molbiol2_2013-2014 (Молекулярная биология. Часть 2. Структура рибосомы и биосинтез белка. Лекции А.С.Спирина и В.А.Колба, 2014-2015)
Описание файла
Файл "molbiol2_2013-2014" внутри архива находится в папке "Молекулярная биология. Часть 2. Структура рибосомы и биосинтез белка. Лекции А.С.Спирина и В.А.Колба, 2014-2015". PDF-файл из архива "Молекулярная биология. Часть 2. Структура рибосомы и биосинтез белка. Лекции А.С.Спирина и В.А.Колба, 2014-2015", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "биохимия" из 5 семестр, которые можно найти в файловом архиве МГУ им. Ломоносова. Не смотря на прямую связь этого архива с МГУ им. Ломоносова, его также можно найти и в других разделах. .
Просмотр PDF-файла онлайн
Текст из PDF
Вопросы к экзамену по молекулярной биологии, части II1. Центральная догма молекулярной биолгии. Общая схема биосинтеза белка, роль РНК в этомпроцессе.2. Общие принципы структуры РНК. "Мир РНК", гипотеза о роли РНК в происхождении жизни.3. Расшифровка генетического кода. Основные свойства генетического кода. Особенностикодового словаря.4. Информационная РНК, ее структура и функциональные участки.5. Открытие тРНК.
Их первичная, вторичная и третичная структура. Модифицированныенуклеотиды.6. Аминоацилирование тРНК. Аминоацил-тРНК-синтетазы, их структура и механизм действия.Специфичность аминоацилирования.7. Рибосомы, их локализация в клетке. Прокариотический и эукариотический типы рибосом.Последовательное считывание мРНК рибосомами, полирибосомы.8. Митохондриальные рибосомы.9.
Морфология рибосомы. Размеры, внешний вид, подразделение на две субъединицы. Детальнаяформа рибосомных субъединиц, объединение субъединиц в целую рибосому.10. Рибосомные РНК, их доменная и третичная структуры. Дальние взаимодействия,обеспечивающие компактное сворачивание РНК.11. Рибосомные белки, их разнообразие и номенклатура.
Взаимодействие с рРНК.12. Структурные превращения рибосомных частиц. Диссоциация рибосом на субъединицы.Разворачивание субъединиц. Разборка и обратная сборка субъединиц.13. Стадии трансляции: инициация, элонгация и терминация. Бесклеточные системы трансляции.Химические реакции и общий энергетический баланс биосинтеза белка.14. Функциональные центры рибосомы, элонгационный цикл, кодон-зависимое связываниеаминоацил-тРНК.15. Элонгация: первый этап – поступление аминоацил-тРНК в рибосому.
Концепция антикодона,кодон-антикодоновое взаимодействие, адапторная гипотеза и ее доказательство.16. Стереохимия кодон-антикодонового спаривания. Гипотеза нестрогого соответствия (wobbleгипотеза).17. Участие белкового фактора элонгации в связывании аминоацил-тРНК. Белок EF-Tu (EF1) какмолекулярная машина челночного типа.18. Кодирование селеноцистеина.19.
Второй этап элонгации – транспептидация. Химия и энергетический баланс реакции.Ингибиторы. Стереохимия транспептидации, перемещение продуктов реакции.20. Третий этап элонгации - транслокация. Экспериментальные тесты, участие фактора элонгации2 (ЕF-G или ЕF-2), роль гидролиза ГТФ. Последовательность событий, ингибиторы.21. Бесфакторная («неэнзиматическая») транслокация. «Катализ» конформационных переходов.22. Крупноблочная подвижность рибосомы и концепция смыкания-размыкания.
Общие принципыфункционирования рибосом.23. Ложное кодирование: основные типы, уровень ошибок в нормальных условиях, кинетическиемеханизмы ложного кодирования и его коррекции.24. Ошибки связывания аминоацил-тРНК: сдвиг рамки считывания. Ошибки транслокации: Сдвиграмки считывания и «прыжки» рибосомы.25. Принципы работы молекулярных машин. Структурные особенности молекулярных машин.Ректификация броуновского движения.
Молекулярный «храповик с собачкой».26. Рабочий цикл сканирующего 43S рибосомного комплекса как молекулярной машиныконвейерного типа.27. Транслирующая рибосома как молекулярная машина конвейерного типа.28. Инициация трансляции. Общие принципы, значение, основные этапы инициации.29. Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом намРНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации. Последовательность событий.30. Конститутивный контроль трансляции на стадии инициации.31.
Индуцированная инициация трансляции. Реинициация.32. Трансляционная репрессия. Регуляция трансляции фаговой (MS2) РНК.33. Регуляция синтеза рибосомных белков.34. Регуляция трансляции аптамерными модулями мРНК («рибопереключения»).35. Регуляция трансляции антисмысловыми и комплементарными РНК.36. Особенности инициации трансляции у эукариот.
Основные белковые факторы инициациитрансляции.37. АТФ-зависимое сканирование 5'-нетранслируемой области.38. Особенности инициации трансляции вирусных РНК (IRESs, ITAFs, polyproteins).39. Трансляционная репрессия эукариотических мРНК.40. Тотальная негативная регуляция инициации трансляции эукариотических мРНК (eIF2-киназы,eIF4E-связывающий белок).41.
Регуляция трансляции у эукариот: 3'-концевые инициаторы и усилители инициации.42. Маскирование – демаскирование мРНК.43. Терминация трансляции. Механизм реакции терминации трансляции. Последовательностьсобытий в процессе терминации трансляции.44. Трансляционные паузы.45. Пути растущего полипептида.46. Трансмембранная транслокация растущего полипептида.47. Котрансляционная и посттрансляционная трансмембранная транслокацияновосинтезированного белка у грам-отрицательных бактерий.