Заключение диссертационного совета (1103749), страница 2
Текст из файла (страница 2)
От заведующего лабораторией компьютерного и математическогомоделирования биологических систем Федерального государственногобюджетного образовательного учреждения высшего образования«Московскийфизико-техническийинститут(государственныйуниверситет)» кандидата физико-математических наук, Ph.D. ЖмуроваАртема Андреевича. В отзыве отмечено, что в работе было показано,каким образом отгибающиеся протофиламенты могут являтьсядестабилизирующим явлением, лежащим в основе механизма«старения». А также проанализированы другие возможные гипотезымолекулярного механизма возникновения катастроф.Всеотзывыположительные,отмечаетсяактуальностьтемыдиссертационного исследования, практическая значимость результатов, атакже научная новизна.
Во всех отзывах отмечается, что диссертационная5работа представляет собой законченную научно-квалификационную работу иудовлетворяет всем критериям ВАК, предъявляемым к диссертациям насоискание учёной степени кандидата физико-математических наук поспециальности 03.01.02 - Биофизика.Диссертационный совет отмечает, что на основании выполненныхсоискателем исследованийРазработан:Компьютерный вычислительный алгоритм моделирования динамическойнестабильности микротрубочки для изучения катастроф и «спасения»исследуемого объекта. Данный алгоритм был адаптирован для параллельныхвычислений на суперкомпьютерном вычислительном комплексе МГУ имениМ.В.Ломоносова.Предложено:Математический метод описания микротрубочки на временах порядкадесятков секунд на уровне отельных молекул, включающий в себядинамический броуновский алгоритм и кинетические переходыОбъяснение механизма возникновения катастроф на молекулярном уровнеДоказано, что:Все основные свойства микротрубочки можно описать с помощьюмолекулярно-механической модели в рамках одного набора параметровПредположение о необратимых изменениях в решетке микротрубочки неявляется необходимым для объяснения возникновения катастроф и феномена«старения» микротрубочкиТеоретическая значимость исследования обоснована тем, что:Созданновыйметоданализадинамическойнестабильностимикротрубочки, позволяющий исследовать не только катастрофы, но имеханизм спасения микротрубочкиДанный алгоритм может быть адаптирован для исследования силовыхвзаимодействий между микротрубочками и микротрубочко-связывающимибелками внутри митотического веретена деленияПрименительно к проблематике диссертации результативно (эффективно, то6есть с получением обладающих новизной результатов) использованы:Метод броуновской динамики моделирования взаимодействий междумономерами в стенке микротрубочки;Методы программирования для параллельных высокопроизводительныхвычислений.Подробно описан метод математического моделирования, использованный вработе, а также методы обработки результатов моделирования.Изучено:Влияние конфигураций конца микротрубочки на её стабильностьСвязь между появлением отогнутых протофиламентов намикротрубочки и возникновением катастрофМолекулярный механизм возникновения катастрофконцеЗначение полученных соискателем результатов исследования для практикиподтверждается тем, что:Установленный детальный механизм связи между конформационнымиизменениями на конце микротрубочки и переходом от состояния роста кукорочению указывает на возможный поиск для фармацевтических целейсоединений, влияющих на образование отогнутых протофиламентов на концемикротрубочкиДостоверность результатов исследования обеспечивается:Проведенной верификацией математической модели на ряде известныхэкспериментальных данных, полученных другими авторамиИспользованием широко апробированых физических и статистическихметодовЛичный вклад соискателя состоит в:Создании компьютерного алгоритма, реализующего динамикумикротрубочки, и проведении вычислений на суперкомпьютерном комплексеМГУ имени М.В.ЛомоносоваКалибровке потенциалов молекулярно-механической модели78.















