сообщает иммунитет до года.

Ветеринарно –санитарная оценка получаемой продукции не разработана.  В случае выявления данного заболевания на территории РФ по всей вероятности будет объявленно чрезвычайное положение и весь подозрительный по заболеванию и контактам скот будет уничтожен.

                                               Семейство: Paramyxoviridae.

Таксономическая структура семейства.

Семейство:        Paramyxoviridae.

Подсемейство:          Paramyxovirinae.

       Род:               Respirovirus, Rubulavirus,  Morbillivirus

Подсемейство:          Pneumovirinae

       Род:                Pneumovirus, Metapneumovirus

Характеристика вириона. Морфология. Вирионы плеоморфные, чаще сферической или нитевидной формы; диаметр 150 нм и более. Вирион состоит из нуклеокапсида, окруженного липидной оболочкой. Оболочка образуется из плазматической мембраны клетки при почковании и содержит 2-3 трансмембранных гликопротеина, представляющие собой гомоолигомеры в виде спйко-подобных выростов (отростков) длиной 8-12 нм, расположенных на расстоянии 7-10 нм друг от друга. Один негликозилированный мембранный или матриксный протеин связан с внутренней поверхностью мембраны. Нуклеокапсид имеет спиральную симметрию (13-18 нм в диаметре, с шагом 5,5-7 нм и длиной до 1000 нм), состоит из одной копии геномной РНК и связанных с ней протеинов. Встречаются мультиплоидные вирионы. Вирусная полимераза входит в состав вириона.

Mr (вирион) 500 x 10⁶; плавучая плотность в сахарозе 1,18-1,20 г/см³, S_20w не менее 1000S.

Вирионы очень чувствительны к нагреванию, жирорастворителям, ионным и неионным детергентам, формальдегиду и окислителям.

Геном. РНК: односпиральная, линейная, с негативной полярностью, неинфекционная; Mr 5-7 x 10⁶ (0,5% веса вириона). Размер: 15384 нуклеотида – вирус Сендай (Sendai virus, SeV), 15462 нуклеотида – вирус парагриппа человека 3 (Human parainfluenza 3, HPIV-3), 15384 нуклеотида – вирус эпидемического паротита (Mumps virus, MuV), 15246 нуклеотидов – вирус Simian virus 5 (SV-5), 15450 нуклеотидов – вирус Simian virus 41 (SV-41), 15156 нуклеотидов – вирус Болезни Ньюкасла (Newcastle disease virus, NDV), 15653 нуклеотида – вирус парагриппа человека 2 (Human parainfluenza 2, HPIV-2), 15894 нуклеотида – вирус кори (Measles virus, MeV), 15690 нуклеотидов – вирус чумы собак (Canine distemper virus, CDV), 15882 нуклеотида – вирус чумы КРС (Rinderpest virus, RPV), 15702 нуклеотида – морбилливирус китовых (Cetacean morbillivirus, CeMV), 15222 нуклеотида – ресираторносинцитиальный вирус человека (Human respiratory syncytial virus, HRSV). Некоторые вирионы могут содержать позитивную РНК. Полноразмерная геномная РНК обнаруживается в клетках или в составе вириона только в виде нуклеокапсида. Геномная РНК не имеет 5’-кэпа или связанных с геномом протеинов. 3’-конец генома не полиаденилирован.

Другие компоненты вирона. Члены подсемейства Paramyxovirinae кодируют 7-9 протеинов (Mr 5-250 х 10³), из которых 2-4 (или более) образуются из 2-3 перекрывающихся ORFs в локусе Р. Пневмовирусы кодируют 9-11 протеинов (Mr 4,8-250 х 10³). Общими для всех родов являются вирусные протеины: 3 нуклеокапсидных протеина: РНК-связывающий протеин (N или NP), фосфопротеин (Р) и крупный полимеразный протеин (L); 3 мембраноассоциированных протеина: негликозилированный внутренний мембранный или матриксный протеин (М), два гликозилированных оболочечных протеина, включающие протеин слияния (F) и протеин прикрепления (G или H, или HN). Протеин F синтезируется в инфицированных клетках как предшественник F₀, который активируется после разрезания клеточными протеазами с образованием вирусных, связанных дисульфидными связями, субъединиц F₁ и F₂ (в порядке: amino-F₂-S-S-F₁-carboxyl). Вариабельными являются неструктурные протеины (С, NS1 и NS2); богатый цистеином, связывающий цинк, протеин (V); мелкий интегративный мембранный протеин (SH) и фактор процессивности транскрипции (М2, называемый ранее 22-kDa-протеин), который ранее считался вторым М-подобным протеином. Энзиматическая активность вириона обусловлена РНК-зависимой РНК транскриптазой, аденилат трансферазой, мРНК гуанилил- и метилтрансферазой, протеинкиназой и нейраминидазой.

Липиды, имеющие клеточное происхождение, составляют 20-25% массы вириона.

Углеводы составляют 6% массы вириона; их композиция зависит от клетки-хозяина. Протеины слияния и прикрепления гликозилированы N-связанными сторонами карбогидратных цепей. В подсемействе Pneumovirinae протеин прикрепления (G) сильно гликозилирован по O-связанным карбогибратным сторонам цепей. Протеин SH респираторносинцитиального вирус содержит полилактозаминогликан. 

Организация генома и репликация. После прикрепления к клеточным рецепторам происходит слияние вирусной оболочки и поверхностной мембраны клетки (при нейтральном рН). Репликация вируса происходит в цитоплазме клеток и не зависит от функций ядра. Геном транскрибируется с 3’-конца вирусассоциированными энзимами в 5-10 отдельных, субгеномных, комплементарных геному, мРНК. Транскрипция контролируется короткими (10-13 нуклеотидов) консервативными сигнальными последовательностями старта/окончания/полиаденилирования, фланкирующими каждый транскрипционный элемент. мРНК кэпированы и имеют сайты полиаденилирования. Межгенные участки вирусов родов Respirovirus и Morbillivirus высококонсервативны по длине и сиквенсу, тогда как у вирусов родов Rubulavirus и Pneumovirus этого не отмечается. Репликация РНК происходит через промежуточную антигеномную полноразмерную РНК, имеющую позитивную полярность.

Последовательность генов у вирусов, отнесенных к разным родам данного семейства:

Сборка нуклеокапсида происходит в цитоплазме и тесно связана с синтезом РНК. Нуклеокапсид приобретает оболочку на клеточной поверхности в местах, содержащих вирусные гликопротеины. Члены подсемейства Paramyxovirinae содержат 5-7 транскрипционных элементов и кодируют 9-11 протеинов. каждый элемент кодирует одну мРНК, за исключением элемента P/V. Этот элемент транскрибируется в точную копию мРНК (P или V мРНК, в зависимости от рода) или в альтернативную версию, являющуюся результатом вставки одного или более нематричных нуклеотидов (“РНК-редактирование”) и перескакиванию рамки считывания на альтернативную ORF. Точная копия и альтернативная версия мРНК синтезируют разные протеины (P и V), имеющие идентичные аминотерминальные домены, но различающиеся по карбокситерминальным доменам. Другие предполагаемые протеины Р и С могут быть генерированы при инициации трансляции с разных кодонов одной ORF. Члены подсемейства Pneumovirinae имеют 8 (Metapneumovirus) или 10 (Pneumovirus) транскрипционных элементов, каждый из которых кодирует одну мРНК. Каждая мРНК кодирует 1 протеин, за исключением мРНК М2, кодирующей два протеина с разных ORFs. Между М2 и L некоторых пневмовирусов происходит перекрывание транскрипционных элементов.

Антигенные свойства. Протеины приклепления (HN или H, или G) и слияния (F) играют роль в формировании вируснейтрализующих антител и иммунитета. При инфекции образуются атитела к N, и другим протеинам вируса. Различные протеины могут быть антигенами для цитотоксических или хелперных Т-клеток.

Биологические особенности. Парамиксовирусы были идентифицированы только у позвоночных, как правило, млекопитающих и птиц. Большинство вирусов имеет узкий спектр естественных хозяев, но способны к репродукции в разных культурах клеток. Инфекция клеток в культуре обычно литическая, но может быть кратковременная или персистентная. Одной из особенностей является образование телец-включений и синцития. Рецепторы клеточной поверхности, сиалогликопротеины и гликолипиды, участвуют в прикреплении респиро- и рубулавирусов. Поверхностный клеточный протеин CD46 является основным рецептором для вируса кори. Нуклеокапсиды ассоциируются с протеинами вирусной мембраны на плазматической мембране, после чего при почковании приобретают липидную мембрану. Распространение вируса происходит горизонтально, чаще аэрозольно, векторов не определено. Парамиксовирусные инфекции начинаются с респираторного тракта (например, HRSV и HPIV), но могут распространиться на вторичные очаги (например, лимфоидные и эндотелиальные ткани для MeV, эндотелиальные ткани для MuV). Данные инфекции, как правило, ограничены и элиминируются иммунной системой хозяина. Данных о латентной инфекции нет. Долго протекающие персистентные инфекции известны только для подострого склерозирующего панэнцефалита, редких осложнений дефектными вирусами кори, и чумы собак у старых животных, когда персистенция дефектных или инфекционных вирусных частиц продолжается в течение недель и месяцев.

Подсемейство:   Paramyxovirinae.

Таксономическая структура подсемейства.

Подсемейство:          Paramyxovirinae.

                  Род:               Respirovirus, Rubulavirus, Morbillivirus

Характерные особености. Члены данного подсемейства имеют 5-7 транскрипционных элементов. Представители разных родов имеют сходство по сиквенсам соответствующих протеинов, среди которых NP, M и L являются наиболее консервативными протеинами, F и HN – менее консервативными, а протеин Р – низкоконсервативен, хотя уникальный участок V, имеет высокую степень гомологии. Подразделение на роды основано на филогенетическом группировании, в основе которого лежит анализ сходства аминокислотных сиквенсов, исключение составляет NDV, занимающий промежуточное положение между родами Respirovirus и Rubulavirus (у NDV наблюдается редактирование РНК как у Respirovirus, но он не имеет протеина С, а имеет гликопротеины, подобные Rubulavirus). Их нуклеокапсид имеет диаметр 18 нм с шагом 5,5 нм; длина поверхностных спайков 8 нм. Редактирование транскрипционного элемента РНК P/V отмечается у всех членов, кроме HPIV-1. Все представители подсемейства проявляют гемагглютинирующую активность.

Род: Respirovirus. Типовой вид: Sendai virus (SeV) (вирус Сендай).

Характерные особености. Члены данного рода имеют гемагглютинин и нейраминидазу. Идентифицировано 6 транскрипционных элементов. Все кодируют С-протеин. Нередактированная Р мРНК кодирует Р и С, тогда как вставка в эту мРНК нуклеотида G приводит к появления V ORF. Аминокислотная идентичность внутри рода значительно варьирует, в зависимости от протеина, и всегда выше, чем при сравнении с рубула- и морбилливирусами. Например, между респировирусами гомология по протеину NP составляет 88% (HPIV-1 и SeV), 63% - при сравнении HPIV-2 и HPIV-3. Между родами сходство по протеину NP составляет 18% - для HPIV-1 (Respirovirus) и MuV, HPIV-2 и HPIV-4 (Rubulavirus), и 21% при сравенении с MeV (Morbillivirus).

Критерии подразделения на виды внутри рода. HPIV-1 и HPIV-3 представляют разные серотипы, определенные на основе перекрестной нейтрализации и перекрестной защиты. Их генетические карты сходны, но не идентичны (HPIV-3 редактирует протеин D, но не V, тогда как у HPIV-1 редактирования нет). SeV является мышиным HPIV-1, который отличается от HPIV-1 по спектру восприимчивых хозяев (HPIV-1 пермиссивен и патогенен для человека, тогда как в мышах практически не репродуцируется и для них не патогенен; SeV – пермиссивен и патогенен для мышей). Оба эти вирусы сходны по сиквенсу и антегенным свойствам, но у HPIV-1 нет редактирования протеина V. BPIV-3 отличается от HPIV-3 по спектру восприимчивых хозяев. HPIV-3 у человека эффективно репродуцируется, легко передается и вызывает болезнь, тогда как ВPIV-3 – для человека непатогенен и плохо передается. При сравнении HPIV-3 и ВPIV-3 обнаруживается генетическое сходство, но и значительные отличия. Например, HPIV-3 и ВPIV-3 проявляют 25% антигенного родства в перекрестной нейтрализации и реакции подавления гемагглютинации. Кроме этого, ВPIV-3 образует протеин V, тогда как HPIV-3 – нет.

Виды (5 видов):

Род: Rubulavirus. Типовой: Mumps virus (MuV) (вирус эпидемического паротита свинки)).

Характерные особености. Члены данного рода проявляют гемагглютинирующую и нейраминидазную активность. Родство по сиквенсу внутри рода выше, чем при сравнении с членами других родов. Например, идентичность по протеину NP HPIV-2 составляет 39-74% при сравнении с MuV, SV-5, HPIV-4 и SV-41, и 18-24% - при сравнении с HPIV-1 и MeV. Некоторые члены рода (SV-5 и MuV) содержат экстратранскрипционный элемент (SH) между участками F и HN. Оригинальная и редактированная версии мРНК локуса Р кодируют протеины V и Р, соответственно, за исключением NDV, сходного по данному параметру с членами рода Respirovirus. Межгенные последовательности разной длины. Все представители данного рода не имеют ORF протеина С. Протеин Р членов рода Rubulavirus существенно меньше, чем у респиро- или морбилливирусов.

Критерии подразделения на виды внутри рода. HPIV-2 и HPIV-4 представляют разные серотипы, определенные на основе перекрестной нейтрализации и перекрестной защиты. HPIV-2, SV-5 и SV-41 имеют существенное родство по сиквенсам и антигенным свойствам, но отличаются по другим параметрам (например, пртеин NP HPIV-2 имеет гомологию на 57% и 74%, соответственно с SV-5 и SV-41), и спектру хозяев: HPIV-2, HPIV-4а и HPIV-4b инфицируют человека, SV-5 - собак, обезьян и человека, SV-41 - обезьян. Они имеют различия и в генетической карте: SV-5 имеет добавочный ген SH, у SV-41 нет сигнала терминации транскрипции для гена М, и, поэтому, не экспрессируется моноцистронная М мРНК. HPIV-4а и b различаются по реактивности с моноклональными антителами, но близкородственны по сиквенсу (95% и 97%, соответственно) протеинов NP и М, и не могут считаться разными видами. MuV не проявляет значительной активности в перекрестной нейтрализации и перекрестной защите с другими парамиксовирусами, имеет отличающуюся генетическую карту (содержит ген SH, который обнаруживается в этой группе только у SV-5), отличается по дивергенции сиквенсов (протеин NP MuV имеет аминокислотную идентичность не более 44% с другими рубулавирусами), отличается по вызываемой болезни. NDV (вирус парагриппа типа 1 птиц) отличается от других рубулавирусов по редактированию мРНК, кодирующей V, но не Р. Он также отличается по аминокислотному составу. Различные парамиксовирусы птиц являются серотипами, определяемыми в реакции ингибиции (задержки) гемагглютинации, хотя слабая реактивность просматривается между видами. Каждый серотип имеет отдельный профиль электрофоретического разделения полипептидов.

Виды (16 видов):

   Род: Morbillivirus. Типовой вид: Measles virus (MeV) (вирус кори).

Характерные особености. Долгое время основной характерной чертой представителей данного рода было отсутствие нейраминидазы, однако, недавно, нейраминидазная активность была показана в отношении RPV. Члены данного рода проявляют болшее родство по аминокислотному сиквенсу между собой, чем с представителями других родов того же подсемейства. Они имеют одинаковую организацию генома, количество транскрипционных элементов и длину межгенных последовательностей с представителями рода Respirovirus. Все морбилливирусы имеют транскрипционную единицу P/C/V c редактированием РНК как у ретровирусов (точная копия мРНК кодирует Р, а редактированная (с добавлением одного нуклеотида G) – V). Все морбилливирусы образуют внутрицитоплазматические и внутриядерные тельца-включения, содержащие вирусные рибонуклеокапсиды. Вирусы проявляют перекрестную реактивность в серологических тестах. Сиаловая кислота не является рецептором для морбилливирусов. Наличие рецепторов у узкого круга хозяев определяет их восприимчивость к вирусам. Для вируса кори таким рецептором является CD46.

Критерии подразделения на виды внутри рода. Морбилливирусы подразделяются по спектру восприимчивых животных, нуклеотидным сиквенсам и антигенным свойствам. Между видами, в зависимости от исследуемого протеина, просматривается невысокое и среднее родство по сиквенсу (например, NP MeV и CDV имеют родство 65%). Между видами проявляется активность в перекрестной нейтрализации и перекрестной защите, хотя эти признаки могут быть использованы для идентификации видов. MeV инфицирует приматов, CDV инфицирует членов отряда Carnivora (плотоядные), а RPV и PPRV (Peste-des-petits-ruminants virus) – членов отряда Artiodactyla (парнокопытных, особенно жвачных и свиней). PPRV отличается от RPV по сиквенсу (по протеину NP PPRV проявляет 68-72% гомологии с MeV, RPV и CDV) и по спектру восприимчивых животных (у КРС вызывает инфекцию не всегда). Phocine distemper virus (PDV) наиболее близок CDV, но отличается по спектру восприимчивых хозяев и дивергенции сиквенсов. Вирусы чумы дельфинов и морских свиней близкородственны между собой и близки RPV и MeV, но отличается по спектру восприимчивых хозяев и дивергенции сивенсов.

Виды (6 видов):

          Подсемейство: Pneumovirinae.

Таксономическая структура подсемейства.

Подсемейство:          Pneumovirinae

Род:                Pneumovirus, Metapneumovirus

Характерные особености. Члены данного подсемейства отличаются от представителей подсемейства Paramyxovirinae по следующим признакам:

а) имеют 8-10 транскрипционных элементов;

б) меньше средний размер ORF;

в) имеют один дополнительный негликозилированный ассоциированный с нуклеокапсидом протеин М2 (называемый ранее 22К);

г) большее О-связанное гликозилирование протеина G;

д) локус Р кодирует один протеин, и РНК не подвергается редактированию;

е) отсутствие сходства по аминокислотному сиквенсу, кроме незначительного сходства протеинов F и L;

ж) диаметр нуклеокапсида составляет 13-14 нм (тогда как у представителей подсемейства Paramyxovirinae – 18 нм);

з) шаг спирали нуклеокапсида составляет 7 нм;

и) длина гликопротеиновых спайков составляет 10-14 нм.

Виды вирусов, входящие в состав подсемейства Pneumovirinae род Pneumovirus не имеют нейраминидазы. Гемагглютинин отсутствует у BRSV и HRSV, но есть у MPV. Протеин G структурно не родственен протеинам HN и H других родов семейства Paramyxoviridae и проявляет высокий уровень различия между штаммами: идентичность между изолятами HRSV составляет всего 53%, а между респираторно-синцитиальными вирусами человека и животных – всего 21-30%.

Род:  Pneumovirus. Типовой вид: Human respiratory syncytial virus (HRSV) (респираторно-синцитиальный вирус человека).

Характерные особености. HRSV и MPV различаются по спектру восприимчивых хозяев (человек и мыши, соответственно) и отсутствию (или очень слабой) перекрестной нейтрализации. В зависимости от исследуемого протеина этих вирусов уровень гомологии по аминокислотным сиквенсам варьирует от невыявляемого до среднего (например, между протеинами NS1 и NS2 сходства не обнаруживается, тогда как протеины NP и F проявляют гомологию на 62% и 40%, соответственно). Их генетические карты различаются только по отсутствию у MPV перекрывания в гене M2/L. BRSV и HRSV отличаются между собой по спектру восприимчивых хозяев (КРС и человек, соответственно), хотя и не абсолютно. Например оба вируса эффективно репродуцируются в культурах клеток человека и КРС, хотя может просматриваться некоторая специфичность. У шимпанзе НRSV эффективно репродуцируется, распространяется между особями, обладает патогенностью, тогда как BRSV в данном случае считается авирулентным и непатогенным. Оба вируса имеют значительное сходство по сиквенсам и антигенным свойствам, но и легко могут быть различены по этим признакам. Например, между BRSV и HRSV идентичность протеинов F и NP составляет 81%, тогда как между штаммами HRSV эти значения достигают 89% и 96%, соответственно. Антисыворотки против одного вируса способны нейтрализовывать другой (но в разной степени). У HRSV выделяется две антигенные подгруппы А и В, у которых аминокислотная идентичность варьирует от 96% (N) до 53% (G), гомология по нуклеотидным сиквенсам протеинов F и G составляет 50% и 5%, соответственно, а различие по взаимной перекрестной нейтрализации доходит до четырехкратного. Схожий антигенный диморфизм также может существовать и у BRSV.

Виды (3 вида):

Предполагаемые виды: Описаны штаммы BRSV, выделенные от коз и овец, представляют, вероятно, вместе с BRSVподгруппу штаммов от жвачных, а не отдельный вид.

Род:  Metapneumovirus. Типовой:Turkey rhinotracheitis virus (TRTV) (вирус ринотрахеита Характерные особености.Расположение генов SH-G против F-M2 является противоположным при сравнении с пневмовирус. Нет генов NS1 и NS2, присутствующих у пневмовирусов. Вирионы не содержат гемагглютинина и нейраминидазы.

Неклассифицированные вирусы семейства. Помимо двух идентифицированных вирусов, обозначаемых Fer-de-Lance virus рептилий (FDLV) и Nariva virus (NARV) грызунов, известно еще несколько вирусов, выделенных от пингвинов, и отличающихся от парамиксовирусов 1-9. Более того, вирус Hendra, родственный подсемейству Paramyxovirinae (родственны гены F, H, M, Н и P, V, C), был выделен от растительноядных летучих мышей и лошадей в Queensland (Австралия). Известно два случая летальной инфекции у людей, заразившихся вирусом, выделенным от лошадей. 

Сходство с другими таксонами. Стратегия экспресси генома, репликация и структура генома членов данного семейства сходна с таковыми других семейств отряда Mononegavirales (Rabdoviridae, Filoviridae).