Диссертация (1102956), страница 12

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 12)

Biophys., 1,6 pp. 53-183, 1983[56] I.D. Kuntz, W. Kauzmann. Hydration of protein s and polypeptides. Adv. Prot. Chem., 28,pp. 239-345, 1974[57] R. Pethig. Protein-water interactions determined by dielectric methods. Annu. Rev. Phys.Chem., 43, pp. 177-205, 1992[58] N.A. Bulenkov. Role in the study of modular design, the system self-organization processesin biological systems [in Russian]. Biophysics, Volume 50, no. 5, s.934-958, 2005[59] B.V. Derjaguin, NV Churaev, VM Muller.

Surface Forces [in Russian], 398 p., Moscow., 1985[60] Келли А, Гровс Г., Кристаллография и дефекты в кристаллах. Москва. «Мир», 1974,496 с.[61] J. J. Foley and D. A. Mazziotti, J. Phys. Chem. A, 117, 6712, (2013).[62] П.Н. Голод, А.У. Климык. Математически е основы теории симметрий. Москва-Ижевск,2001, Регулярная и хаотическая динамика. 528 с.[63] А. Л. Талис. Построение обобщенной кристаллографии алмазоподобных структур наоснове алгебраической геометрии. В сборнике «Синтез минералов». Т.

3, Александров,«ВНИИСИМС», 2000. с.321-402..[64] Шайтан К.В., Сарайкин С.С.,Молекулярная динамика, 1999[65] В. П. Волошин, Е. А. Желиговская, Г. Г.Маленков, Ю. И. Наберухин, Д. Л. Тытик, Рос.хим. ж. (ж. Рос. хим. об-ва им. Д.И.Менделеева), т.XLV, 3, 31-37, (2001).[66] В.А. Ильина, П.К. Силаев, Численные методы для физиков-теоретиков, 2003[67] http://www.mpibpc.mpg.de/grubmueller/solvate95[68] NAMD - Scalable Molecular Dynamics URL: http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/[69] CAHRMM forcefield - http://www.charmm.org[70] Knuth, Donald E.

(1997), The Art Of Computer Programming Vol 1. 3rd ed., Boston:Addison-Wesley[71] A.O. Marchenko, A.B. Solovey, V.I. Lobyshev. Computer modeling of parametric structuresof water. - Biophysics, 2013[72] V. I. Poltev, T. I. Grokhlina, and G. G. Malenkov,J. Biomol. Struct.

Dyn.2, 413, 1984[73] V. I. Lobyshev, A. B. Solovei, and N. A. Bul’enkov, Biofizika, 48, 1011, (2003).[74] A. B. Solovei and V. I. Lobyshev, Russ. J. Phys. Chem., 80, 1578, (2006).[75] C. Rocchi, A. Bizzarri, and S. Cannistraro, Phys. Rev. E, 57, 3315, (1998).[76] Kauzmann W. Some factors in the interpretation of protein denaturation. // Adv. ProteinChem. 1959.

Т. 14. С. 1–63.[77] Levitt M., Sharon R. Accurate simulation of protein dynamics in solution. // Proc. Natl.Acad. Sci. U. S. A. 1988. Т. 85. № 20. С. 7557–61.[78] Cheng Y.K., Sheu W.S., Rossky P.J. Hydrophobic hydration of amphipathic peptides. //Biophys. J. 1999. Т. 76. № 4. С. 1734–43.[79] https://www.cgal.org[80] K.A. Silverstein, A.D. Haymet, K.A. Dill, J.Am.Chem.Soc 120, 3166 (1998)[81] W.L.

Jorgensen, C. Jenson. Temperature Dependence of TIP3P, SPC, and TIP4P Waterfrom NPT Monte Carlo Simulations: Seeking a Temperature of Maximum Density. J. Comp.Chem, 1998, 19, p. 1179.[82] V.I. Poltev, T.I. Grokhlina, G.G. Malenkov Hydration of nucleic acid bases studied usingnovel atom-atom potential functions.

J. Biomolec. Struct. and Dynamics. 1984. V.2. pp .413429.[83] V.P. Voloshin, E.A. Zheligovskaya, G.G. Malenkov, Ju.I. Naberukhin, D.I. Tytik, Structuresand dynamics of the H-bonds of water molecules in the condensed water systems[in Russian].Russian Chemical Journal, XLV,No3 , 200196[84] D. I. Svergun, S. Richard, M.

H. J. Koch, Z. Sayers, S. Kuprin, and G. Zaccai. Proteinhydration in solution: Experimental observation by x-ray and neutron scattering // Proc.Natl. Acad. Sci. 1998. Т. 95. № 5. С. 2267–2272.[85] RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB - 1CAG Structure Summary. URL:http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1CAG[86] RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB - 1UBQ Structure Summary. URL:http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1UBQ[87] Max Planck Institute for Biophysical Chemistry | Research | Research Groups |Theoretical and Computational Biophysics | Research | Methods | Solvate URL:http://www.mpibpc.mpg.de/grubmueller/solvate[88] pyhull Package — pyhull 1.4.3 URL: https://pythonhosted.org/pyhull/pyhull.html[89] Moeller T., Trumbore B.

Fast, Minimum Storage Ray-Triangle Intersection // J. Graph.Tools. 1997. Т. 2. № 1. С. 21–28.[90] Дьяконова Л.П., Маленков Г.Г. Моделирование структуры жидкой воды методом МонтеКарло. Ж структ. химии, 1979. 20:854[91] Ермаков М. Метод Монте Карло и смежные вопросы. Москва: Наука, 1971, 471 стр. 102Есипова Н.Г. О характере некоторых водородных связей в коллагене. Биофизика, 1957,2:461[92] Есипова Н.Г., Андреева Н.С., Миллионова М.И. Об особенностях строения коллагена.Кристаллография, 1957.

4:470[93] Есипова Н.Г., Григолава М.В., Щеголева Т.Ю., Рогуленкова В.Н., Малеев В.Я. Почемутемпература денатурации коллагена должна быть близка к температуре развития вида?Биофизика, 1981.26:355[94] Есипова Н.Г., Лазарев Ю.А., Лазарева А.В., Спектральные исследования коллагенаи родственных ему полипептидов. О характере основной системы водородных связей.Биофизика, 1972. 17:949-97.

Характеристики

Список файлов диссертации