Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1103938), страница 7

Файл №1103938 Диссертация (Моделирование спонтанного формирования гомохирального мира в низкоконцентрированных растворах трифторацетилированных аминоспиртов) 7 страницаДиссертация (1103938) страница 72019-03-14СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 7)

Для этогозабирался объём ~5 мкл раствора, нагретого до визульно гомогенного состояния,и наносился в виде капли на предметное стекло, и после испарения растворителя37образовавшийся образец исследовался с помощью оптического микроскопаМИКМЕД-6.ОпределяласьконцентрациярастворенногоТФААС(в гомохиральных и рацемических растворах) или концентрации обоихэнантиомеров (в гетерохиральных растворах), ниже которых струн в сухомобразце практически не было, а выше которых происходило их интенсивноеобразование.Проводилась порошковая дифрактография высушенных растворовТФААС с использованием модернизированного рентгеновского дифрактометраДРОН-3 (Россия) с медным антикатодом (λ = 1,54 Ǻ) при напряжении 30 кВ исиле тока 20 мА (фильтр Ni). Исходный образец помещался в плоскуюстеклянную кювету диаметром 10 мм и глубиной 1 мм, которая ставиласьв режиме отражения под плоскопараллельный пучок рентгеновских лучей.Эксперимент проводился при комнатной температуре.Проводилосьисследованиединамическогорассеяниясветас использованием пробных частиц: золотых наночастиц размером 10 нм исеребряных наночастиц размером 20 нм.

Использовался анализатор размеровчастиц Zetasizer SZ Nano (изготовитель – Malvern Instruments Ltd.) с длиной волнызондирующего излучения 633 нм. Исследуемые образцы нагревались в водянойбане до 70˚C, затем охлаждались до 20˚C погружением в воду, и после этогопроводились измерения.Производился расчет энергии связи пар одинаковых молекул ТФААСдляТФААС-1–ТФААС-8.Вначалегеометрияодиночноймолекулыоптимизировалась полуэмпирическим квантово-химическим методом АМ1 (пакетпрограмм HyperChem 8.0.8) [136], и рассчитывалась ее энергия. Затемрассматривалось сближение двух молекул.

Их взаимное расположение ивнутренняя геометрия также оптимизировались методом АМ1, и рассчитываласьэнергия комплекса. Для определения энергии связи молекул, из энергиикомплекса вычиталась удвоенная энергия молекулы.Проводился расчет методом молекулярной динамики (МД) структурыорганических растворителей, а также супрамолекулярной структуры растворов38ТФААС.

Использовался пакет GROMACS 4.5.5 [137,138] в сочетании с силовымполем OPLS-AA [139]. В качестве уравнений движения были использованыуравнения стохастической динамики в форме Ланжевена, с заданным трением итепловымшумом[137],шагинтегрированиясоставлял0.5фс.Длятермостатирования системы был использован комбинированный термостат(модифицированныйтермостатБерендсена)[137].Длярасчетовдальнодействующих электростатических взаимодействий был использован методPME [140,141] со стандартным набором параметров (шаг сетки – 1.2 Å, порядокполиномов интерполяции – 4).

Для расчёта дисперсионных сил и списковсоседних атомов использовали радиус обрезания 1.25 нм. Все расчеты проведеныв периодических граничных условиях, при 300 °K и постоянном изотропномдавлении в 1 или 10 атм.Квантовохимические (КХ) расчеты были проведены при помощи пакетаFireFly [50], основанном на исходном коде GAMESS US, в базисе 6311*+ методомDFT (функционал B3LYP5). Расчет суммарного электростатического потенциалавокруг молекул также был проведен при помощи пакета FireFly. Значенияпарциальныхзарядовбылискорректированысогласноаппроксимацииквантовохимического электростатического потенциала молекул точечнымизарядами (RESP [143]).39Глава 3. Основные результаты и их обсуждение3.1. НуклеацииПрямым микроскопированикем установлено, что области инициированияструн имеют размерность от 0 до 3 (Рис.

3.1.1 – 3.1.4) [144,145].Рис. 3.1.1. ОЦМ Никон. Ксерогель раствора Рис. 3.1.2. ОМ, штрих 100 мкм. КсерогельТФААС-5 в гексане, 7 мг/мл. Нульмерные раствора ТФААС-7 в кумоле, 3 мг/мл.области инициирования струн.Одномерная область инициирования ростаструн:линейнаяпоследовательностьнульмерных областей инициирования.Возникновениеявляетсяследствиемтакогоиметрическогоодновременноразнообразиянуклеацийсвидетельствуетострунпроцессахсамоорганизации в низкоконцентрированных растворах хиральных соединений.Рассмотрим субмикроскопическую структуру нуклеации (т.е.

нульмернойобласти инициирования роста струн). В ксерогеле гомохиральной каплиТФААС-4 отчетливо видно, что она образована множеством хаотическирасположенныхмикроскопическихструн(Рис.3.1.5).Нуклеацияможет40представлять собой изотропный хаос более тонких субмикроскопических струн(Рис. 3.1.6).Рис. 3.1.3. ОМ, штрих 100 мкм. Раствор ТФААС-4 Рис. 3.1.4.

ОЦМ Никон. Раствор ТФААСв гептане, 1 мг/мл. Двумерная область иницииро- 5 в гексане, 7 мг/мл. Трехмерная областьвания роста струн: поверхность раздела фаз.достаточно равномерного по всему ееобъему инициирования роста струн.Множественное рождение струн из одной нуклеации подтверждается такжеоптическим микроскопированием (Рис. 3.1.7).

Естественно предположить, чтопричиной инициирования струн в перечисленных случаях является либофлуктуация плотности гомохирального ТФААС (Рис. 3.1.5, 3.1.6), либопостороннее включение (Рис. 3.1.7). Вероятно, скелет из субмикроскопическихструн формируется в нанокапле на дисклинациях мезофазы (Рис. 3.1.6), которая,как было показано ранее [105], по-видимому, характеризуется ориентационнымупорядочением молекул ТФААС.Рис. 3.1.5. АСМ, режим фазовогоконтраста. Горизонтальная и вертикальная шкалы – мкм, дополнительная –угловые градусы. Ксерогель раствораТФААС-4 в гептане, 1 мг/мл. Нуклеация(нульмерная область инициирования ростаструн) при большом разрешении.Рис. 3.1.6.

АСМ, режим фазового контраста.Горизонтальная и вертикальная шкалы – мкм,дополнительная – угловые градусы. Ксерогелькапли раствора хирального ТФААС-4 в гептане,0.4 мг/мл. Вероятно, скелет из субмикроскопических струн образовался по дисклинациям.41Ранее было установлено, что концентрационный порог струнообразованияв растворахгомохиральныхТФААСвисследованныхорганическихрастворителях при комнатной температуре составляет 0.1-0.2 мг/мл (кромеТФААС-7, для которого характерно сильное стэкинг-взаимодействие – см.структурную формулу, и для которого порог струнообразования на порядокменьше).

Нами установлено [144,145], что величины концентрационных пороговструнообразования в смесях хиральных ТФААС существенно меньше, чемв растворах одного ТФААС – кроме ТФААС-7, причем чем больше компонентовв смеси, тем меньше порог струнообразования (Табл. 3.1.1). Это, по-видимому,связано с большей физико-геометрической соразмерностью в смесях ТФААС.Ранее также было установлено, чтомолекулы ТФААС имеют значительныедипольные моменты μ = 3.5–4.5 Д.

Это,как показывает простая оценка (1.3.1),указывает на существенную роль дипольдипольного взаимодействия в формировании нуклеаций. С другой стороны,расчеты методом МД указывают такжеРис. 3.1.7. ИОМ Leica DMI 6000, штрихнаважностьдисперсионныхсил, 3 мкм. Раствор ТФААС-4 в гептане,обусловливающихкомплементарность 0.4 мг/мл. Нуклеация с множественнымиструнами.хиральныхмолекулвстопочнойструктуре струн.Смеси ТФААСПороговая (суммарная) концентрацияобразования струн, мг / мл3L (50%) + 6D (50%)0.053L (50%) + 7L (50%)0.01258L (50%) + 6D (50%)0.01254L-L (50%) + 3L (50%)0.0254L-L + 6D0.15L (25%) + 3D (75%)0.0253L(33.3%) + 6D (33.3%) + 8D (33.3%)0.0255L (33.3%) + 3L (33.3%) + 8D (33.3%)0.0156Табл. 3.1.1. Порог струнообразования в растворах смесей ТФААС в гептане.42Рис.

3.1.8. АСМ. Вертикальная и горизонтальнаяшкалы – мкм, дополнительная – нм. Ксерогель рра ТФААС-8 в воде, 10 мг/мл. Группа нульмерныхнуклеаций, из которых растут пары струн.Рис. 3.1.9. АСМ. Оси – мкм. Ксерогельраствора ТФААС-4 в гептане, 1 мг/мл.Нуклеация с множественными парнымиструнами.Топологическая эквивалентность нуклеаций и локальных структур клетки(Рис.

3.1.8, 3.1.9) указывает, что на ранних этапах эволюции формированиесложных супрамолекулярных конструкций клетки обеспечивалось за счетфизической самосборки, без участия молекулярных машин.3.2. Нанокапли и спиральная структура нуклеацийСогласно полученным ранее данным ОМ и динамического рассеяния света(ДРС), элементами дисперсной фазы растворов являются струны, капли мезофазыи нанокапли [104-106,117].Так, по данным ДРС, для раствора ТФААС-5 в ЦГ ранее были статистическидостоверно выявлены три максимума: наибольший в интервале 103–104 нм,средний – в интервале 101–102 нм и наименьший, в интервале 1–10 нм (положениямаксимумов смещаются от измерения к измерению; одна из типичных сигнатурпредставлена на Рис. 3.2.1).Следует отметить, что существенным недостатком проведенных ранее иописанных выше ДРС измерений является отсутствие калибровки прибора напробных частицах с заданными заранее известными размерами того же порядка,что и наиболее мелкая наблюдаемая фракция (~10 нм).

В данной работе удалосьподобрать пробные частицы, совместимые с растворителями, используемыми43в работе: были использованы золотые наночастицы размером 10 нм и серебряныенаночастицы размером 20 нм. В результате измерений на том же прибореZetaSizer Nano, что и измерения, проведенные в [104,106,117], были полученызначения среднего размера 18 нм (индекс полидисперсности = 0,4) и 29 нм(индекс полидисперсности = 0,5) для золотых и серебряных наночастицсоответственно. Таким образом, определение размера частиц в нанометровомдиапазоне происходит с приемлемой погрешностью на логарифмической шкале.Рис. 3.2.1.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Почему делать на заказ в разы дороже, чем купить готовую учебную работу на СтудИзбе? Наши учебные работы продаются каждый год, тогда как большинство заказов выполняются с нуля. Найдите подходящий учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
7027
Авторов
на СтудИзбе
260
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее