Отзыв на автореферат д.б.н. И.А. Воробьева (1103752)
Текст из файла
отзыв на автореферат диссертации Захарова Павла Николаевича «Молекулярно-механическая модель динамики микротрубочки», представленной на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.02 — Биофизика. Работа П.Н. Захарова посвящена актуальной и важной теме — моделированию динамической нестабильности микротрубочек, Микротрубочки являются важным компонентом цито скелета клеток, и их динамическая нестабильность играет существенную роль во многих процессах жизнедеятельности — от деления клеток до их подвижности и прикрепления к субстрату.
Динамическая нестабильность микротруб очки — это явление «самопроизвольного» переключения между фазами роста (полимеризации) и укорочения ~деполимеризации) отдельно взятой микротрубочки без изменения внешних условий. Спонтанный переход от роста к деполимеризации в литературе принято называть «катастрофой», обратный переход — «спасением».
Явление динамической нестабильности было открыто в 1984 году, и существует немало моделей, пытающихся описать этот процесс, однако многие аспекты этого феномена остаются не до конца изученными. В частности, непонятен молекулярный механизм возникновения катастрофы, которому, предположительно, предшествует так называемое «старение» вЂ” увеличение вероятности испытать катастрофу по мере роста микротрубочки. Исследованию этих процессов главным образом и посвящена работа диссертанта. Задачи, которые решались в работе: 1. Создание новой молекулярно-механической модели м икр отрубочки на основе алгоритма броуновской динамики.
2. Калибровка параметров модели, отвечающих за взаимодействия между субъединицамимономерами, на основе данных о скоросте роста и укорочения исследуемой структуры. 3. Верификация модели с использованием экспериментальных данных, описывшс~щих микротрубочку. 4. Анализ вариантов механизма «старения», предложенных в литературе. 5. Исследование с помощью созданной модели и кинетической схемы молекулярных механизмов, вызывающих катастрофы и «старение» микротрубочки. В работе были получены следующие существенно новые научные результаты: Было показано, что с помощью метода бр оуново кой динамики можно непротиворечиво описать основные экспериментальные свойства микротрубочки.
Следует отметить, что данного результата не удавалось достичь с помощью других моделей, использующих псевдо-динамические или кинетические методы. Были проанализированы существующие гипотезы механизма «старения» микротрубочки: появление неисправимых дефектов в решетке микротрубочки и непрерывное увеличение «заостренности» конца микротрубочки в процессе роста. Было показано, что предположение о появлении неисправимых дефектов не является необходимым для возникновения феномена «старения».
Далее, был предложен вероятностный молекулярный механизм возникновения катастрофы — образование 10 и более отгибающихся протофиламентов на конце растущей микротрубочки как критический параметр, приводящий к катастрофе. При исследовании модели было обнаружено увеличение частоты появления критического количества отгибающихся протоф илам енто в по мере роста микротрубочки, и было показано, что такие изменения могуг описать феномен «старения» микротрубочки. Научные положения, представленные в диссертации П.Н. Захарова, основаны на тщательном анализе достаточного объема экспериментальных данных. Использование широко принятых научных методов моделирования и статистического анализа данных обеспечивает достоверность полученных результатов.
Выводы отражают суть проведенной работы, а ее содержание полностью отражено в опубликованных статьях, включая публикацию первым автором в журнале с высоким импакт-фактором (В1орЬуз1са! 3оигпа1), входящем в список журналов ВАК. Актуальность, научная новизна, личный вклад автора и выводы не вызывают сомнения. и ис ж ения ченых степеней» ве ж енного постановлением и авительства РФ от 24 сентяб я 2013 го а за № 842 и е ъявляемым к иссе та ям на соискание ченой степени кан и ата изико-математических на к а ее авто заел живает и ис ж ения искомой ченой степени по спе иальности 03.01.02 — Био изика.
Зав. Лабораторией НИИ Физико-химической биологии им, А.Н. Белозерского Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Московский Государственный Университет имени М.В. Ломоносова» доктор биологических наук, профессор И.А. Воробьев Контактная информация: 119991, г.Москва, Ленинские горы 1 Тел.
+7 495 939-20-84 Электронная почта чогоЬ®та11.деиеЬеелпзи.ги Подпись И.А. Воробьева удостоверяю М.П. Дата: б~ ~~у~~~ Д,Яд Ученый секретарь НИИ ФХБ МГУ им. М.В. Ломоносова д.ф.-м.н, 4 '1 ( 3 Г Фетисова Заключение. иссе та ионная абота П.Н. Заха ова «Мелек ля но-механическая мо ель инамики мик от бочки» полностью соответств ет к ите ням пп. 9-14 «Положения о по я ке .
Характеристики
Тип файла PDF
PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.
Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.














