Главная » Просмотр файлов » Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование

Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (1102545), страница 23

Файл №1102545 Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование) 23 страницаВлияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (1102545) страница 232019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 23)

Contribution of Phosphate Groups to the Dipole Potential of Dimyristoylphosphatidylcholine Membranes / S. Diaz, F. Lairio, J. Arroyo, E. A. Disalvo //Langmuir. –– 2001. –– Vol. 17, no. 3. –– P. 852–855.46. Davis J. E., Rahaman O., Patel S. Molecular dynamics simulations of a DMPCbilayer using nonadditive interaction models. // Biophysical journal.

––2009. –– January. –– Vol. 96, no. 2. –– P. 385–402.47. Molecular dynamics simulation of hydrated DPPC monolayers using charge equilibration force fields. / Timothy R. Lucas, Brad A. Bauer, Joseph E. Davis,Sandeep Patel // Journal of computational chemistry. –– 2011. –– October. ––P. 141–152.– 108 –48. Yeung T., Grinstein S. Lipid signaling and the modulation of surfacecharge during phagocytosis.

// Immunological reviews. –– 2007. –– October. ––Vol. 219. –– P. 17–36.49. Phosphorylation, high ionic strength, and calmodulin reverse the binding ofMARCKS to phospholipid vesicles. / J Kim, T Shishido, X Jiang et al. // TheJournal of biological chemistry. –– 1994. –– December. –– Vol. 269, no. 45. ––P. 28214–9.50. Membrane phosphatidylserine regulates surface charge and protein localization.

/ Tony Yeung, Gary E Gilbert, Jialan Shi et al. // Science (New York,N.Y.). –– 2008. –– January. –– Vol. 319, no. 5860. –– P. 210–3.51. Goldenberg N. M., Steinberg B. E. Surface charge: a key determinant ofprotein localization and function. // Cancer research. –– 2010. –– March. ––Vol. 70, no. 4. –– P. 1277–80.52. La3+ and Gd3+ induce shape change of giant unilamellar vesicles of phosphatidylcholine / Tomoki Tanaka, Yukihiro Tamba, Shah Md Masum et al.

//Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. –– 2002. –– August. –– Vol.1564, no. 1. –– P. 173–182.53. Cladera J., O’Shea P. Intramembrane molecular dipoles affect the membraneinsertion and folding of a model amphiphilic peptide. // Biophysical journal. –– 1998. –– May. –– Vol. 74, no. 5. –– P. 2434–42.54. Cladera J. Characterization of the Sequence of Interactions of the FusionDomain of the Simian Immunodeficiency Virus with Membranes.

Role of theMembrane Dipole Potential. // Journal of Biological Chemistry. –– 1999. ––October. –– Vol. 274, no. 42. –– P. 29951–29959.55. Cances E., Legoll, Frederic, Stoltz G. Theoretical and numerical comparison of some sampling methods for molecular dynamics // ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis. –– 2007. –– March. –– Vol. 41, no. 02. ––P. 351–389.56.

Berendsen, H. J. C., Postma, J. P. M., DiNola, A., Haak J. R. Moleculardynamics with coupling to an external bath. // J. Chem. Phys. –– 1984. ––Vol. 81. –– P. 3684–3690.– 109 –57. Parrinello M. Polymorphic transitions in single crystals: A new moleculardynamics method // Journal of Applied Physics. –– 1981. –– Vol. 52, no.

12. ––P. 7182.58. Molecular dynamics simulations of lipid bilayers: major artifacts due totruncating electrostatic interactions. / M Patra, M Karttunen, M T Hyvönenet al. // Biophysical journal. –– 2003. –– June. –– Vol. 84, no. 6. –– P. 3636–45.59. Simulation-based methods for interpreting x-ray data from lipid bilayers. /Jeffery B.

Klauda, Norbert Kucerka, Bernard R. Brooks et al. // Biophysicaljournal. –– 2006. –– April. –– Vol. 90, no. 8. –– P. 2796–807.60. Berger O., Edholm O., Jahnig F. Molecular dynamics simulations of a fluid bilayer of dipalmitoylphosphatidylcholine at full hydration, constantpressure, and constant temperature // Biophysical Journal. –– 1997. –– May.

––Vol. 72, no. 5. –– P. 2002–2013.61. Jorgensen W., Maxwell D. T.-R. J. Development and Testing of the OPLS AllAtom Force Field on Conformational Energetics and Properties of OrganicLiquids // J. Am. Chem. Soc. –– 1996. –– Vol. 118, no. 45. –– P. 11225–11236.62. Wallqvist A., Mountain R. D. Molecular Models of Water: Derivation andDescription // Reviews in Computational Chemistry.

–– 2007. –– Vol. 13. ––P. 183–247.63. Berkowitz M. L., Bostick D. L., Pandit S. Aqueous solutions next to phospholipid membrane surfaces: insights from simulations. // Chemical reviews. ––2006. –– April. –– Vol. 106, no. 4. –– P. 1527–39.64. Pandit S. a., Bostick D., Berkowitz M. L. Molecular dynamics simulation of adipalmitoylphosphatidylcholine bilayer with NaCl. // Biophysical journal. ––2003. –– June.

–– Vol. 84, no. 6. –– P. 3743–50.65. Tieleman D. P., Marrink S. J., Berendsen H. J. A computer perspectiveof membranes: molecular dynamics studies of lipid bilayer systems. //Biochimica et biophysica acta. –– 1997. –– November. –– Vol. 1331, no. 3. ––P. 235–70.66. Perera L., Essmann U., Berkowitz M. L. Role of Water in the Hydration ForceActing between Lipid Bilayers // Langmuir. –– 1996. –– January. –– Vol. 12,no.

11. –– P. 2625–2629.– 110 –67. Berkowitz M. L., Raghavan K. Computer Simulation of a Water/Membrane Interface // Langmuir. –– 1991. –– Vol. 27599, no. 8. –– P. 1042–1044.68. TeschkeO.,CeottoG.,deSouzaE.Interfacialwaterdielectric-permittivity-profile measurements using atomic force microscopy // PhysicalReview E. –– 2001. –– June. –– Vol. 64, no. 1.

–– P. 1–10.69. Harder E., Mackerell A. D., Roux B. Many-Body Polarization Effects and theMembrane Dipole Potential // J. Am. Chem. Soc. –– 2009. –– Vol. 131, no. 8. ––P. 2760–2761.70. Effects of Alkali Cations and Halide Anions on the DOPC Lipid Membrane /Robert Vacha, Shirley W. I. Siu, Michal Petrov et al. // J.Phys.Chem.A. ––2009. –– Vol. 113, no. 26. –– P. 7235–7243.71.

Gurtovenko A. a., Vattulainen I. Membrane potential and electrostatics ofphospholipid bilayers with asymmetric transmembrane distribution of anioniclipids. // The journal of physical chemistry. B. –– 2008. –– April. –– Vol. 112,no. 15. –– P. 4629–34.72. Pandit S. A., Bostick D., Berkowitz M. L. Mixed bilayer containing dipalmitoylphosphatidylcholine and dipalmitoylphosphatidylserine: lipid complexation, ion binding, and electrostatics. // Biophysical journal.

–– 2003. ––November. –– Vol. 85, no. 5. –– P. 3120–31.73. Essmann U., Berkowitz M. L. Dynamical properties of phospholipid bilayersfrom computer simulation // Biophysical journal. –– 1999. –– April. –– Vol. 76,no. 4. –– P. 2081–9.74. Methodological Issues in Lipid Bilayer Simulations / Celine Anezo, AlexH. De Vries, Hans-dieter Ho et al. // J.Phys.Chem.

–– 2003. –– Vol. 107. ––P. 9424–9433.75. Marrink S. J., Berkowitz M. L., Berendsen H. J. C. Molecular dynamicssimulation of a membrane/water interface: the ordering of water and itsrelation to the hydration force // Langmuir. –– 1993. –– November. –– Vol. 9,no. 11. –– P. 3122–3131.76. Нестеренко А.М., Красильников П.М., Ермаков Ю.А. Молекулярно динамическаясимуляциябислояраспределениеDPPCвразныхэлектрическогополяфазовыхвсостояниях:присутствиигидратациякатионовБиологические Мембраны. –– 2011. –– Vol.

28, no. 5. –– P. 397–407.Be2+и//– 111 –77. НестеренкоА.М.,ЕрмаковЮ.А.Молекулярнаядинамикафосфолипидныхмембран: распределение ионов вблизи границы нейтрального и заряженногожидкокристаллического бислоя // Биологические Мембраны. –– 2012. –– Vol. 29,no. 5. –– P. 374–384.78. Shinoda W., Okazaki S. Molecular dynamics study of the dipalmitoyl phosphatidylcholine bilayer in the liquid crystal phase: An effect of thepotential force fields on the membrane structure. // Journal of MolecularLiquids.

–– 2001. –– Vol. 90. –– P. 95–103.79. Open Babel: An open chemical toolbox / Noel M O Boyle, Michael Banck,Craig A James et al. // Journal of Cheminformatics. –– 2011. –– Vol. 3, no. 1. ––P. 33.80. Weininger D. SMILES: a Chemical Language and Information System: 1 Introduction to Methodology and Encoding Rules // Journal of Chemical Informationand Computer Science (JCICS). –– 1989.

–– Vol. 29, no. 2. –– P. 97–101.81. Granovsky A. A. Extended multi-configuration quasi-degenerate perturbationtheory: the new approach to multi-state multi-reference perturbation theory. // The Journal of chemical physics. –– 2011. –– June. –– Vol. 134, no. 21. ––P. 214113.82. A well-behaved electrostatic potential based method using charge restraintsfor deriving atomic charges: the RESP model / Christopher I. Bayly, Piotr Cieplak, Wendy Cornell, Peter A. Kollman // The Journal of PhysicalChemistry. –– 1993. –– October. –– Vol.

97, no. 40. –– P. 10269–10280.83. Hydration Energies of Divalent Beryllium and Magnesium Ions: An ab InitioMolecular Orbital Study / George D. Markham, Jenny P. Glusker, Cindy L. Bocket al. // Journal of Physical Chemistry. –– 1996. –– Vol. 100. –– P. 3488–3497.84. Straatsma T. P., Berendsen H. J. C. Free energy of ionic hydration: Analysisof a thermodynamic integration technique to evaluate free energy differencesby molecular dynamics simulations // The Journal of Chemical Physics. ––1988. –– November. –– Vol. 89, no. 9. –– P. 5876.85.

Fritz J. What is the Surface Tension of a Lipid Bilayer Membrane // Biophysical Journal. –– 1996. –– Vol. 71. –– P. 1348–1349.86. Allen M. P., Tildesley D. J. Computer Simulation of Liquids. –– New Yourk :Oxford Univercity Press, 1989. –– P. 385.– 112 –87. Darden, T., York, D., Pedersen L. Particle mesh Ewald: An N-log(N) methodfor Ewald sums in large systems. // J. Chem.

Phys. –– 1993. –– Vol. 98. ––P. 10089–10092.88. Hoover W. G. Canonical dynamics: equilibrium phase-space distributions. //Phys. Rev. A. –– 1985. –– Vol. 31. –– P. 1695–1697.89. Neumann M. Dielectric relaxation in water. Computer simulations with theTIP4P potential // The Journal of Chemical Physics. –– 1986. –– Vol. 85,no. 3.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
7048
Авторов
на СтудИзбе
259
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее