ВКР: Конформационные изменения ДНК при взаимодействии с малыми пептидами

Оглавление

Введение
Глава 1 Обзор литературы
1.1 Конформация молекулы ДНК в растворе
1.2 Общие сведения о ДНК-белковом взаимодействии
1.3 Биологическая активность коротких белков
Глава 2 Материалы и методы
2.1 Общая характеристика материалов
2.2 Спектрофотометрия
2.4 Низкоградиентная вискозиметрия
2.5 Флуоресцентная спектроскопия
2.6 Метод изотермического калориметрического титрования
2.7 Метод ядерного магнитного резонанса
Глава 3 Результаты и обсуждение
3.1 Исследование влияния пептида AEDL на конформацию ДНК
3.1.1 Спектрофотометрия
3.1.2 Флуоресцентная спектроскопия
3.1.3 Низкоградиентная вискозиметрия
3.1.4 Калориметрия
3.1.5 ЯМР
3.2 Исследование влияния пептида EDR на конформацию ДНК
3.2.1 Спектрофотометрия
3.2.2 Флуоресцентная спектроскопия
3.2.3 Калориметрия
3.2.5 ЯМР
3.3 Исследование влияния пептида KEDW на конформацию ДНК
3.3.1 Спектрофотометрия и КД
3.3.2 Флуоресцентная спектроскопия
3.3.3 Низкоградиентная вискозиметрия
3.3.4 Калориметрия
3.3.5 ЯМР
Заключение
Выводы
Список литературы
Приложение А. H-спектры и спектры WaterLOGSY для комплексов пептида AEDL cолигонуклеотидами.
Приложение Б. H-спектры и спектры WaterLOGSY для комплексов пептида EDR cолигонуклеотидами.
Приложение В. H-спектры и спектры WaterLOGSY для комплексов пептида KEDW cолигонуклеотидами.
Приложение Г. H-спектры олигонуклеотидов DNA 1, DNA2, DNA3.

Введение

Существует связь между биологическим старением организма и замедлением метаболических процессов в клетках, что, в свою очередь, обусловлено множеством факторов. Одним из таких факторов является понижение интенсивности транскрипции ДНК.
Короткие пептиды, способны проникать через клеточные мембраны, влиять на эпигенетические процессы в клеточном ядре, и, как следствие, оказывать влияние на пролиферацию и дифференцировку клеток, осуществляемой факторами транскрипции.
В работах Хавинсона В.Х с соавторами было показано, что что некоторые короткие пептиды, являющиеся аналогами пептидов, выделенных из тканей животных, способны стимулировать синтез белка в клетках и усиливать экспрессию генов. Также, осуществляя регуляцию активности теломераз, пептиды способствуют элонгации теломер в соматических клетках человека. Изучаемые в работе пептиды были