Knudsen - A Biologists Guide to Analysis of DNA - 2002

Рге~асе Асйпоы1ей8тепй 1 1пиойисйоп 1.1 Нубпй2айоп 1.2 АуутеМх СепеСЫр ТесЬпо1о8у 1.3 БройейАпауз 1.4 БеПа1 Апа1уяю о1" крепе Ехр~ееиоп (БАБЕ) 1.5 Ехатр1е: Афте~Пх ы. Бройей Аттауь 1.б Биттагу 1. 7 Гитйет Яеайп8 2 Очеичеи о1" Оа1а Апа1уяз 3 Ваяс Па~а Апа1уяь 3.1 АЬво1и1е Меавигетепо 3,2 Беар т8 3.2.1 Ехатр1е: Ыпеак апй Иоп1теат Бсайп8 3.3 Ве~есйоп о1 Оий~ети 3.4 ГоЫ СЬап8е 1 1 3 б 8 9 11 13 17 17 18 20 20 21 соптентБ 83 84 84 87 88 88 91 91 93 12 Кенгве Еп81пеег1п8 оу" йе8и1агогу МепгоАя 7.1 ТЬе Т1те-Бег1еи АрргоасЬ 7.2 ТЬе Бгеайу-Бгаге АрргоасЬ 7.3 Т.1тиаг1от о7" ИегвотК Мойе1т8 7.4 Ехатр1е 1: Бгеайу-Бгаге Мойе1 7.5 Ехатр1е 2: Бгеайу-Бгаге Мойе1 оп Кеа1 ТУага 7.6 Ехатр1е 3: Бгеайу-Бгаге Мойе1 оп Яеа1 Рига 7.7 Ехатр1е 4: Ыпеаг Т1те-Бег1ею Мойе1 7.8 Гигйег Кеай1п8 Мо1еси1аг С1аифегх 8.1 С1авзФсаг1оп Бсйетея 8.1.1 Меагей Ме18ЬЬог 8.1.2 №ига1 №ги ог/и 8.1.3 Биррогг Уесгог МасЫпе 8.2 Ехатр1е 1: С1атфсаг1оп о~Сапсег БиЬгурел 8.3 Ехатр1е П: С1аифсаг1оп о~Сапсег БиЬгурея 8.4 Биттагу 8.5 РиггЬег Кеай1п8 Бе1ешоп оу" Сгепез~ог Брорйп8 оп Аггаук 9.1 Сепе Гтй1п8 9.2 Бе1есиоп о7" йе81от $У1гЬ1п Сгепек 9.3 Бе1есйоп о~Рг1тел 1ог РСЯ 9.4 Бе1есг1оп о7 17пщие 0118отег РгоЬез 9.4.1 Ехатр1е: Р1пй1п8 РСК Рг1тегя Тог Сгепе АГ105374 9.5 Ехрег1тепга1 Пеы8п 9.6 ГиггЬег Кеай1п8 10 йлт1гайот о1 Ехргеяаоп Апа1уии 10.1 Ре1айие Утих АЬю1иге Я1УА Яиапгфсаг1оп 10.2 РиггЬег Кеай1п8 Сепогур1п8 СЫрв 11.1 Ехатр1е: Меига1Ме~чогЫ~ог БепеСЫр ргей1сйоп 11.2 ГиггЬег Кеай1п8 Бо7Ряаге !лией апй Туага гогтагх 63 63 64 65 65 бб 68 68 71 75 76 76 76 76 77 78 79 79 81 82 82 83 83 105 109 1пйех 123 12.1 51апйапМайоп ЕЯот~ь 12.2 Яапйап1 РПе Рогта~ 12.2.1 Ехатр1е: Ята11 Бспрь т Аи4 12.3 5о~Рваее1ог С1их~еппц 12.3.1 Ехатр1е: С1ию~еппи мЫь С1ийАттау 12.4 Бо~ыаге1от БГаптса1Апа1узЬ 12.4.1 Ехатр1е: Б~а~ийса1Апа1уии тй Р 12.4.2 ТЬе аЯК Ко1п~ате Расее 12.4.3 Соттегс1а1 йайи1ся Рас1садеь 12.5 5иттагу 12.6 Гитйет Кеайпе 13 Соттегс1а1 БоЯюа~е РасИаиеи 14 В~Ыюитарйу 9б 97 97 98 99 99 99 103 103 103 104 1 атп ойеп аз!сед, "Ро уоп Ьаче а доод техт 1 сап геад оп апа1уяа оГ РИА атгау дата?*' ТЫа та ап аиешрт ат ргоч!д!пд аисЬ а техт тот ашдепта апд вс!екать а!1!ге ччЬо чепшге што йе Ье1д оГ РЫА аггау дата апа1уяа Гог йе агат типе.

ТЬе Ьоо1т !а вг!ттеп !ог Ыо1одтатз тч!Йоит ареста! тгаиипд ш дата апатуяа апд ататтзттся Майешадса1 атг!пдепсу 1а аасг!йсед тог шти!т!че апд чтаиа1 штгодпсдоп от' сопсертя Бипр!е во!и!топя аге ешрЬааткед ччЬеге пюге сошр!!сатед ьо1пт!опа шау Ье пюге соггест. МетЬода аге штгодисед Ъу з!шр1е ехашр1еа апд сЬадопз от' ге1ечапт 1!тегатиге. Ргаст!са! сошритег ао1ит!опа то сопипоп апа1уа!а ргоЫеша аге апддеяед, чдй ап ешрЬаяв оп вотттчаге дече!пред ат апд шаде йее1у ача!1аЫе Ьу шу оччп!аЬ. ТЬе техт ешрЬаа!хеа депе ехргеааюп апа1уяя ТЬ!з техт та!тех очес ччЬеге Йе ипаде апа1уа1а зоттччаге Йат иаиа11у сошек чч!тЬ РИА аггау ет!птршепт 1еачез уоп: чьей а й1е от ядпа1 !птепят!еа апд то1д сЬапде сошрагед то а соптго1. ТЬе !птоппат!оп ш йат 61е ъч!11 ргошрт ттиеат!опа апсЬ ая Нотч 1а Ь аса1ед? ЖЬат !а йе еггог ш йе дата? %Ьеп сап 1 аау йат а сегта!п депе 1а ир-геди1атед? %Ьат до 1 до чч!й йе йоиаапда от'депеа йат ьЬотч аоше геди1атюп? Нотч шисЬ ш!оппатюп сап 1 дет опт от' тпу дата? Т1пз техт А!1 апешрт то апатчег тЬоае т!иеат!опа апд ойега Йат е!!! сотпе !ото ш!пд аа уои де1че тигйег што йе дата.

1п1ГОЙис110п 1Л НУВЯ1Р1ЮТЮЬ! ТЬе Гипдашепга! Ьаяа оГ РЬ!А ш1сгоаггаув !а йе ргосеаа оГ ЬуЬпд1гаг!ол. Ти о РХА ягапда ЬуЬпд!ге 1!' йеу аге сошр1ешепгагу со еасЬ ойег. Опе ог Ьой ягапда оГ йе РЬ!А ЬуЬпд сап Ье гер1асед Ьу КХА апд ЬуЬпд1хабоп и611 аг!11 оссиг аа 1опд аа йеге ь сошр1ешепгапгу. НуЬпд1кабоп Ьаз !ог десадеа Ьееп гьед ш пю1еси!аг Ыо1оду аа йе Ьаяа Гог аисЬ сесЬп!г!иез аа Яоийегп Ыогдпд апд Ь!оггЬегп Ыосг!пд. 1п БоигЬегп Ыогг1пд, а япа11 а!пил о!' РХА, ап о!!голис1еог!де, ь гьед го ЬуЬпд1ке го сошр!ешепгагу Ггаишепга оГ РЬ!А йас Ьаче Ьееп зерагагед ассогд!пд со яке !и а ае! е1есггорЬогеяв.

1Г йе о11допис1еодде ь гад!оасг1че1у 1аЬе1ед, йе ЬуЬпд!гаг!оп сап Ье ч!аиа1ыед оп а рЬосоигарЫс 61ш йаг 1а аепа!6че со гад!аг!оп. 1п Ь!оггЬегп Ыогдпд, а гад!о1аЬе1ед о11иопис1еог!де ь гьед го ЬуЬ661ге го шеааепдегКЬ!А йаг Ьаа Ьееп шп йгоицЬ а де1. 1Г йе о!!до ь прес!6с со а а!пд!е шеааепдег КЬ!А, йеп Ь ид11 Ьгпд го йе 1осабоп (Ьалд! о1 гЬас гпеааепдег !и йе де1. ТЬе апюипг оГ гад!аг!оп саргигед оп а рЬогодгарЫс 6!ш ь дерепдепг со аоше ехгепг оп йе апюипг о!'гад!о1аЬе!ед ргоЬе ргезепг гп гЬе Ьапд, иЫсЬ ада!и ь дерепдепг оп йе апюипг оГ шеааепдег.

Яо гЬ1а шейог1 ь а кепнс!иапг!габче дегесдоп оГ !пд!ч!диа! шеааепдегя РЬ!А аггаув аге а шааяче!у рага!1е1 чегяоп оГ Ь!оггЬегп апд БоигЬегп Ыосг1па. 1пяеад оГ 61агпЬиг!пд йе о!1допис1еог1де ргоЬеа очег а де! сопга1п!пд зашр1еа оГ КЬ!А ог РЬ!А, йе о!!иопис1еог!де ргоЬеа Ьаче Ьееп !шгпоЫ!иед оп а аигГасе. ТЬеу сап Ье шппоЫ!!гед аг ш1сгошегег 61яапсез, ао К !а роаяЫе го р1асе шапу 616егепг о!1цопис1еог!де ргоЬез оп а япа11 япд1е аигХасе оГ г ггчтгговисггоч 750 250 !996 !997 !998 !999 2000 2001 геуд. 1.1 ТЬе ппгпЬег оГ рпЫ!аЬег$ рарегк геуегпп8 го ОЬ!А ппсгоаггаук.

Ореп Ьага; Мегг!!пе аеагсЬ Гог сЛе где гчогг$ "пнсгоапау." С!озег! Ьыз; Ь!пгпЬег оГ рарега с!ппа АГГупгеп!х бепеСЬ!р гесЬпо!оау. опе ас!паге сепгппесег. 1пзгеас! 01 гайоасг1че 1аЬе!шд, йе аашр1е 1а гьиа!1у 1аЬе!ег! хч11Ь а !1погезсеп! дуе йа! сап Ье де!ее!ей Ьу а ИдЫ асаппег йа! асапз гЬе апгГасе оГ йе сЬгр гог ЬуЬг1с!1хес! шагепа1. 9!гЬеге ЬеГоге Ь и аа роаяЫе го пш а сопр1е оГ Ь!оггЬегп Ыога ог а сопр1е оГ ЗопгЬегп Ыогв ш а с1ау, Ь ь пои роаяЫе чч1гЬ РХА а!гауз го гпп гепз оГ йопаапс!а оГЬуЬг1йгаг1опз. ТЬь Ьаа гп поше пеппе гечо!ппоп12ес! шо1есп1аг Ьго1оду апг! шейс1пе.

1пагеас! 01 агпг!у1пд опе депе апс! опе шеааепдег а! а йпе, ехрепшепга1ьь аге похч агпдушд пгапу депеа апг! шапу гпеааепдеь а! йе хаше йпе, 1п 1асг, РЬ!А аггауа аге 01геп паед со а!оду аП 1гпоччп гпеааепдега 01 ап огдашяп. ТЬь Ьаа орепес! йе роаяЫ!1гу 01 ап епг1ге1у пехч, вуагепнс ч1ехч оГ Ьочч се!18 геас! гп гекропзе го сеггагп аг1пш!1. И 1а а1ао ап епг1ге1у пеи ччау го к!ос!у Ьщпап с!!аеас Ьу ч1еи'1пд Ьоиг Ь аг1есга йе ехргеаа1оп оГ а11 депеа 1пв1с!е йе се11.

Ядвиге 1.1 г11гьггагеа йе гечо1пгюп оГ РЬ!А ытауа ш Ью1оду апг! шег11с1пе Ьу йе пшпЬег 01 рарега рпЫ18Ьег! оп йе гор!с. 'гч'Ьеп РЬ!А ппсгоаггауа аге паес! Гог шеаапг1пд йе сопсепггапоп оГ шеазепдег Кй!А гп 11ч1пд се11я а ргоЬе оГ опе РЬ1А аГгапг! йа! шагсЬеа а рагг1сп1аг шеааепдег гх!!А гп йе се11 ь паед. ТЬе сопсепггагюп 01 а рагг1сп1аг шеааепдег ь а геап!! 01 ехргеаяол 01 рь соггеаропйпд депе, ао гЫа АРРУМЕГЯСХ ВЕНЕСНГР ГЕСННОСОО У 3 арр!1сассоп ь ойеп гегеггед со аа ехргеегдол ала!ухи.

'чсгЬеп йСТегепс ргоЬеа шассЫпд а!1 шеааепдег КМАа сп а се1! аге ыед, а апарз1юс ог йе соса! шеааепдег КМА роо1 оС а 11чспд се11 ог с!алие сап Ье оЬсаспед. ТЫа са ойеп гегеггед со аз ап ехргеегдол ргали!е Ьесаые И ге(сесса йе ехргеаяоп оС ечегу япд!е шеааигед депе ас йас рапсси1аг пюшепп Ехргееяоп рго61е ь а1ао аошейпеа ыед Со деаспЬе йе ехргееаюп оГ а япд1е депе очег а пшпЬег ог сопйдопя Ехргеаяоп апа1уяк сап а1ао Ье регГоппед Ьу а шейод са11ед ееПа! алас- уеЬ оу деле ехргееесол ($АБЕ). !пасеад оС ышд писгоаггауя ЯАОЕ ге11еа оп сгадпюпа1 РМА аес!иепсспд со Ыепсс(у апд епшпегасе йе пшпЬег оС шеааепдег КМАа 1п а се11 (Зесдоп 1.5). Апойег сгайсюпа! арр!ссасюп ос РМА пнсгоаггауа ь со десесс шисассоп ш аресйс депеш ТЬе шааяче1у рага11е1 пашге оГ РМА пнсгоаггауа а1!ова йе япш1сапеоы асгеепспд оС' шапу, 1с пос а11, розяЫе шисассопа вссЫп а япд1е депе.

ТЫа ь гегеггед со аа делосуржд (Бесс!оп 11). ТЬе сгеаипепс оС апау дага доеа пос дерепд ао пшсЬ оп йе сесЬпо1оду ыед со дайег йе дага аа Ь дерепда оп йе арр!1сассоп ш с)иеассоп. Оепосурспд апс1 ехргеаяоп апа1уяа аге сво сошр1есе1у ййегепс арр11садопя апд йеу в!11 Ье сгеасед аерагасе1у 1п йь сехс. Моас ос йе 1пГоппасюп в!11 асЫгееа апа1уа!з ос ехргееяоп дага, апд а аерагасе сЬарсег в!11 аддгеаа депосурспд сЫря Рог ехргеяяоп апа!уяа йеге аге сво пщог сесЬпо!од!ее ача11аЫе.

ТЬеге ь йе Айушеспх, !пс. ОепеСЫр ауасегп, вЬ(сЬ изеа ргеГаЬпсасед о11допис1еосЫе сЫра (Рсдиге 1.2 апд 1.3), апд йеге аге сияогп гпассе сЫра вЬеге а гоЬос ь ыед со арос сРМА, оддопис1еосЫея ог РСК ргодисса оп а д1ааа а!Ые (Есдиге 1.4). 1.2 АЕЕТМЕТВ1Х 6ЕМЕСН1Р ТЕСНМО~ООТ АСТушеспх паем ес!шршепс япи1аг со йас вЫсЬ ь ыед Гог ша)сспд ядсоп сЫра Сог сошриСегя апд йиз а11ова шаеа ргодисгсоп оС чегу 1агде сЫра ас геааопаЫе соас.

Ъ'Ьеге сошршег сЫра аге шаде Ьу сгеасспд шах!са йас сопсго! а рЬосо1сйодгарЫс ргосесь Сог гепюча! ог дерояс ог шасепа1 оп йе сЫр хиласе, Ассушесгсх паек шаа1са со сопсго1 аупсЬеяа оС' о11допис!еосЫеа оп йе аигсасе оС а сЫр. ТЬе асапдагд рЬозрЬогашсйсе шейод Сог аупсЬеяа ос о!1допис1еосЫеа Ьаа Ьееп шойссед со а11ов!сдЫ сопсго1 оГ сЬе спйчЫиа! яеря ТЬе гпаа!са сопсго! йе аупсЬеяа ос аечега! Ьипдгед сЬоизапд ас(иагея еасЬ сопсасшпд шапу сорсеа ос" ап о!!до. Яо йе гехи!с 1а аечега! Ьипдгед йоыапд йсТегепс о!!доя еасЬ ос йеш ргеаепс сп ш11!юпа ос сорсея ТЬас 1агде пшпЬег ог ойдок, ир со 25 пис1еосЫез 1опд, Ьак сигпед ош со Ье чегу ыесЬ1 аз ап ехрепшепса1 соо1 со гер1асе а11 ехрепшепса1 десесдоп ргоседигеа йас ш йе раас ге1сед оп ияпд о11допис!осЫея ЯоисЬегп, Могйегп, апд с!ос ЫоШпд аз ве11 аа аес!иепсе арессйс ргоЬспд апсс шисассоп ссесессюп.

4 1ГЧТРГООУСТЮГЧ Г ТОТОАТООТОООААТТОООТСАОАА66АСТОТООСТАООСОСТОСС... ООААТТОООТСАОААООАСТОТООС Рсггесг пгагсЬ о1ц;о 66С Мпгпагсп о1гао Реггесг гпагсЬ ргоЬе се!1а М1апгагсЬ ргоЬе се1!а Руга. 1.2 ТЬе АГГугпегг1а бепеСЫр гесЬпо!о у. ТЬс ргеаепсе оугпеааепксг йЫА1а г1егесгег! Ьу а аепеа оу ргоЬе ра1га йаг г11ГГег гп оп!у опс ппс!соби. НуЬг141гаг1оп оу 11оогеасепг гпеааепаег йЫА Го йеас ргоЬе райа оп йе сйр 'ь г1еГесгег! Ьу 1ааег агапа!па оу йе сЬ!р апгуасе. (Р! пге Ьу СЬг1агоууег Вго.) Рог ехргеаяоп апа1уяя ир го 40 о11доа аге гьег1 Гог йе г!егесг)оп оГ еасЬ депе. Айутептх Ьаа сЬоаеп а гед)оп о!' еасЬ депе 1Ьаг (ргеяппаЫу) Ьаа йе!еая япн1апгу Го огЬег депеа, Ргот йь гед1оп 1! — 20 о11дох аге сЬоаеп аа регЕесг тагсЬеа (РМ) (1.е., регГесг!у согпр!степ!агу со йе тКХА оГ йаг депе).