Курсовой проект 10 семестр (1034776), страница 3
Текст из файла (страница 3)
Выделение альфа-ритма.
Альфа-ритм (α-ритм, alpha rhythm) — ритм ЭЭГ в полосе частот от 8 до 13 Гц, средняя амплитуда 30-70 мкВ, могут однако наблюдаться высоко- и низкоамплитудные α-волны. Регистрируется у 85-95% здоровых взрослых. Лучше всего выражен в затылочных отделах. Наибольшую амплитуду α-ритм имеет в состоянии спокойного бодрствования, особенно при закрытых глазах в затемнённом помещении. Блокируется или ослабляется при повышении внимания (в особенности зрительного) или мыслительной активности.
Для этого ритма характерно возникновение спонтанных изменений амплитуды (модуляции α-ритма), выражающихся в чередующемся нарастании и снижении амплитуды волн с образованием так называемых «веретён», длительность которых чаще всего колеблется от 2 до 8 с. Различают α-активность (состоит из α-волн с длительностью от 80 до 125 мс и регистрируется в любых мозговых структурах) и α-ритм (регулярная волновая активность с частотой порядка 10 Гц, регистрируемая в затылочных областях).[17]
Рис. 14. Альфа-волна (слева); Альфа-ритм (справа).
Помимо собственно α-ритма, наиболее ярко выраженного в затылочных областях, наблюдаются ещё несколько ритмов, работающих на той же, что и α-ритм частоте, но наиболее проявляющихся в других областях мозга и имеющие другую форму волн (мю-ритм, каппа-ритм, тау-ритм).
Рис. 15 Электрическая активность, зарегистрированная от различных областей коры мозга человека (указаны латинские обозначения областей коры).[18]
Рис. 16. Пример патологичной ЭЭГ взрослого человека.
На рисунке 16 представлена ЭЭГ взрослого человека, перенесшего черепно-мозговую травму - перелом затылочной кости справа (см. рис.16) Там же, справа, возникла гематома. ЭЭГ регистрировалась в реанимации с целью прогноза, жив мозг или нет. Предлагаемая ЭЭГ характеризуется дезорганизацией ритмов во всех отведениях, видна четкая межполушарная асимметрия по амплитуде. Основной преобладающий на данной ЭЭГ частотный ритм - дельта. Также стоит отметить наличие генерализованного альфа-ритма, который в данной ситуации можно назвать альфа-кома. Альфа-кома означает присутствие на фоне почти плоской ЭЭГ коротких участков периодического дельта и альфа-ритма, характеризующих резкое угнетение мозга. Если альфа-ритм - генерализован, то он испускается стволом мозга.[17]
АЛГОРИТМ АНАЛИЗА ЭЛЕКТРОЭНЦЕФАЛОГРАММ В ЧАСТОТНОЙ ОБЛАСТИ
Схема алгоритма показана в приложении А. В начале построения программы вводятся данные сигнала 'eeg_Fp1.txt' (1), которые представлены в виде файла с оцифрованной электроэнцефалограммой.
Далее переходим к вводу периода дискретизации и рассчитываем частоту дискретизации(2).
fd=1/Td;
Рассчитываем частоту Найквиста (2).
fn=fd/2;
После, рассчитываем параметры АЧХ (3), АКФ (4), периодограммы (5), спектрограммы (6).
Устанавливаем параметры фильтра для выделения альфа-ритма (7,8) и фильтруем сигнал (9). Рассчитываем параметры АЧХ (11), АКФ (10), периодограммы (12) и спектрограммы (13) для альфа-ритма сигнала.
Результаты выводятся на экран в двух окнах программной среды MatLab. Затем с помощью программы анализируются сигналы eeg_Fp2.txt, eeg_T4.txt, eeg_C3.txt, eeg_P4.txt.
ПРОГРАММА АНАЛИЗА ЭЭГ
Для реализации алгоритма анализа ЭЭГ используется программный пакет MATLAB.
Для чтения и обработки данных из файлов 'eeg_Fp1.txt', 'eeg_Fp2.txt', 'eeg_T4.txt', 'eeg_C3.txt', 'eeg_P4.txt' использовались следующие функции:
fid=fopen('EEG\eeg_T4.txt','rt'); – функция, позволяющая открыть файл исходного сигнала ЭЭГ;
f - считывание данных с файла;
fid – идентификатор файла;
[2,512] – размер;
fd - период дискретизации;
t – вектор времени;
y – вектор сигнала ЭЭГ;
fclose – функция, реализующая закрытие файла идентификатора;
fd – частота дискретизации;
subplot – разбивает окно для построения в нем нескольких графиков;
plot – строит график;
length – команда для определения длины массива y;
fx - вектор из двох переменных, нижняя и верхняя граничные частоты для фильтра;
figure - выбор окна, в котором реализуется текущее построение графиков;
A - получение абсолютного значения;
title - изменяет название графика;
trapz - рассчитывает площадь;
AKF - расчет параметров АКФ;
[P,f]=pmtm(y,[],[],fd) - расчет периодограммы по методу Томпсона;
specgram(y,[],fd,100) - расчет параметров для построения спектрограммы;
hamming - установка параметров окна. [23]
Графические результаты приведены в приложении В.
ВЫВОДЫ
В процессе разработки курсовой работы была создана программа в среде MatLab, на базе этой программы был проведен автоматизированный анализ оцифрованных энцефалограмм в частотной области. С помощью программы были получены графики периодограмм альфа-ритма, которые были сравнены с нормой. Все сигналы в пределах нормы, в некоторых наблюдаются шумы, возможно это связано с аппаратурой или электродами.
Несложность программы дает возможность ее широкого использования в диагностических целях в медицине. Она соответствует всем требованиям, поставленным в задании курсовой работы.
Список использованной литературы:
1. Методические указания МВП (документация «Нейрософт»).
2. Дамянович Е.В. Функциональная организация соматосенсорного проведения в условиях нормальной и измененной реактивности мозга у человека: Авторед. дисс. ... к.м.н. - М., 1996.
3. Зенков Л.Р., Ронкин М.А. Функциональная диагностика нервных болезней (Руководство для врачей).– 2-е изд., перераб. и доп.– М.: Медицина, 1991.
4. Нейрофизиологические основы формирования психических функций в норме и при аномалиях развития. Тезисы докладов юбилейной конференции, посвященной 80-летию со дня рождения профессора Новиковой Л.А. Москва, 4-6 декабря 1995 г.– М., 1995.
5. Перкин Г.Д. Диагностические тесты в неврологии: Пер. с англ.– М.: Медицина, 1994.
6. Покровская З.А., Парканская В.И. Зрительные вызванные потенциалы в дифференциальной диагностике сосудистых и демиелинизирующих поражений зрительного нерва // Журнал невропатологии и психиатрии.– 1989.– № 1.– С. 12-15.
7. Фильчикова Л.И. с соавт. Вызванные потенциалы на пространственно- структурированные стимулы в раннем онтогенезе // Физиология человека.– 1988.– Том 14.– №1.– С. 58-64.
8. «Биопотенциалы мозга человека. Математический анализ» под редакцией Русинова В. С. –М.: Медицина 1987г.
9. http://neuro.tele-kom.ru/neirofiz.shtml.
10. http://www.fnii.pu.ru/win/eeglab/trwave.htm
11. http://www.nevromed.ru/diagnostica/ep/
12. Сахаров В. Л., Андреенко А. С. «Методы математической обработки энцефалограмм» -Таганрог 2000г.
13. Анохин П. К., «Принципы системной организации функций» - М.: Наука 1973г.
14. «Биопотенциалы мозга человека. Математический анализ» под редакцией Русинова В. С. –М.: Медицина 1987г.
15. Апанасионок. В.С. Динамика пространственных отношений фаз доминирующих ко-лебаний биопотенциалов головного мозга у взрослых и детей. Физиол. Человека. 2(1): 100-108. 1976.
16. Шеповальников А.Н., Цицерошин М.Н., Апанасионок В.С. Формирование биопо-тенциального поля мозга человека. Л.:Наука. 163с. 1979.
17. Шевелев И.А., Барк Е.Д., Верхлютов В.М. Альфа-сканирование зрительной коры: данные ЭЭГ и магнитно-резонансной томографии // Росс. Физиол. Ж. 2001. Т.87. №8. С.1050.
18. Дубикайтис Ю.В., Дубикайтис В.В. О потенциальном поле и альфа-ритме на поверхности головы человека // Биофизика. 1962. Т.7. №3.
19. Каменкович В.М., Барк Е.Д., Шевелев И.А., Шараев Г.А. Связь зрительных иллюзий с частотой и фазовым сдвигом ритмической фотостимуляции // ЖВНД. 1997. Т.47.
20. Гнездицкий В. В. «Вызванные потенциалы головного мозгав клинической практике».
21. Биопотенциалы мозга человека. Математический анализ/ Под ред. В.С.Русинова; АМН СССР.-М.: Медицина, 1987.
-
Павлова О.Н., Павлов А.Н. «Регистрация и предварительная обработка сигналов с помощью измерительного комплекса МР100» Саратов: Научная книга, 2008.
-
В.Г. Потемкин. MATLAB: Справочное пособие – М.: «Диалог МИФИ», 1997.
-
Сахаров В.Л. «Методы и средства анализа медико-биологической информации: Учебно-методическое пособие» Таганрог: Изд-во ТРТУ, 2001.
Приложение А
АЛГОРИТМ АНАЛИЗА ЭЛЕКТРОЭНЦЕФАЛОГРАММЫ В ЧАСТОТНОЙ ОБЛАСТИ
Приложение Б
ПРОГРАММА ДЛЯ АНАЛИЗА ЭЭГ В ЧАСТОТНОЙ ОБЛАСТИ
clear all;
figure(1);
fid=fopen('eeg_Fp2_1.txt','rt');
f=fscanf(fid,'%f',[2,512]);
t=f(1,:);
y=f(2,:);
fclose(fid);
subplot(5,1,1);
plot(t,y);
title('eeg_Fp2_1.txt');
T=0.001;
A=abs(fft(y));
fd=1/T;
fn=fd/2;
f=-fd/2:fd/(length(y)-1):fd/2;
subplot(5,1,2);
stem(f,fftshift(A));
title('spectrum');
AKF=xcorr(y);
tau=-t(length(t)):2*t(length(t))/(length(AKF)-1):t(length(t));
subplot(5,1,3);
plot(tau,AKF);
title('AKF');
[P,f]=pmtm(y,[],[],fd);
subplot(5,1,4);
plot(f,P);
title('periodogram');
subplot(5,1,5);
specgram(y,[],fd,100);
title('specgram');
%filt param
n=170;
a=1;
w=hamming(length(y)+1);
fn=fd/2;
%alpha Fp1
figure(2);
fx=[8 13];
b=fir1(n,fx/fn);
[h,wn]=freqz(b,a);
subplot(6,1,1);
plot(wn*fn/pi,abs(h));
title('filter');
y1=filtfilt(b,a,y);
subplot(6,1,2);
plot(t,y1);
title('alpha eeg_ Fp2_1.txt');
AKF=xcorr(y1);
tau=-t(length(t)):2*t(length(t))/(length(AKF)-1):t(length(t));
subplot(6,1,3);
plot(tau,AKF);
title('alpha AKF');
A1=abs(fft(y1));
f1=-fd/2:fd/(length(y1)-1):fd/2;
subplot(6,1,4);
stem(f1,fftshift(A1));
title('alpha spectrum');
[P,f_1]=pmtm(y1,[],[],fd);
subplot(6,1,5);
plot(f_1,P);
title('periodogram');
subplot(6,1,6);
specgram(y1,[],fd,100);
title('specgram');
Приложение В
РЕЗУЛЬТАТЫ АНАЛИЗА ЭЭГ В ПРОГРАММНОЙ СРЕДЕ MATLAB
Рисунок B.1 – Входной ЭЭГ сигнал ('eeg_Fp1.txt'), его АЧХ, АКФ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.2 – Фильтр альфа-ритма сигнала 'eeg_Fp1.txt', альфа-ритм, его АКФ, АЧХ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.3 – Входной ЭЭГ сигнал ('eeg_Fp2.txt'), его АЧХ, АКФ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.4 – Фильтр альфа-ритма сигнала 'eeg_Fp2.txt', альфа-ритм, его АКФ, АЧХ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.5 – Входной ЭЭГ сигнал ('eeg_T4.txt'), его АЧХ, АКФ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.6 – Фильтр альфа-ритма сигнала 'eeg_T4.txt', альфа-ритм, его АКФ, АЧХ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.7 – Входной ЭЭГ сигнал ('eeg_C3.txt'), его АЧХ, АКФ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.8 – Фильтр альфа-ритма сигнала 'eeg_C3.txt', альфа-ритм, его АКФ, АЧХ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.9 – Входной ЭЭГ сигнал ('eeg_P4.txt'), его АЧХ, АКФ, периодограмма и спектрограмма
Рисунок B.10 – Фильтр альфа-ритма сигнала 'eeg_P4.txt', альфа-ритм, его АКФ, АЧХ, периодограмма и спектрограмма.