Главная » Просмотр файлов » Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование

Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (1102545), страница 17

Файл №1102545 Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (Влияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование) 17 страницаВлияние катионов на структурные и электрические свойства липидного бислоя. Молекулярно-динамическое исследование (1102545) страница 172019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 17)

Соответствующие оценки для достаточно длинных МД-траекторий подтвердили образованиетаких слоев воды и в наших системах (Sz на рис. 3.3.2). Приведенная на рисункезависимость ПП2 отображает различие в ориентации граничной воды в различныхобластях. В диффузной части ДЭС значение ПП2 затухает на достаточно короткихрасстояниях (порядка 7–8 Å), в отличие от коэффициента латеральной диффузии.На рис. 3.3.3 приведены значения параметра порядка второго ранга (Sz ) длямолекул гидратной воды на разном расстоянии от поверхности мембраны в присутствии различных катионов при двух фазовых состояниях.

Как мы полагаем, плотнойчасти двойного слоя соответствует область 5–10 Å, которая занята фосфатнымии холиновыми группами. Согласно данным на рис. 3.3.1, именно в этой областирастворитель создает наибольшее падение потенциала. По нашим оценкам, B+ слойлежит в пределах 3.5–9 Å, таким образом, примерно совпадает с плотной частьюДЭС. Катионы Be2+ , расположенные в этом слое, существенно понижают ПП2 воды в– 79 –нем, тогда как в случае катионов Na+ этот эффект значительно слабее. Переходбислоя из гелевого в жидко-кристаллическое состояние также понижает степеньориентированности молекул воды в этом слое.

Эти выводы относятся к характеристикам поверхностной воды, не участвующей в образовании Н-связей с молекуламиповерхности. В то же время молекулы воды, участвующие в образовании таких связей, практически не чувствительны к изменениям структуры мембраны и присутствиюионов. Это означает, что такие молекулы воды целесообразно рассматривать какструктурный элемент самих фосфолипидов.Количество свободной гидратной водыСистемаNhydNhbDPPC:NaCl (300 K)13.24.7DPPC:BeCl2 (300 K)17.94.7DPPC:NaCl (340 K)15.64.9DPPC:BeCl2 (340 K)18.04.7на липид и связанной Н-связями с полярными группами приведено в Табл. 3.3.1.

Изэтих данных следует, что различие междукатионами Be2+ и Na+ в количестве связанной воды возрастает в гелевом состояниибислоя. При его замерзании в присутствиивысокоафииных катионов Be2+ молекулы воды практически не удаляются из полярнойТаблица 3.3.1: Количество связанной воды налипид (Nhyd ) и количество Н-связей на липид(Nhb ) в бислое DPPC в присутствии Na и Be приразличной температуре.области мембраны, как это происходит в присутствии катионов Na+ . Поскольку бериллий способен «удерживать» воду внутри бислоя даже при фазовом переходе, егосвязывание с бислоем в гель-состоянии, вероятно, энергетически более выгодно,чем в жидкокристаллическом, как это следует из данных, приведенных в [27].

Ксожалению, количественный расчет этого эффекта и оценка констант равновесия поданным МД симуляции, если и возможен, то крайне затруднителен.3.3.2. Дипольный потенциал как объект исследованияОдна из основных задач настоящей работы предполагает выделение вклада вграничный потенциал диффузной компоненты потенциала, обусловленной распределением ионов вблизи поверхности бислоя, и той компоненты потенциала, котораянепосредственно связана со структурой самого бислоя и во многом зависит оториентации дипольных моментов молекул воды и липидов в его полярной области.Поэтому последнюю компоненту граничного потенциала принято называть дипольной,хотя в распределении электрического поля в этой области принимают участие идругие механизмы, в частности непосредственное проникновение ионов, изменениесостояния гидратации липидов и латеральная их компактизация при образованиикластеров, а также изменение фазового состояния.

Анализ МД траекторий дает возможность рассмотреть в отдельности каждый из перечисленных механизмов изменения– 80 –Рис 3.3.3: Параметр порядка второго ранга (Sz ) для молекул гидратной воды на разном расстоянии отповерхности мембраны для нескольких систем. Пунктиром отделены области, в которых этот параметрпринимает отрицательные (В–) и положительные (В+) значения, а также область с отсутствием порядка(F).

Область B+ примерно соответствует плотной части ДЭС.дипольного потенциала.Абсолютные и относительные значения граничного потенциала.В работе рассчи-тывалось абсолютное значение граничного потенциала, хотя анализируется толькоизменение этого потенциала при варьировании различных условий. Следует заметить, что с формальной точки зрения дипольный потенциал незаряженной мембранычисленно равен ее граничному потенциалу. Согласно принятой в электрохимическойлитературе терминологии, граничный потенциал бислоя по сути является Гальванипотенциалом между гидрофобной фазой мембраны и объемом раствора. Известно, чтоизмерить абсолютное значение Гальвани-потенциала невозможно, а значит значениедипольного потенциала также недоступно для регистрации. Любые экспериментальныеметодики позволяют регистрировать только изменения граничного потенциала. Этоутверждение справедливо и в применении к исследованиям электростатических эффектов на поверхности липидного бислоя. В частности, хорошо разработанный методкомпенсации внутримембранного поля применимый к плоским БЛМ позволяет регистрировать различия ∆Ψb между двумя монослоями бислоя [36].

Часто считают, чтомонослой является моделью половины бислоя и иногда ошибочно связывают абсолютное значение граничного потенциала бислоя с Вольта-потенциалом соответствующего– 81 –монослоя [104]. Структуру Вольта-потенциала, измеряемого в любой монослойнойустановке можно записать следующим образом:airΨV = Ψs + Ψd + χairtails − χwaterгде χairtails обозначает потенциал на границе воздух-углеводородные цепи, величинакоторого неизвестна, а величина χairwater обозначает потенциал вода-воздух, которыйпри расчетах вычитается.

Если к тому же учесть поверхностные скачки на границеэлектрод-воздух и электрод-раствор, то окажется что Вольта-потенциал также неможет дать абсолютного значения дипольного потенциала. С другой стороны, извычислительного эксперимента, по уравнению Пуассона можно рассчитать абсолютноезначение разности потенциалов между двумя точками. Взяв одну точку в центрегидрофобной зоны бислоя, а вторую в объеме раствора, можно связать полученныйскачек потенциала с абсолютным значением граничного потенциала бислоя.

Однакопроизвол в выборе точки в центре, наличие зависимости потенциала от наборапарциальных зарядов, неоднозначность в выборе модели воды и другие особенностипостроения МД моделей не дают основания обсуждать абсолютные значения граничногои дипольного потенциалов. Более того, эти абсолютные значения не могут бытьв принципе сопоставлены ни с одним из экспериментальных наблюдений. Поэтомуобоснованно обсуждать можно только изменение этих величин.Изменения дипольного потенциала бислоя.Если рассматривать каждый липид, какноситель некоторого «элементарного диполя» (µ), направленного внутрь поверхности, то дипольный потенциал мембраны должен быть обратно пропорционален площадина липид согласно известному соотношению Гельмгольца (1.2.2). Изменение Вольтапотенциала липидных монослоев демонстрируют именно такую зависимость для липидовв жидко-кристаллическом состоянии [25].

Однако эксперименты, проведенные в максимально широком диапазоне плотности монослоя, в том числе и на заряженныхфосфолипидах, обнаруживают нарушение этой закономерности при переходе бислоя вболее компактное, гелевое, фазовое состояние [43]. Согласно этим данным величина«элементарного диполя» липида уменьшается в процессе фазового перехода. Болеетого, связывание высокоафинных катионов также влияет на дипольную компонентуграничного потенциала [31], увеличивая ее при латеральной компактизации бислоя.По всей видимости, в этом случае дипольный потенциал также изменяется из-зауменьшения площади на липид.

Понятно, что для исследования природы элементарного диполя необходимо обратиться к детальной молекулярной картине плотной части– 82 –двойного слоя.3.3.3. Дипольный потенциал с учетом эффектов гидратации бислояКак было показано в разделе “Локализация одновалентных катионов...”, катионы адсорбируются на различной глубине в пределах плотной части ДЭС. Литературныеданные о влиянии катионов на величину дипольного потенциала, в свою очередь,заставляют предполагать изменение структуры межфазной границы при адсорбциинекоторых молекул, так называемых «дипольных модификаторов» [31].

Присутствиемолекул воды в полярной области бислоя и ее гиперполяризация приводят к появлению дипольного потенциала на границах. Связывание катионов существенным образомвлияет на состояние и ориентацию гидратной воды. Поэтому был рассчитан вкладв полный скачок потенциала различных структурных компонент при адсорбции различных катионов. Суммарный Ψb и вклады в него каждой из компонент для бислояDPPC в разных фазовых состояниях в присутствии различных катионов приведеныв табл.

3.3.2. В системе DPPC:NaCl положительный вклад в граничный потенциалвносится как водой и катионами Na+ . В случае DPPC:BeCl2 вода вносит незначительный вклад в потенциал по сравнению с высокоафинными катионами Be2+ . ПриСистемаКомпонентDPPCDPPCH2 Opart sumDPPC:NaClDPPCH2 ONa+Cl−part sumDPPC:BeCl2part sumDPPCH2 OBe2+Cl−Вклад в гран. потенциалгельж.–к.Ψb , мВ-744-767-231062969-93318202-116-792-844-52861638-223660980320-348-605-258382169-213-1101-98112010888-2019711846-125-651-760-109327193-133Таблица 3.3.2: Вклад молекул липида, воды иионов в суммарную величину граничного потенциала (Ψb , мВ) для изченных систем в двух фазовыхсостояниях и его изменение при фазовом переходе(∆Ψb , мВ)Рис 3.3.4: Графическое сопоставление данных реального [37] и вычислительного экспериментов поизменению поверхностного и граничного потенциалов при адсорбции бериллия (слева).

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
7049
Авторов
на СтудИзбе
259
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее