Диссертация (1140384)
Текст из файла
Федеральное государственное автономное учреждение«Национальный медицинский исследовательский центр здоровья детей»Министерства здравоохранения Российской ФедерацииНа правах рукописиБочарова Юлия АлександровнаМолекулярно-генетические механизмы устойчивостиPseudomonas aeruginosa к антибиотикам группы карбапенемов03.02.03 - МикробиологияДиссертация на соискание ученой степеникандидата медицинских наукНаучный руководитель:доктор медицинских наукЧеботарь И.В.Москва - 20182СОДЕРЖАНИЕВВЕДЕНИЕ……………………………………………………………………4ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ …………………………………………………………17Глава 1.
Обзор литературы. Механизмы резистентности Pseudomonasaeruginosa к антибиотикам и их регуляция………………………………….171.1. Природная резистентность………………………………………………181.2. Приобретенная резистентность…………………………………………201.3. Как приобретается и регулируется резистентность……………………461.4. Оценка антибиотикорезистентности …………………………..……….50Глава 2. Материалы и методы исследования ……………………………….572.1 Штаммы микроорганизмов……………………………………………… 572.2 Бактериологические методы…………………………………………….582.3 Молекулярно-генетические методы…………………………………….612.4 Статистические методы………………………………………………….64Глава 3.
Роль бета-лактамаз в формировании нечувствительностиPseudomonas aeruginosa к антибиотикам группы карбапенемов…………..653.1. Введение к главе………………………………………………………….653.2. Материалы и методы, использованные для оценки роли бета-лактамазв формировании нечувствительности Pseudomonas aeruginosa ккарбапенемам………………………………………………………………….663.3. Результаты и обсуждение………………………………………………...70Глава 4. Роль порина OprD в формировании нечувствительностиPseudomonas aeruginosa к антибиотикам группы карбапенемов…………..854.1. Введение к главе………………………………………………………….8534.2. Материалы и методы, использованные для оценки роли порина OprDв формировании нечувствительности Pseudomonas aeruginosaк карбапенемам………………………………………………………………...
854.3. Результаты и обсуждение………………………………………………...89Глава 5. Роль эффлюкс-систем в формировании нечувствительностиPseudomonas aeruginosa к антибиотикам группы карбапенемов………….. 1055.1. Введение к главе……………………………………………………………..1055.2. Материалы и методы, использованные для оценки ролиэффлюкс-системы в формировании нечувствительностиPseudomonas aeruginosa к карбапенемам…………………………………… 1055.3.
Результаты и обсуждение…………………………………………..........108Глава 6. Комплексная оценка механизмов резистентности Pseudomonasaeruginosa к карбапенемам………………………………………………….116ЗАКЛЮЧЕНИЕ……………………………………………………………….. 126ВЫВОДЫ……………………………………………………………………… 138ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ……………………………………… 140ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ………………… 141СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ…………………………………………………… 142СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ…………………………………………………….. 1434ВВЕДЕНИЕАктуальность темы диссертационного исследованияСинегнойная палочка Pseudomonas aeruginosa является одним из самыхактуальных оппортунистических патогенов, что позволило включить ее вгруппу «ESKAPE»1, объединяющую шесть самых опасных условно-патогенныхбактерий для населения развитых стран [43]. Частота ее обнаружения в кровипри сепсисе составляет примерно 20%, в мокроте при муковисцидозе инозокомиальных пневмониях – 45-70%, в экссудатах при интраабдоминальныхинфекциях – 28%, в моче при госпитальных уроинфекциях – 10% случаев [7,48, 70, 72, 101, 150, 193].
В общей этиологической структуре госпитальныхинфекций доля P. aeruginosa варьирует в диапазоне от 20 до 30% [21, 238].Опасность синегнойной палочки обусловлена не только широким спектромпатогенетических факторов и генетической пластичностью, самым негативнымсвойствомP.aeruginosaявляетсяспособностьбыстроприобретатьрезистентность к разным группам антибиотиков [8].Распространение резистентных штаммов синегнойной палочки достиглоглобальных масштабов. Нозокомиальные штаммы P. aeruginosa, изолированныев России в 2013-2014 гг., в 52-60% случаев были нечувствительны кантисинегнойным цефалоспоринам (цефепим, цефтазидим), в 58% случаев – кпиперациллину-тазобактаму, более чем в 60% случаев, – к фторхинолонам,более чем в 50% случаев, – к аминогликозидам, в 41% случаев – к азтреонаму[21].Фенотипоммножественнойрезистентности(устойчивостикантибиотикам, принадлежащим как минимум к трем различным категориям)обладали 83% изолятов, фенотип экстремальной резистентности (устойчивостик препаратам всех, за исключением одной или двух категорий антибиотиков)присутствовалу51%изолятов,обнаруженштаммсфенотипомТермин «ESKAPE» объединяет группу бактерий и является аббревиатурой от первых буквродовых наименований бактерий, входящих в эту группу: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus,Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и виды рода Enterobacter.15панрезистентности [21].
По данным Центров контроля и профилактикизаболеваний США (CDC), на территории США регистрируется более 50000случаев тяжелой синегнойной инфекции в год, 13% из которых связаны смультирезистентными формами P. aeruginosa [57]. Экономический ущерб отпатологии, вызванной мультирезистентными формами P. aeruginosa, составляетв США более 116 миллионов долларов в год. В зависимости от локальныхусловий госпитальная резистентность P.
aeruginosa к отдельным группамантибиотиков может достигать почти 100%. Например, в 2015 году в одном изиранских госпиталей (Исфахан) 95% изолятов от ожоговых больных былирезистентны к амикацину, 96% из них проявляли мультирезистентность [202]. Всвязисвысокойфторхинолонам,распространенностьюантисинегнойнымштаммов,пенициллинамирезистентныхкцефалоспоринам,карбапенемы нередко остаются единственным доступным средством длялечения синегнойных инфекций.
В ответ на применение карбапенемовсинегнойная палочка реагирует формированием резистентности к наиболеечасто применяющимся представителям этого класса антибиотиков – имипенемуи меропенему. Данные мониторинга говорят о том, что распространенностькарбапенемрезистентных штаммов P. aeruginosa растет [21]. Опасностьустойчивых к карбапенемам форм синегнойной палочки подтверждаетсястатистически: в условиях современного госпиталя погибает треть всехпациентовсинвазивнойинфекцией,еслипроцессвызванкарбапенемрезистентными штаммами P. aeruginosa [63].Перечисленные факты доказывают важность изучения инфекционнойпатологии, связанной с карбапенемрезистентными штаммами P.
aeruginosa, длясовременного здравоохранения. Решение этой проблемы, включающее в себямониторингрезистентности,рационализациютерапии,проведениепротивоэпидемических мероприятий, может быть достигнуто только на основесовременных диагностических технологий, направленных на идентификациювозбудителя и развернутую оценку его устойчивости к антибиотикам, включая6карбапенемы.Расшифровкамолекулярно-генетическихмеханизмовустойчивости P. aeruginosa к карбапенемам, основанная на внедрении вдиагностические процедуры новых бактериологических, генетических и массспектрометрическихтехнологий,являетсяактуальнымнаправлениемсовременной медицинской науки.Степень разработанности темы диссертационного исследованияГоворя о «медицинской» истории синегнойной палочки, нужно отметить,что еще в 1912 году Л.А. Тарасевич пророчески предупреждал о возможности«завоевания синегнойной палочкой хирургических отделений» [17].
Хотяслучаи синегнойной инфекции были описаны еще в конце 19 в., ее клиническоезначение долгое время не принималось всерьез. Только во второй половине 60х годов 20-го века началось активное изучение синегнойной палочки какопасного оппортунистического патогена [1]. Примерно в это же времябактериологи обратили внимание на необычно высокую степень природнойустойчивостиP.кaeruginosaантибиотикамантибиотикорезистентностьсинегнойнойпараллельновантибиотиков.свнедрениемВчастности,широкоепоявление[240].палочкиэволюционировалаиспользованиепервыхПриобретеннаяновыхклиническихклассовизолятов,устойчивых к карбапенемам, было зарегистрировано в начале 80-х годовдвадцатого столетия [190].В настоящее время проблема инфекций, связанных с P.
aeruginosa,является предметом изучения многих исследовательских коллективов: согласнобазе данных PubMed, по этой теме в мире ежегодно публикуется более 3000научных работ [164]. Не имея возможности перечислить все научные группы,работающие с синегнойной палочкой, следует упомянуть самые известные изних.ВИнститутемолекулярнойбактериологии(Ганновер,Германия,руководитель исследований – доктор A. Lorenz) разрабатываются модели для7оценки межмолекулярных взаимодействий между P.
aeruginosa и клеткамимакроорганизма при развитии инфекционного процесса, в том числе, вусловиях воздействия антибактериальных препаратов [139, 186]. КоллективКлинического госпиталя Барселоны (руководитель исследований – доктор J.A.Martinez) сосредоточил свои изыскания на поиске новых ингибиторов беталактамазсинегнойнойпалочки[145,247].ВЦентремолекулярноймикробиологии и инфекций (Императорский медицинский колледж, Лондон,Великобритания, руководитель исследований – доктор A. Filloux) изучаетсябиопленочная резистентность P.
aeruginosa [233]. В клинике УниверситетаЦинциннати (штат Огайо, США, руководитель исследований – доктор J.P.Clancy) исследуется роль трансмембранного транспорта антибиотиков вформировании антибиотикорезистентности [152]. Темы научных трудов,публикуемыхперечисленнымиколлективами,концентрируютсянаисследовании генетических детерминант резистентности, их регуляции ипередаче.
Синегнойная палочка является постоянным объектом международныхпрограммпомониторированиюнозокомиальныхпатогеновиихрезистентности.В России несколько научных коллективов активно занимаются проблемойсинегнойной инфекции ирезистентностиP. aeruginosa. Перманентноеисследование распространения резистентных штаммов бактерий, включая P.aeruginosa,осуществляетсяврамкахпрограммыМАРАФОН,координирующейся обществом «Межрегиональная ассоциация по клиническоймикробиологии иантимикробной химиотерапии» (НИИ антимикробнойхимиотерапии, Смоленск, научная школа проф. Р.С.
Характеристики
Тип файла PDF
PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.
Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
