Отзыв на автореферат 4 (Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови)

ОТЗЫВ на автореферат диссертации Галочкиной Татьяны Владимировны «Моделирование Структуры липополисахаридОВ и их роли В процессе патолОГическОГО свертыВания крови», предстаВленноЙ на соискание ученоЙ степени кандидата физико-математических наук пО специальности 03.01.02 — биофизика. Диссертационная работа Галочкиной Татьяны Владимировны посвящена актуальной Проблеме — исследованию динамическоЙ структуры липополисахаридов бактериальной Мембраны, их надмолекулярноЙ Организации и активации Процессов Свертывания Крови.

Актуальность Исследования Обусловлена, с Одной сторОны„фундаментальными задачами биофизики - Вопросами Взаимосвязи Структуры и функциЙ биологических Молекул, с другоЙ сторон~, острой неоходимостью наращивания теоретической базы для разработки подходов к ликвидации ПоследствиЙ Сепсиса. Полученные данные расширяют Понимание Принципов пороГОВОЙ актиВации системы сВертыВания кроВи и структурных аспектоВ липополисахаридов, что может быть использовано для разработки специфических собрентов при заражении крови и реГуляторОВ процессоВ тромбообразования. Для решения поставленных задач в диссертационной работе был применен ОригинальныЙ подход, ОснОванный на сочетании Современных МетодоВ Математического Моделирования и Молекулярной динамики (МД). Разработана Кинетическая МОдель активации КонтактноЙ Системы липополисахаридными агрегатами.

Теоретически Оценены Величина критическоГО Возмущения системы свертыВания и критический размер пОВреждения, ВедущеГО к закупорке сосуда. Отдельную ценность предстаВляют результаты анализа кОнформационнОГО поВедениЯ полисахариднОЙ цепи О-антиГена В растВоре и В Окружении липидной Мембраны, в т.ч. ВключающеЙ белок, Немаловажно, что Особое Внимание уделено Обстоятельному Тестированию Силовых полеЙ и Начальных условиЙ для МД Моделирования углеводной Части липополисахаридов, что позволило автору получить, безусловно, Важные результаты на соВременном уровне. В целом автОреферат производит Впечатление законченноЙ ИсследовательскоЙ работы, Есть неболыпие Замечания.

Рисунок 1 В, Представляющий Схему Основных реакциЙ Каскада Свертывания Крови, не Снабжен расшифровкоЙ используемых Символов, что представляет затруднение для понимания. То же касается рисунка 6 А, на котором используемся цветовое Кодирование без расшифровки. Неаккуратность В Используемых Сокращениях, например, автОр использует "Ага" для 1.-арабинОЗЫ, но Остается неясным, О чем именно идет речь, О арабинофуранозе или арабинопиранозе. Полагаю, впрочем, что эти недостатки обусловлены лишь Сжатым Объемом автореферата, но их нет В СамоЙ диссертационноЙ работе. Считаю, что данная работа удовлетворяет Требованиям, установленным в Положении о присуждении ученых степеней в Московском государственном университете имени М,В, Ломоносова, а ее автор Галочкина Та*ьяна Владимировна несомненно Заслуживает присуждения искОмОЙ степени кандидата физико "математических наук по специальности 03.01.02 — биофизика.

СОТРУДНИК О,Н, Макшакова Кандидат биолоГических наук, старший научных лаборатории биофизической Химии наносистем Учреждения Российской Академии наук Казанского института биохимии и биофизики Казанского научноГО центра РОссийскОЙ академии наук Адрес: 420111, г. Казань, ул. Лобачевского, 2/31, Тел.: +7 (843) 2319037 Е-та11. ПийвЬа1соча®ЫЬ1~~М,.''~;,'..',. '-,-",:, - ""'*у ;Ё 1 28 сентября 2017 года .