Отзыв на автореферат 1 (Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови)

ОТЗЫВ на автореферат диссертации Галочкиной Т,В. «Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови», представленной на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. !. Актуальность темы диссертации. Гемостаз (образование сгустка) является жизненно важной системой защиты организма от потери крови. Нарушения гемостаза, которые выражаются в кровоточивости и тромбозах, могут развиваться при различных заболеваниях.

Так, бактериальная инфекция может приводить к развитию диссеминированного внутрисосудистого свертывания, которое часто' бывает летальным. Считается, что такое влияние бактериальной инфекции на систему свертывания крови обусловлено особым строением бактериальной стенки, содержащей множество липополисахаридов. Экспериментальное описание пространственной структуры липополисахаридов (ЛПС) осложняется существенной вариабельностью их химического состава. В то же время, устройство надмолекулярных агрегатов ЛПС, как и пространственная организация ЛПС- мембран, во многом определяют степень их биологической активности, в том числе, и в степени активации системы свертывания крови.

Диссертация Галочкиной '!'.В. посвящена детальному изучению структуры липополисахаридов и ее влиянию на процесс свертывания крови, что и определяет актуальность данной работы. 2. Оценка новизны научной работы. В работе разработан ряд моделей ЛПС и ЛПС-содержащих систем. Анализ конформационной подвижности ЛПС в различном окружении !в растворе, в составе мембран и агрегатов) проведен при помощи расчетов молекулярной динамики. Большое внимание уделено выбору силового поля для адекватного воспроизведения конформаций полисахаридной части молекул, а также получению корректной началыюй структуры.

Молекулярно-динамические модели ЛПС-мембран начинают появляться только в последние годы, и новизна полученных Галочкиной Т.В. результатов, в том числе, и с точки зрения использованных методологических подходов, не оставляет сомнений. В перспективе, аккуратно валидированные модели такого типа могут быть использованы для разработки специфичных ЛПС-сорбентов, а также для объяснения разницы в степени биологической активности ЛПС бактерий разных штаммов. 3. Замечания. 1) Из текста автореферата не ящю, какие модели свертывания крови использовал автор.

Если эти модели были разработаны в рамках данной работы, то в автореферате должно быть упоминание о том, как происходила эта разработка и присутствовать краткое описание созданных моделей, Если использовались модели, ранее разработанные другими группами, должны быть ссылки на работы, в которых они описаны.

2) В автореферате не указаны критерии выбора модели свертывания крови. Насколько полной она должна быть для того, чтобы можно было оценивать эффект липополисахаридов на свертывание крови. 3) Не показано, как прокоагулянтпый эффект липополисахаридов зависит от их структуры. Перечисленные замечания не снижают научной и практической ценности диссертационной работы Галочкиной Т.В., которая соответствует специальности "биофизика", является законченным научным исследованием, выполненным гю актуальной тематике и на высоком уровне. Результаты диссертации в достаточной степени апробированы и опубликованы автором, в том числе в журналах из перечня ВАК. 4.

Заключение В связи с изложенным считаю, что диссертационная работа Галочкиной Т,В. «Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови» удовлетворяет требованиям Положения о присуждении ученых степеней в Московском государственном университете имени М.В. Ломоносова, предъявляемым к кандидатским диссертациям, а ее автор заслуживает присуждения ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.02 - биофизика. А.М. Шибеко, к.б.н.

Ведущий научный сотрудник, Лаборатория физиологии и биофизики клетки, Центр Теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН Адрес: Москва, 119991, ул. Косыгина 4 '1"елефон: +7-495- 938-25- 33 Мейл: деге1зе1фта1!.ги .