Диссертация (1139782), страница 5
Текст из файла (страница 5)
Компонент 16sсубъединицы бактериальной рРНК оказался наиболее рациональным для анализа,потому что его нет ни у эукариот, ни у архей — он характерен только длябактерий [36]. Приняв за точку отсчёта 16S рРНК, получилось отделятьконкретный генетический материал одних бактерий от других. Рибосомы и РНКприсутствуют во всех без исключения клетках, а также в некоторых органеллахэукариот (митохондрии, хлоропласты). Их функции всегда одинаковы (синтез25белка), а первичная структура консервативна. Так же рРНК находятся внедействия естественного отбора, поэтому молекулы эволюционируют только врезультате спонтанных мутаций, и количество этих мутаций может служитькритерием эволюционного расстояния между организмами. Секвенирование(выяснение последовательности нуклеотидов) участков 16S рРНК позволяетопределить таксономическое положение микроорганизмов.С тех пор какисходная 16S рРНК была положена в основу филогении после описания её в 11бактериальных филах (типах) в 1987 году, базы данных начали активнопополняться новыми разновидностями бактерий.
Кроме того, помимо известныхнам понятий «вид» и «штамм», появился термин «филотип». По современнымпредставлениям, вид в микробиологии — это совокупность микроорганизмов,имеющих общее эволюционное происхождение, близкий генотип (высокуюстепень генетической гомологии, как правило, более 60%) и максимально близкиефенотипические характеристики. А вот штамм —это чистая культура вирусов,бактерий (или культура клеток), изолированная в определённое время вопределённом месте с генетической гомологией около 100%.
Совсем недавнобыло доказано, что из трёх филотипов гарднерелл с баквагинозом ассоциированытолько два, а третий может безвредно существовать во влагалище, не вызываябактериального вагиноза [16]. Новые данные говорят о том, что микроорганизмы,населяющие отдельные части тела, в том числе мочевыделительные пути,которые уже давно считались стерильны и у здоровых людей- могут игратьопределенную роль в поддержании здоровья мочевыделительной системы [115].В 2012 году было опубликовано исследование, проведенное Huma Siddiqui исоавторами в университетской клинике Осло (Department of Biology, Centre forEcological and Evolutionary Synthesis (CEES), University of Oslo), которыми быларазработана методика изучения основных микробных популяций в моче женщин,основанная на выделении ДНК, и исследовании ПЦР гена 16S рРНК споследующим 454 секвенированием и применением анализов с использованиемсредств биоинформатики (Siddiqui и соавт., 2011) [53].
Исследователи показали,26что в моче здоровых женщин (ЗЖ) присутствует множество различных бактерий.Нормальнаямикрофлорачеловеческоймочивключаетразличныемикроорганизмы, в том числе требовательные к питательной среде и анаэробные,среди них есть и условно-патогенные [53, 61,74,114]. Авторы применили этиметодики в проспективном исследовании для описания микрофлоры мочипациенток с СБМП/ИЦ. Они также провели сравнительный анализ междурезультатами секвенирования у пациенток с СБМП/ИЦ и ранее проведенногосеквенирования у ЗЖ, чтобы определить степень различия бактериальныхпрофилей [53]. Секвенирование 16 родов выявило, что микрофлора мочи больныхСБМП/ИЦ представлена 22 разными видами микроорганизмов: на уровне рода,общее секвенирование выполнялось для выделения 31 разного рода.
РодLactobacillus был наиболее распространен в обоих наборах данных и составил вцелом 92% секвенирований. Gardnerella и Corynebacterium были вторыми почастотевстречаемостиродамибактерийсраспространенностью2%секвенирований каждый. Другие 28 родов бактерий, обнаруженных в мочеСБМП/ИЦ, составляли только 2% всей бактериальной микрофлоры мочи больныхСБМП/ИЦ. Результаты 16S рРНК секвенирования демонстрируют сдвигмикроорганизмов в составе микрофлоры мочи при СБМП/ИЦ, в отличие отрезультатов исследования мочи ЗЖ.
Сниженное разнообразие и богатствомикрофлорысопровождаетсяболеевысокойпопуляциейбактерийродаLactobacillus, Gardnerella и Corynebacterium у больных СБМП/ИЦ по сравнению смочой ЗЖ. Данное исследование демонстрирует, что высокопроизводительноесеквенирование микрофлоры мочи у пациентов с СБМП/ИЦ – это мощный метод,возможно, помогающий лучше понять этиологию этого загадочного заболевания.Однако, роль инфекционного процесса в патогенезе СБМП/ИЦ остается неясной(Elbadawi 1997; Elgavish и соавт., 1995). Возможно, инфекционный агент играетроль пускового фактора: он повреждает стенку мочевого пузыря, вызываяразвитие аутоиммунных процессов и каскад патофизиологических реакций [52].27НеобходимотакжепомнитьотакназываемыхL-формахбактерий-изменённые формы бактерий, характеризующиеся полной или частичной потерейклеточной стенки, полиморфизмом микроструктур, формирующих колонии,сложными и многообразными механизмами воспроизводства, способностью кстабилизации и реверсии в бактериальные культуры.
Они могут даватьотрицательные посевы мочи, вследствие хрупкости и роли протопластов и L–форм микроорганизмов. L–формы более устойчивы к внешним воздействиям, нерастутнаобычныхпитательныхсредах,поэтомуихоченьтрудноидентифицировать. Установлена возможность развития L–форм практически увсех видов микроорганизмов, участвующих в развитии пиелонефрита [22]. Былопоказано, что L-формы возникают спонтанно или индуцированно - подвоздействиемагентов,блокирующихсинтезклеточнойстенки: антибиотиков (пенициллины, циклосерин, цефалоспорины, ванкомицин),ферментов (лизоцим, амидаза, эндопептидаза)ультрафиолетовых и рентгеновскихлучей, аминокислоты глицина [8].К одним из таких форм бактерий относится и Corynebacterium spp.
[73].Коринеформные бактерии представляют собой большую, таксономическиразнородную, плохо изученную группу грамположительных микроорганизмов.Полиморфныепалочковидныеграмположительныемикроорганизмы,относящиеся к классу Actinobacteria, объединенные по 16S рРНК. Палочкибывают изогнутыми, овальными, укороченными; имеют метахроматическиевключения. Существует более 30 видов. Проведенные хемотаксономическиеисследования позволили найти общие черты среди коринеформных бактерий вцелом, а также дифференцировать между собой отдельных их представителей.Для выделения Corynebacterium spp., в чистой культуре пока нет единойпитательной среды [5,17].
В настоящее время коринеформные бактерии включают19 родов на основе хемотаксономических признаков. По мере накопления знанийтаксономическоеположениемногихвидовпересматривается.Средипредставителей коринеформных бактерий имеются клинически значимые роды28или виды отдельных родов (Corynebacterium, Microbacterium, Arthrobacter,Brevibacterium, Dermabacter, Cellulosimicrobium, и др.)Microbacteriumparaoxydans-представителькоринеформныхбактерий,открытый в 2003 году. Клинически значимые роды или виды отдельных родов:Corynebacterium, Microbacterium, Curtobacterium, Leifsonia и др., клиническоезначение для человека имеют: М. oxydans, M. paraoxydans, M. aurum, M.
lacticum.Чаще всего они выделялись от больных инфекционными процессами различнойлокализации. Для колоний Microbacterium, как и для всех коринебактерий,характерна вариабельная чувствительность их к антибактериальным препаратам.[39]. Некоторые умеренные фаги конвертируют нетоксигенные штаммы ктоксигенности (С.diphteriae, ulcerans, ovis), продуцируют токсин и имеют гентоксигенности “tox+ген”. Токсичное действие Corynebacterium spp., реализуетсяна последнем этапе инфекционного процесса. Ему предшествуют этапывнедрения бактерий в организм.
Инвазивность присуща всем коринебактериям,способным существовать в организме человека и животных [21]. В 1985 г.установлено, что представители C. urealyticum - довольно распространенныевозбудители инфекций мочевых путей, в том числе острого и хроническогоцистита и пиелонефрита [15]. Эти бактерии очень похожи на Corynebacteriumjeikeium. При этом у больных хроническим циститом трипельфосфатыоткладываются в язвах мочевого пузыря, и возникает инкрустирующий(щелочной) цистит.
Инфекции, вызываемые Corynebacterium spp, не имеютпатогномоничных клинических признаков. В зависимости от биологическихособенностей разные виды коринебактерий способны поражать кожу ивнутренние органы. Многие представители коринебактерий становятся причинойэндокардитов, пневмоний, септического артрита и остеомиелита, инфекций припротезировании, заболеваний мочеполовой системы [42, 67].
Факторами рискаинфекции мочевых путей, вызываемой представителями C.urealyticum, C.jeikeium,служатослаблениеиммунитета,урологическиеоперации(втомчислетрансплантация почки), болезни мочевых путей (в том числе инфекционные) [62].29Многих представителей Corynebacterium spp. при стандартном посеве мочи, какправило, выделить не удается. Нужно использовать специальные среды иинкубировать посевы в течение как минимум 5-7 суток.
Такие посевы показаныприналичиищелочнойреакциимочи,трипельфосфатныхкамней,грамположительных палочек в моче и отрицательных результатах стандартногопосева мочи на фоне клинической картины инфекции мочевых путей [4].Представители коринебактерий часто бывают устойчивы к антимикробнымсредствам, которыми обычно лечат инфекции мочевых путей. C.
urealyticum иC.jeikeium строгие патогенные аэробы, и являются мультирезистентными кантибактериальной терапии [40, 51, 93].В связи с этим в клинической практике необходима точная идентификациябактерий данной группы, что позволит правильно и своевременно выбратьэтиотропнуютерапию.Однако,внастоящеевремяфенотипическаяидентификация большинства видов коринебактерий затруднена из-за отсутствияинформативных диагностических схем, а также из-за дефицита оперативныхсведений о роли их в патологии человека и животных [39].1.6Лечение СБМП/ИЦВ связи с тем, что этиология и патогенез СБМП/ИЦ, на сегодняшний день,остаются не до конца изученными, лечение пациенток с данным заболеваниемявляется весьма сложной задачей.
Единых подходов к лечению данногозаболевания не существует. Многочисленные противоречивые взгляды напричины возникновения, отсутствие единых подходов к оценке выявленныхнарушений,нередкоприводиткодностороннейтрактовкеклиническихпроявлений и выбору неадекватной тактики лечения [23].
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
