Короткие фрагменты белковой глобулы с преобладающей конформацией (1103300), страница 5
Текст из файла (страница 5)
Установлены конформационные особенности олигопептидных фрагментов.Для всех возможных 160000 тетрапептидов построены таблицы конформацийсоставляющих их остатков. Получены частоты появления каждого остатка (с 1-гопо 4-ый) тетрапептидов в каждой из трёх основных областей конформационнойкарты: α-спирали, β-структуры и левых спиралей типа полипролин II. Для каждойиз трёх основных вторичных структур сформированы Списки «предпочитающих»их тетрапептидов.4. Охарактеризовано взаимное расположение конформационно-стабильныхолигопептидов в белковой глобуле. Показано, что в структуре глобулыконформационно стабильные олигопептиды располагаются на близких расстояниях,что может являться ключевым моментом в складывании и стабильности белковойглобулы.5.Наблюдаетсясходствовпараметрах,характеризующихстатистикурасположения и ориентации стабильных олигопептидов в составе глобулы ссоответствующими параметрами статистики расположения случайно выбранныхфрагментов такой же длины.
Большое количество случаев близкого взаимногорасположения случайных олигопептидов свидетельствует о том, что значительнаячасть последовательности белка в глобулярной структуре находится недалеко отфрагментов с преобладающей конформацией.Список работ, опубликованных по теме диссертации1.Батяновский А.В., Власов П.К.
Короткие фрагменты белковой глобулы спреобладающей конформацией. Биофизика, 2008, т. 53, с. 556-561.2.Батяновский А.В., Есипова Н.Г., Шноль С.Э. О взаимном расположениикороткихконформационностабильныхолигопептидовглобулярных белков. Биофизика, 2009, т.
54, с. 1137-1143.27вструктуре.














