93560 (590123), страница 6
Текст из файла (страница 6)
p2x + 2px (1 - px) + (1 - px) 2 = 1; но так как,
p2x + 2px (1 - px) = Ax,
1 - px = и
px = 1 - ,
где Px - частота гена;
Аx - частота антигена.
Определенная по формуле частота гена должна быть проверена путем сравнения наблюдаемого в выборке распределения гомо - и гетерозиготных индивидуумов с теоретически рассчитанной в соответствии с законом Харди-Вайнберга.
Достоверность различий в частоте встречаемости антигенов у больных туберкулезом и здоровых людей русской национальности, проживающих в Челябинской области, рассчитывается согласно критерию Пирсона:
,
где N - это число обследованных в двух сравниваемых группах;
а - число индивидуумов несущих исследуемый антиген среди больных туберкулезом;
в - число индивидуумов не несущих исследуемый антиген среди больных туберкулезом;
с - число индивидуумов несущих исследуемый антиген среди здоровых русских;
d - число индивидуумов, не несущих исследуемый антиген среди здоровых русских.
Важным элементом популяционного анализа являются гаметные ассоциации, которые учитывают разницу в теоретически определенной ассоциации между 2-я антигенами разных локусов и истинной ассоциацией, встречающейся в популяции. К необходимости введения данного показателя приводит рассуждение: если бы аллели исследуемых локусов встречались независимо друг от друга, часть их ассоциаций на хромосоме (гаплотип) определялась бы произведением Р1×Р2, где Р1 и Р2 - частота соответствующих генов. Однако в популяции частота отдельных аллелей встречаются более часто или наоборот, более редко, чем это следует из теоретического расчета, то есть данные гены находятся в состоянии неравновесного сцепления (linkage disequilibrium), которое измеряется величиной Δ, отражающее превышение или дефицит гаплотипа в популяции по сравнению с произведением частот двух генов.
Величина Δ подсчитывается из ''сетки'' 2×2 по формуле (P. Mattiusi 1970г)
n - число обследованных в выборке
b - число индивидуумов несущих X и не несущих Y
с - число индивидуумов несущих Y, но не несущих X
d - число индивидуумов не несущих ни X ни Y.
Приведенная формула входит составной частью в формулу, используемую для определения частоты гаплотипа в панмиктической популяции
H XY = (PX × PY) + Δ X,Y,
где РX и РY - равны частоте соответствующих генов
ΔX,Y - гаметная ассоциация между генами соответствующими генами.
Для определения частоты трехлокусных гаплотипов методом максимального правдоподобия (maximum-liekelihood) использовалась компьютерная программа "Арлекин", версия 3.1
2.2 Результаты собственных исследований
2.2.1 Анализ распределения частот генов и антигенов HLA II класса у больных туберкулезом представителей русской национальности, проживающих в Челябинской области
В результате проведенного исследования были выявлены основные черты иммуногенетического профиля HLA локусов DR, DQB, DQA у больных туберкулезом русской национальности (рисунок 6, приложения). Анализ распределения аллелей данных локусов представлен в таблице 5.
Таблица 5. Распределение частот генов и антигенов HLA II класса
у больных туберкулезом
HLA | Больные туберкулезом | ||
N = 51 | Ax% | Рx% | |
DR 1 | 14 | 27,45 | 0,15 |
DR 3 | 8 | 15,69 | 0,08 |
DR 4 | 12 | 23,53 | 0,13 |
DR 7 | 15 | 29,41 | 0,16 |
DR 8 | 3 | 5,88 | 0,03 |
DR 9 | 2 | 3,92 | 0,02 |
DR 10 | 0 | 0 | 0,00 |
DR 11 | 9 | 17,65 | 0,09 |
DR 12 | 1 | 1,96 | 0,01 |
DR 13 | 11 | 21,57 | 0,11 |
DR 14 | 2 | 3,92 | 0,02 |
DR 15 | 12 | 23,53 | 0,13 |
DR 16 | 7 | 13,73 | 0,07 |
DQA 101 | 16 | 31,38 | 0,17 |
DQA 102 | 19 | 37,25 | 0,21 |
DQA 103 | 8 | 15,67 | 0,08 |
DQA 201 | 15 | 29,41 | 0,16 |
DQA 301 | 14 | 27,45 | 0,15 |
DQA 401 | 3 | 5,88 | 0,03 |
DQA 501 | 20 | 39,21 | 0,22 |
DQA 601 | 0 | 0 | 0,00 |
DQB 201 | 20 | 39,22 | 0,22 |
DQB 301 | 15 | 29,41 | 0,16 |
DQB 302 | 9 | 17,65 | 0,09 |
DQB 303 | 4 | 7,84 | 0,04 |
DQB 401/2 | 3 | 5,88 | 0,03 |
DQB 501 | 13 | 25,49 | 0,14 |
DQB 502/4 | 7 | 13,73 | 0,07 |
DQB 503 | 2 | 3,92 | 0,02 |
DQB 602/8 | 19 | 37,25 | 0,21 |
DQB 601 | 1 | 1,96 | 0,01 |
Как видно из таблицы, для больных туберкулезом характерна относительно высокая частота антигенов DR 1 (27,45%), DR 7 (29,41%). С низкой частотой встречались DR 8 (5,88%), DR 9 (3,92%), DR 12 (1,96%), DR 14 (3,92%). Антиген DR 10 у больных туберкулезом обнаружен не был.
Самыми распространенными аллелями локуса HLA DQA у больных туберкулезом являются DQA 101 (31,37%), DQA 102 (37,25%), DQA 501 (39,22%). Наиболее низкие частоты имеет DQA 401 (5,88%).
Среди аллелей локуса HLA DQB у больных туберкулезом Челябинской области преобладающими являются DQB 201 (39,21%), DQB 602/8 (37,25%), DQB 501 (25,49%). Редкими являются аллели DQB 303 (7,84%), DQB 401/2 (5,88%), DQB 503 (3,92%), DQB 601 (1,96%). В целом такое распределение типично для большинства популяций европеоидной расы.
2.2.2 Анализ распределения частот генов и антигенов HLA II класса в популяции русских Челябинской области
В результате проведенного исследования были выявлены основные черты иммуногенетического профиля HLA локусов DR, DQB, DQA у здоровых доноров областной станции переливания крови русской национальности, проживающих в Челябинской области. Анализ распределения аллелей данных локусов представлен в таблице 6.
Таблица 6. Распределение частот генов и антигенов HLA II класса
у здоровых русских, проживающих в Челябинской области
HLA | Здоровые русские | ||
N = 202 | Ax% | Рx% | |
DR 1 | 55 | 27,22 | 0,15 |
DR 3 | 37 | 18,31 | 0,1 |
DR 4 | 38 | 18,81 | 0,1 |
DR 7 | 48 | 23,76 | 0,13 |
DR 8 | 17 | 8,42 | 0,04 |
DR 9 | 9 | 4,46 | 0,02 |
DR 10 | 7 | 3,47 | 0,02 |
DR 11 | 38 | 18,81 | 0,1 |
DR 12 | 7 | 3,47 | 0,02 |
DR 13 | 56 | 27,72 | 0,15 |
DR 14 | 7 | 3,47 | 0,02 |
DR 15 | 54 | 26,73 | 0,14 |
DR 16 | 11 | 5,45 | 0,03 |
DQA 101 | 65 | 32,18 | 0,18 |
DQA 102 | 62 | 30,69 | 0,17 |
DQA 103 | 41 | 20,30 | 0,11 |
DQA 201 | 48 | 23,76 | 0,13 |
DQA 301 | 48 | 23,76 | 0,13 |
DQA 401 | 14 | 6,93 | 0,04 |
DQA 501 | 69 | 34,16 | 0, 19 |
DQA 601 | 1 | 0,50 | 0,002 |
DQB 201 | 71 | 35,15 | 0, 19 |
DQB 301 | 72 | 35,64 | 0, 20 |
DQB 302 | 29 | 14,36 | 0,07 |
DQB 303 | 20 | 9,90 | 0,05 |
DQB 401/2 | 13 | 6,44 | 0,03 |
DQB 501 | 63 | 31, 19 | 0,17 |
DQB 502/4 | 13 | 6,43 | 0,03 |
DQB 503 | 6 | 2,97 | 0,01 |
DQB 602/8 | 81 | 40,10 | 0,23 |
DQB 601 | 10 | 4,95 | 0,03 |
Как видно из таблицы, для популяции русских, проживающих в Челябинской области, характерна относительно высокая частота антигенов DR 1 (27,22%), DR 13 (27,22%) и DR 15 (26,73%). С низкой частотой встречались DR 9 (4,46%), DR 10 (3,47%), DR 12 (3,47%), DR 14 (3,47%). Такое распределение аллелей характерно для большинства европеоидных популяций.
Среди аллелей локуса DQA у доноров русской национальности из Челябинской области наиболее частыми являются DQA 101 (32,18%), DQA 102 (30,69%), DQA 501 (34,16%), что типично для большинства популяций европеоидной расы. Редко встречаются аллели DQA 401 (6,93%), DQA 601 (0,50%).
Среди аллелей локуса HLA DQB русских Челябинской области преобладающими являются DQB 201 (35,15%), DQB 301 (35,64%), DQB 501 (31,19%), DQB 602/8 (40,10%), что также характерно для европеоидов. Редкими являются аллели DQB 503 (2,97%), DQB 601 (4,95%).
2.2.3 Сравнительный анализ частот встречаемости антигенов HLA II класса у больных туберкулезом и здоровых представителей русской этнической группы Челябинской области
В таблице 7 представлены данные о точных популяционных показателях для антигенов и генов (Ах, Рх) локусов DR, DQA, DQB у больных туберкулезом и здоровых представителей русской этнической группы Челябинской области, а также рассчитана достоверность различий (χ2) генов между больными туберкулезом и здоровыми русскими (рисунок 7, приложения).