Курсовая работа: Применение Hi-C к метагеномике

Оглавление



3































































4

Введение

Биоинформатика – одна из наиболее быстро развивающихся областей науки на текущий момент, объединяющая достижения биологии и Com-puter Science. Одной из важнейших проблем биоинформатики является сборка генома. Первым частично собранным геномом стал геном чело-века. Проект «Геном человека» (англ. The Human Genome Project) [19] продолжался на протяжении более десяти лет, и на его осуществление было израсходовано более трех миллиардов долларов. Современное науч-ное сообщество считает достижение успехом, продвинувшим область да-леко вперед, привлекшим колоссальные инвестиции и оказавшим огром-ное влияние на биоинформатику.

Особый интерес представляет изучение геномов микроорганизмов. Не-смотря на малые размеры, данные организмы зачастую обладают неверо-ятными по современным меркам биологическими инструментами, некото-рые из которых адаптированы человеком в своих целях. Так ретровирусы обладают возможностью встраивать гены в клетки организма-носителя и таким образом самовоспроизводиться, что было использовано учеными для развития генотерапии [4]. Некоторые бактерии обладают адаптив-ной имунной системой [29], основанной на встраивании в собственный геном участков геномов враждебных вирусов или иных микроорганизмов для их идентификации и последующего уничтожения. На основе этого учеными были разработаны средства для редактирования генома [5], ко-торые в частности планируется использовать для борьбы с раком [7] и ВИЧ-инфекцией [6] и создания генно-модифицированных продуктов без добавления чужеродной ДНК [11].