Главная » Просмотр файлов » B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis и др. - Molecular Biology of The Cell (6th edition)

B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis и др. - Molecular Biology of The Cell (6th edition) (1120996), страница 90

Файл №1120996 B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis и др. - Molecular Biology of The Cell (6th edition) (B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis и др. - Molecular Biology of The Cell (6th edition)) 90 страницаB. Alberts, A. Johnson, J. Lewis и др. - Molecular Biology of The Cell (6th edition) (1120996) страница 902019-05-09СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 90)

Explain why white sec-Figure Q4–2 Chromosometors have formed near the rim of the red colony. Based on3 in orangutans and humansthe patterns observed, what can you conclude about the(Problem 4–9). Differently coloredpropagation of the transcriptional state of the Ade2 geneblocks indicate segments of thechromosomesthat arehomologousfrom mother to daughter cells in this experiment?Problemsp4.03/4.03/Q4.1in DNA sequence.two inversionsorangutanwhite colony ofyeast cellsOhuman4–10 Assuming that the 30-nm chromatin fiber contains about 20 nucleosomes (200 bp/nucleosome) per 50nm of length,calculate the degree of compaction of DNAProblemsp4.06/4.05/Q4.2associated with this level of chromatin structure.

Whatfraction of the 10,000-fold condensation that occurs atmitosis does this level of DNA packing represent?4–11 In contrast to histone acetylation, which alwayscorrelates with gene activation, histone methylation canlead to either transcriptional activation or repression. Howdo you suppose that the same modification—methylation—can mediate different biological outcomes?4–12 Why is a chromosome with two centromeres (adicentric chromosome) unstable? Would a backup centromere not be a good thing for a chromosome, giving ittwo chances to form a kinetochore and attach to microtubules during mitosis? Would that not help to ensure thatthe chromosome did not get left behind at mitosis?4–13 Look at the two yeast colonies in Figure Q4–3.

Eachof these colonies contains about 100,000 cells descendedfrom a single yeast cell, originally somewhere in the middle of the clump. A white colony arises when the Ade2 geneis expressed from its normal chromosomal location. Whenthe Ade2 gene is moved to a location near a telomere, itis packed into heterochromatin and inactivated in mostcells, giving rise to colonies that are mostly red. In theselargely red colonies, white sectors fan out from the middleof the colony.

In both the red and white sectors, the Ade24–14 Mobile pieces of DNA—transposable elements—that insert themselves into chromosomes and accumulateduring evolution make up more than 40% of the humangenome. Transposable elements of four types—long interspersed nuclear elements (LINEs), short interspersednuclear elements (SINEs), long terminal repeat (LTR)retrotransposons, and DNA transposons—are insertedmore-or-less randomly throughout the human genome.These elements are conspicuously rare at the four homeobox gene clusters, HoxA, HoxB, HoxC, and HoxD, as illustrated for HoxD in Figure Q4–4, along with an equivalentregion of chromosome 22, which lacks a Hox cluster.

EachHox cluster is about 100 kb in length and contains 9 to 11genes, whose differential expression along the anteroposterior axis of the developing embryo establishes the basicbody plan for humans (and for other animals). Why do yousuppose that transposable elements are so rare in the Hoxclusters?chromosome 22chromosome 2100 kbHoxD clusterFigure Q4–4 Transposable elements and genes in 1-Mb regions ofchromosomes 2 and 22 (Problem 4–14). Blue lines that project upwardindicate exons of known genes. Red lines that project downwardindicate transposable elements; they are so numerous (constituting morethan 40% of the human genome) that they merge into nearly a solidblock outside the Hox clusters.

(Adapted from E. Lander et al., Nature409:860–921, 2001. With permission from Macmillan Publishers Ltd.)Problems p4.31/4.22/Q4.4236Chapter 4: DNA, Chromosomes, and GenomesREFERENCESGeneralArmstrong L (2014) Epigenetics. New York: Garland Science.Hartwell L, Hood L, Goldberg ML et al. (2010) Genetics: From Genes toGenomes, 4th ed.

Boston, MA: McGraw Hill.Jobling M, Hollox E, Hurles M et al. (2014) Human EvolutionaryGenetics, 2nd ed. New York: Garland Science.Strachan T & Read AP (2010) Human Molecular Genetics, 4th ed. NewYork: Garland Science.The Structure and Function of DNAAvery OT, MacLeod CM & McCarty M (1944) Studies on the chemicalnature of the substance inducing transformation of pneumococcaltypes. J. Exp. Med. 79, 137–158.Meselson M & Stahl FW (1958) The replication of DNA in Escherichiacoli. Proc. Natl Acad. Sci.

USA 44, 671–682.Watson JD & Crick FHC (1953) Molecular structure of nucleic acids.A structure for deoxyribose nucleic acid. Nature 171, 737–738.Chromosomal DNA and Its Packaging in the ChromatinFiberAndrews AJ & Luger K (2011) Nucleosome structure(s) and stability:variations on a theme. Annu. Rev. Biophys. 40, 99–117.Avvakumov N, Nourani A & Cõté J (2011) Histone chaperones:modulators of chromatin marks. Mol. Cell 41, 502–514.Deal RB, Henikoff JG & Henikoff S (2010) Genome-wide kinetics ofnucleosome turnover determined by metabolic labeling of histones.Science 328, 1161–1164.Grigoryev SA & Woodcock CL (2012) Chromatin organization—the30 nm fiber. Exp.

Cell Res. 318, 1448–1455.Li G, Levitus M, Bustamante C & Widom J (2005) Rapid spontaneousaccessibility of nucleosomal DNA. Nat. Struct. Mol. Biol. 12, 46–53.Luger K, Mäder AW, Richmond RK et al. (1997) Crystal structure of thenucleosome core particle at 2.8 Å resolution. Nature 389, 251–260.Narlikar GJ, Sundaramoorthy R & Owen-Hughes T (2013) Mechanismsand functions of ATP-dependent chromatin-remodeling enzymes.Cell 154, 490–503.Song F, Chen P, Sun D et al. (2014) Cryo-EM study of the chromatinfiber reveals a double helix twisted by tetranucleosomal units.Science 344, 376–380.Chromatin Structure and FunctionAl-Sady B, Madhani HD & Narlikar GJ (2013) Division of labor betweenthe chromodomains of HP1 and Suv39 methylase enablescoordination of heterochromatin spread.

Mol. Cell 51, 80–91.Beisel C & Paro R (2011) Silencing chromatin: comparing modes andmechanisms. Nat. Rev. Genet. 12, 123–135.Black BE, Jansen LET, Foltz DR & Cleveland DW (2011) Centromereidentity, function, and epigenetic propagation across cell divisions.Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 75, 403–418.Elgin SCR & Reuter G (2013) Position-effect variegation,heterochromatin formation, and gene silencing in Drosophila.

ColdSpring Harb. Perspect. Biol. 5, a017780.Felsenfeld G (2014) A brief history of epigenetics. Cold Spring Harb.Perspect. Biol. 6, a018200.Feng S, Jacobsen SE & Reik W (2010) Epigenetic reprogramming inplant and animal development. Science 330, 622–627.Filion GJ, van Bemmel JG, Braunschweig U et al. (2010) Systematicprotein location mapping reveals five principal chromatin types inDrosophila cells. Cell 143, 212–224.Fodor BD, Shukeir N, Reuter G & Jenuwein T (2010) MammalianSu(var) genes in chromatin control. Annu.

Rev. Cell Dev. Biol.26, 471–501.Giles KE, Gowher H, Ghirlando R et al. (2010) Chromatin boundaries,insulators, and long-range interactions in the nucleus. Cold SpringHarb. Symp. Quant. Biol. 75, 79–85.Gohl D, Aoki T, Blanton J et al.

(2011) Mechanism of chromosomalboundary action: roadblock, sink, or loop? Genetics 187, 731–748.Mellone B, Erhardt S & Karpen GH (2006) The ABCs of centromeres.Nat. Cell Biol. 8, 427–429.Morris SA, Baek S, Sung M-H et al. (2014) Overlapping chromatinremodeling systems collaborate genome wide at dynamicchromatin transitions.

Nat. Struct. Mol. Biol. 21, 73–81.Politz JCR, Scalzo D & Groudine M (2013) Something silent thisway forms: the functional organization of the repressive nuclearcompartment. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 29, 241–270.Rothbart SB & Strahl BD (2014) Interpreting the language of histoneand DNA modifications. Biochim. Biophys. Acta 1839, 627–643.Weber CM & Henikoff S (2014) Histone variants: dynamic punctuationin transcription.

Genes Dev. 28, 672–682.Xu M, Long C, Chen X et al. (2010) Partitioning of histone H3-H4tetramers during DNA replication-dependent chromatin assembly.Science 328, 94–98.The Global Structure of ChromosomesBelmont AS (2014) Large-scale chromatin organization: the good, thesurprising, and the still perplexing. Curr. Opin. Cell Biol. 26, 69–78.Bickmore W (2013) The spatial organization of the human genome.Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 14, 67–84.Callan HG (1982) Lampbrush chromosomes. Proc.

R. Soc. Lond. BBiol. Sci. 214, 417–448.Cheutin T, Bantignies F, Leblanc B & Cavalli G (2010) Chromatin folding:from linear chromosomes to the 4D nucleus. Cold Spring Harb.Symp. Quant. Biol. 75, 461–473.Cremer T & Cremer M (2010) Chromosome territories. Cold SpringHarb. Perspect. Biol. 2, a003889.Lieberman-Aiden E, van Berkum NL, Williams L et al. (2009)Comprehensive mapping of long-range interactions reveals foldingprinciples of the human genome.

Science 326, 289–293.Maeshima K & Laemmli UK (2003) A two-step scaffolding model formitotic chromosome assembly. Dev. Cell 4, 467–480.Moser SC & Swedlow JR (2011) How to be a mitotic chromosome.Chromosome Res. 19, 307–319.Nizami ZF, Deryusheva S & Gall JG (2010) Cajal bodies and histonelocus bodies in Drosophila and Xenopus. Cold Spring Harb. Symp.Quant. Biol. 75, 313–320.Zhimulev IF (1997) Polytene chromosomes, heterochromatin, andposition effect variegation. Adv. Genet.

37, 1–566.How Genomes EvolveBatzer MA & Deininger PL (2002) Alu repeats and human genomicdiversity. Nat. Rev. Genet. 3, 370–379.Feuk L, Carson AR & Scherer S (2006) Structural variation in the humangenome. Nat. Rev. Genet. 7, 85–97.Green RE, Krause J, Briggs AW et al. (2010) A draft sequence of theNeandertal genome. Science 328, 710–722.International Human Genome Sequencing Consortium (2001) Initialsequencing and analysis of the human genome. Nature409, 860–921.International Human Genome Sequencing Consortium (2004) Finishingthe euchromatic sequence of the human genome.

Nature431, 931–945.Kellis M, Wold B, Snyder MP et al. (2014) Defining functional DNAelements in the human genome. Proc. Natl Acad. Sci. USA111, 6131–6138.Lander ES (2011) Initial impact of the sequencing of the humangenome. Nature 470, 187–197.Lee C & Scherer SW (2010) The clinical context of copy numbervariation in the human genome. Expert Rev. Mol. Med.

Характеристики

Тип файла
PDF-файл
Размер
102,35 Mb
Тип материала
Предмет
Высшее учебное заведение

Список файлов книги

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее