1631210416-f28f9c0a006861d1631af16049f058cf (558182), страница 2
Текст из файла (страница 2)
Поскольку важно, чтобысоединения не связывались со здоровыми клетками, прошедшая «отбор» часть библиотеки помещалась ккультуре здоровых клеток. Но в этом случае отбор проходили уже те элементы библиотеки, которые были менеесильно связаны с клетками и находились в среде. После двух отборов с помощью метода ПЦР увеличивалоськоличество оставшихся олигонуклеотидов, потом процесс повторяли еще несколько раз. Важно отметить, что входе ПЦР происходило уменьшение количества искусственных нуклеотидов в аптамерах из-за случайных заменпар Z-P на C-G или C-G и T-A, то есть, если бы эти основания уменьшали сродство молекул к раковым клеткам,по сравнению с классическими, то в итоге эксперимента в библиотеке остались бы только «традиционные»олигонуклеотиды. По прошествии 13 циклов обработки библиотеки наибольшим соответствием задачамэксперимента соответствовали аптамеры, содержащие от одного до трех искусственных нуклеотидов.
Замена Z иP на классические основания значительно ухудшала характеристики соединений.Artificially ExpandedGenetic InformationSystems (AEGIS)15Химическая модификацияаптамеровМногие модификации аптамеров (особенно в 2'положении рибозы при введении F- или NH2 группы) делают их устойчивыми к воздействиюнуклеаз, что имеет огромное значение прииспользовании аптамеров в диагностических итерапевтических целях.16Нанодоставка в клетки-мишениДОСТАВКА ГЕМЦИТАБИНА В КЛЕТКИМИШЕНИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМАПТАМЕРОВNucleic Acid Ther.
2012. V.22. №5. P. 295–30517Механизм действия гемцитабинаГемцитабин, как и другие нуклеозиды, непроникаетнепосредственночерезплазматическую мембрану, а лишь посредствомтранспортереров. Внутри клетки гемцитабинпретерпевает ряд фосфорилирований. Какгемцитабин, так и гемцитабин-5`-фосфатпретерпевают инактивацию дезаминированием.Гемцитабин-5’-трифосфат включается в цепьДНК в процессе репликации и блокируетэлонгацию цепи.
Корректирующие экзонуклеазыпри этом неспособны исправлять заменуцитозинанагемцитабин.Ещеоднойособенностью механизма действия гемцитабинаявляется наличие в нем положительной обратнойсвязи. Гемцитабин-5’-дифосфат ингибируетферментрибонуклеотидредуктазу,восстанавливающийрибонуклеотидывдезоксирибонуклеотиды.
Возникающий при этомдефицитдезоксицитидин-5`-трифосфатаприводиткусиленномувключениютрифосфатной формы гемцитабина в ДНК. Приэтом элонгация цепи после включениягемцитабина может быть осуществлена на однозвено, но не более. Полученная терминирующаязамена не может быть исправлена ферментамиэксцизионной репарации.19Сигнальные аптамеры, генерирующие флуоресцентный сигнал привзаимодействии с белком-мишеньюКаждый раунд отбора включает две стадии. На первой стадии отбираются последовательности, способныевзаимодействовать с какой-либо флуоресцентной молекулой.
Для отбора таких последовательностей можноиспользовать сорбент, содержащий ковалентно-пришитые молекулы флуорофора. На второй стадии полученныепоследовательности инкубируют с белком-мишенью, а затем отбирают олигонуклеотиды, не связывающиеся ссорбентом, содержащим молекулы флуорофора. В результате применения подобной схемы отбора могут бытьполучены лиганды, которые связываются с флуорофором в отсутствие белка-мишени и диссоциируют в егоприсутствии, что приводит к увеличению сигнала флуоресценции.Канадская компания Two-Photon Research разработала диагностическую платформу CAST, которая способнаобнаружить присутствие вируса COVID-19 с помощью смартфона. Платформа CAST используетзапатентованную систему Aptamer Molecular Photonic Beacon (AMPB), которая фотонным способомвзаимодействует со смартфоном.CAST предназначена для обнаружения коронавируса SARS-CoV-2, чтобы помочь в борьбе с пандемией COVID19, но система также может быть использована для обнаружения других вирусов.Во время теста AMPB связывается с белком S1 вируса SARS-CoV-2, если он присутствует в образце слюны.
Присвязывании с этим белком AMPB реагирует на включение вспышки смартфона и излучаемый системой светзатем фиксируется CMOS-датчиками смартфона. Если ответной световой реакции нет, значит в образце вирусыне присутствуют.20РАЗРАБОТКА ТЕРАНОСТИКОВТераностик наоснове альбумина итрифтортимидинадля детекции илечения рака21РАЗРАБОТАЙТЕ ТЕРАНОСТИК ДЛЯ БОР-НЕЙТРОНОЗАХВАТНОЙ ТЕРАИИБор-нейтронозахватная терапия (БНЗТ)– это способ избирательного пораженияклеток злокачественных опухолей сиспользованиемускорительногоисточника нейтронов.
В раковыхклетках накапливают изотоп бора-10,затем опухоль облучают потокомнейтронов,которыепоглощаютсяядрами бора - ядерные реакции,которые сопровождаются большимэнерговыделением,уничтожаютбольные клетки, при этом здоровыеклетки не страдают. Экспериментыпоказали эффективность этого способалечения опухолей головного мозга идругихвидовсложныхвидовонкологических заболеваний22.