Для студентов СПбГУ по предмету БиологияРегуляции биосинтеза аргинина у одноклеточных зеленых водорослейРегуляции биосинтеза аргинина у одноклеточных зеленых водорослей
2024-08-062024-08-06СтудИзба
ВКР: Регуляции биосинтеза аргинина у одноклеточных зеленых водорослей
Описание
Оглавление
2
3.1. Биоинформационный анализ первичных последовательностей DsaNAGK и DsaPII
31
3.2. Характеристика активности DsaNAGK in vitro............................................................ 36
3.3. Характеристика активности DsaNAGK in vivo............................................................ 41
3.3.1. Рост D. salina при разных концентрациях NaCl в среде........................................ 41
3.3.2. Зависимость активности и синтеза DsaNAGK в клетках, выращенных при разных
концентрациях NaCl............................................................................................................ 42
3.3.3. Активность и экспрессия DsaNAGK в условиях голодания по азоту.................. 44
3.3.4. Активность и экспрессия CrNAGK в условиях голодания по азоту.................... 47
Глава 4. Обсуждение результатов.......................................................................................... 49
Заключение................................................................................................................................. 53
Выводы........................................................................................................................................ 54
Благодарности........................................................................................................................... 55
Список литературы.................................................................................................................. 56
3
Список сокращений
ACCase – ацетил-КоА-карбоксилаза
Arg – аргинин
BCCP – белок-носитель карбоксила биотина
BC – биотинкарбоксилаза
DTT – дитиотреитол
Gln – глутамин
GOGAT – глутамин-оксоглутаратаминотрансфераза CO2 – углекислый газ
GS – глутаминсинтетаза
CT – карбокситрансфераза
C/N – соотношение углерода к азоту
HCO3- – гидрокарбонат-ион
LDH – лактатдегидрогеназа
MDH – малатдегидрогеназа
МЕ – малик-энзим
NAGK – N-ацетил-L-глутаматкиназа
PEPC – фосфоенолпируваткарбоксилаза
PEP – фосфоенолпируват
PK – пируваткиназа
PMSF – фенилметилсульфонил фторид
Pi – фосфат-анион, неорганический фосфор
Список сокращений .................................................................................................................... | 4 | ||
Введение | ........................................................................................................................................ | 5 | |
Глава 1. Обзор литературы ....................................................................................................... | 7 | ||
1.1. Сигнальные белки семейства PII фотосинтезирующих организмов ............................ | 7 | ||
1.2. Структура и функции PII-белков у цианобактерий ......................................................... | 8 | ||
1.2.1. Структура PII-белков у цианобактерий .................................................................. | 8 | ||
1.2.2. | Контроль белков-транспортеров ............................................................................ | 10 | |
1.2.3. Контроль биосинтеза аргинина и цианофицина .................................................. | 11 | ||
1.2.4. | Контроль глобального регулятора транскрипции NtcA через взаимодействие с | ||
белком-адаптером PipX .......................................................................................... | 14 | ||
1.2.5. | Регуляция фосфоенолпируваткарбоксилазы ........................................................ | 15 | |
1.2.6. Контроль биосинтеза жирных кислот ................................................................... | 16 | ||
1.3. Структура и функции PII-белков у растений ................................................................ | 17 | ||
1.3.1. Структура PII-белков у растений ........................................................................... | 17 | ||
1.3.2. | Взаимодействие с NAGK ........................................................................................ | 18 | |
1.3.3. Контроль биосинтеза жирных кислот ................................................................... | 19 | ||
1.3.4. Участие в поддержании симбиотических систем ................................................ | 19 | ||
Глава 2. Материалы и методы ................................................................................................ | 21 | ||
2.1. | Объект исследования ....................................................................................................... | 21 | |
2.2. | Условия культивирования .............................................................................................. | 21 | |
2.3. | Количественный анализ экспрессии генов ................................................................... | 22 | |
2.3.1. Выделение тотальной РНК ....................................................................................... | 22 | ||
2.3.2. Синтез комплементарной ДНК ................................................................................. | 23 | ||
2.3.3. Количественная ПЦР в режиме реального времени ............................................... | 23 | ||
2.4. | Измерение концентрации хлорофилла .......................................................................... | 25 | |
2.5. | Выделение белков и определение их концентрации ................................................... | 25 | |
2.6. | Определение внутриклеточного содержания свободного аргинина ......................... | 26 | |
2.7. | Клонирование, экспрессия и очистка рекомбинантных белков ................................. | 26 | |
2.8. | Оценка активности фермента NAGK in vitro ............................................................... | 28 | |
2.9. | Оценка активности фермента NAGK in vivo ................................................................ | 29 | |
2.10. Статистическая обработка данных ............................................................................. | 29 | ||
Глава 3. Результаты .................................................................................................................. | 31 | ||
| | | |
2
3.1. Биоинформационный анализ первичных последовательностей DsaNAGK и DsaPII
31
3.2. Характеристика активности DsaNAGK in vitro............................................................ 36
3.3. Характеристика активности DsaNAGK in vivo............................................................ 41
3.3.1. Рост D. salina при разных концентрациях NaCl в среде........................................ 41
3.3.2. Зависимость активности и синтеза DsaNAGK в клетках, выращенных при разных
концентрациях NaCl............................................................................................................ 42
3.3.3. Активность и экспрессия DsaNAGK в условиях голодания по азоту.................. 44
3.3.4. Активность и экспрессия CrNAGK в условиях голодания по азоту.................... 47
Глава 4. Обсуждение результатов.......................................................................................... 49
Заключение................................................................................................................................. 53
Выводы........................................................................................................................................ 54
Благодарности........................................................................................................................... 55
Список литературы.................................................................................................................. 56
3
Список сокращений
ACCase – ацетил-КоА-карбоксилаза
Arg – аргинин
BCCP – белок-носитель карбоксила биотина
BC – биотинкарбоксилаза
DTT – дитиотреитол
Gln – глутамин
GOGAT – глутамин-оксоглутаратаминотрансфераза CO2 – углекислый газ
GS – глутаминсинтетаза
CT – карбокситрансфераза
C/N – соотношение углерода к азоту
HCO3- – гидрокарбонат-ион
LDH – лактатдегидрогеназа
MDH – малатдегидрогеназа
МЕ – малик-энзим
NAGK – N-ацетил-L-глутаматкиназа
- –азот
PEPC – фосфоенолпируваткарбоксилаза
PEP – фосфоенолпируват
PK – пируваткиназа
PMSF – фенилметилсульфонил фторид
Pi – фосфат-анион, неорганический фосфор
Характеристики ВКР
Предмет
Учебное заведение
Семестр
Просмотров
1
Размер
1,97 Mb
Список файлов
Регуляции биосинтеза аргинина у одноклеточных зеленых водорослей.doc