Диссертация (Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови), страница 7

PDF-файл Диссертация (Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови), страница 7 Физико-математические науки (33579): Диссертация - Аспирантура и докторантураДиссертация (Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови) - PDF, страница 7 (33579) - СтудИзба2019-03-14СтудИзба

Описание файла

Файл "Диссертация" внутри архива находится в папке "Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови". PDF-файл из архива "Моделирование структуры липополисахаридов и их роли в процессе патологического свертывания крови", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "физико-математические науки" из Аспирантура и докторантура, которые можно найти в файловом архиве МГУ им. Ломоносова. Не смотря на прямую связь этого архива с МГУ им. Ломоносова, его также можно найти и в других разделах. , а ещё этот архив представляет собой кандидатскую диссертацию, поэтому ещё представлен в разделе всех диссертаций на соискание учёной степени кандидата физико-математических наук.

Просмотр PDF-файла онлайн

Текст 7 страницы из PDF

1.2).ЛПС необходимы для выживания грамотрицательных бактерий, поскольку именно они26Рис. 1.2: Устройство клеточной стенки грамотрицательной бактерии.обеспечивают правильную сборку наружной мембраны. ЛПС — это амфифильные макромолекулы, которые образуют специфичный полупроницаемый барьер для различных классовмолекул, включая детергенты, антибиотики и токсичные красители или металлы. Барьерныесвойства наружной мембраны обусловлены ее низкой текучестью, достигаемой за счет высокой степени упорядоченности структуры и большой молекулярной массы ЛПС-монослоя.Именно молекулы ЛПС, расположенные на поверхности клетки, взаимодействуют с другимибиологическими системами, участвуя в таких взаимодействиях бактерии с клетками хозяина,как адгезия, колонизация, вирулентность, и симбиоз. ЛПС, также называемый эндотоксином, является мощным стимулятором врожденных иммунных реакций и играет ключевуюроль в патогенезе грамотрицательных инфекций у растений и животных [169].2.1Структура ЛПСВ большинстве бактерий ЛПС имеет стандартную общую структуру, включающую в себятри домена: гидрофобный фрагмент, называемый липидом A, гидрофильный гликан, называемый O-специфическим полисахаридом (также известный как O-антиген) и связывающийих друг с другом центральный или коровый олигосахарид.

Углеводная цепь экспонированана поверхности клетки, в то время как липид А участвует в формировании гидрофобно-27го бислоя наружной мембраны и, таким образом, заякоривает молекулы ЛПС [167, 170]. Всилу особенностей структуры поверхности клеток, различимой под электронным микроскопом, штаммы бактерий, экспрессирующие полноразмерные молекулы ЛПС, содержащая всетри домена, получили название “гладких” (“smooth”, S-LPS), тогда как штаммы не имеющие O-антигенной цепи и/или частей центрального олигосахарида были названы “грубыми” (“rough”, R-LPS).2.1.1Липид АПрактически все иммуногенные свойства молекулы ЛПС связанны с присутствием в ееструктуре липида А [166, 170, 171].

Липид А действует как мощный стимулятор врожденной иммунной системы, так как он непосредственно связывается с Толл-подобным рецептором TLR4 [172, 173], что вызывает широкий спектр биологических эффектов, от повышенияуровня устойчивости к инфекции до неконтролируемого и массивного иммунного ответа,приводящего к сепсису и септическому шоку. Биоактивность липида А, включая способность взаимодействовать и активировать рецепторы иммунной системы, сильно зависит отего химической структуры.В большинстве изученных на сегодняшний день бактерий основой липида А являетсядисахарид N-ацетил-D-глюкозамина (GlcNAc I и II), каждый из моносахаридов которогофосфорилирован и ацилирован двумя 3-гидрокси жирными кислотами в положениях 2 и 3через амидные и сложноэфирные связи. Первичные ацильные цепи (общим числом четырештуки), непосредственно связанные с углеводной основой, могут быть ацилированы вторичными ацильными цепями по гидрокси-группе. Один или оба остатка GlcNAc могут бытьтакже заменены остатками 2,3-диамино-2,3-дидезокси-D-глюкопиранозы (GlcN3N).

Фосфатные группы могут быть замещены другими полярными группами или же одна из фосфатныхгрупп может отсутствовать [174]. Таким образом, хотя липид A и является наиболее консервативной частью молекулы ЛПС, структура его весьма вариабельна, так как количествофосфатных групп и их заменителей, а также количество и длина ацильных цепей можетразличаться [165].2.1.2Центральный олигосахаридЦентральный олигосахарид (кор) может быть условно разделен на две части: проксимальную — внутреннее ядро, и дистальную, расположенную, ближе к О-антигену — внешнее ядро. Внутреннее ядро содержит, по меньшей мере, один остаток 3-дезокси-D-манно-28окт-2-улозоновой кислоты (Kdo) и несколько остатков L-глицеро-D-манно-гептозы (L,DHep) [166, 175, 176]. Kdo редко встречается в других углеводах и поэтому может рассматриваться как маркер присутствия ЛПС. Внутренне ядро часто содержит и иные заместители, обычно присутствующие в нестехиометрических количествах: фосфаты, дифосфат, 2аминоэтилфосфат или 2-аминоэтилдифосфат, уроновые кислоты (D-GalA) и различные модифицированные остатки, такие как, например, 4-амино-4-дезокси-L-арабиноза (L-Ara4N).Внешнее ядро демонстрирует большее структурное разнообразие, чем внутреннее ядро.

Подробный обзор его различных структур представлен в [174]. Наиболее часто встречающимисяуглеводами внешнего ядра являются D-глюкоза, D-галактоза и N-ацетил-D-глюкозамин [173].За счет электростатических взаимодействий анионные группы, присутствующие в составе2+центрального олигосахарида и липида А, связываются с двухвалентными катионами (Mg2+и Ca ), тем самым сшивая молекулы ЛПС друг с другом. Этот эффект существенно увеличивает устойчивость внешней мембраны и снижает ее проницаемость, тем самым усиливаяее барьерные свойства [164, 177, 178]. В то же время, отрицательно заряженные группы частоявляются мишенью для антимикробных катионных пептидов. При этом, присутствие остатков 4-амино-4-дезокси-L-арабинозы (Ara4N) в составе липида А ЛПС многих бактерий можетэкранировать отрицательный заряд ЛПС и повышать устойчивость бактерии к воздействиюантимикробных препаратов.2.1.3О-антигенО-антиген является самым внешним гидрофильный доменом молекулы ЛПС, который обязан своим названием способности индуцировать адаптивный иммунный ответ.

По своей химической структуре О-антиген представляет собой полисахарид, содержащий до50оли-госахаридных повторяющихся звеньев (repeating units, RU), каждый фрагмент состоит издвух-восьми гексозных или пентозных остатков и может быть линейным, либо разветвленным [173, 174, 179]. Химический состав О-антигена и его длина являются биологическимимаркерами вирулентности [24, 173], и их различия являются определяющим фактором прибактериальной серологической типизации [174, 180]. В “гладких” бактериальных штаммахгетерогенный слой О-антигенов предоставляет дополнительную защиту от комплемента иантител хозяина и значительно влияет на способность бактерий адаптироваться к окружающей среде [24, 181, 182]. Возможный защитный механизм, обеспечиваемый слоем О-антигена,был предложен по результатам анализа адгезии клеток E.

coli на кварцевую поверхность.Была выдвинута гипотеза о том, что О-антигены вносят вклад в устойчивость мембраны29путем экранирования отрицательно заряженных частей центрального олигосахарида и липида А [183].Распределение длин О-антигенов в реальных мембранах обычно имеет три пика, соответствующие коротким (< 4 RU), длинным (10–40 RU) и очень длинным (> 90–100 RU) цепям,что влияет на бактериальную устойчивость к атаке комплемента и поглощению макрофагами [24, 181]. Бактерии штаммов Salmonella typhimurium с очень большими модальнымидлинами О-антигенов (> 100 RU) полностью устойчивы к поедание макрофагами. Клетки скороткими О-антигенами, состоящими из 2–4 RU, очень чувствительны к воздействию комплемента, тогда как ЛПС с > 10 RU устойчивы к действию системы комплемента.

Былоустановлено, что минимальная длина О-антигена, обеспечивающая защиту от атаки комплемента, составляет от 4 до 15 повторяющихся звеньев [24].Разнообразие химического состава повторяющихся звеньев, а также структуры идлины О-антигенов делают их наиболее вариабельной частью ЛПС. Основными экспериментальными подходами, используемыми для определения первичной структуры Оантигенов служат методы гидролиза и различные виды хроматографии с последующей массспектрометрией [184]. На сегодняшний день химический состав О-антигенов достаточно хорошо охарактеризован и подробно описан в [174].2.2Влияние структуры ЛПС на биологическую активностьРазвитие сепсиса в ответ на попадание в кровь ЛПС напрямую связано с их взаимодействиемс клетками хозяина: клетками эндотелия, моноцитами, нейтрофилами, и макрофагами.

Клеточная активация ведет к повышенному уровню экспрессии воспалительных цитокинов всеми перечисленными типами клеток, а также к экспрессии ТФ на моноцитах и эндотелии [2],и возможно, запуску апоптоза эндотелиальных клеток [144]. Такая воспалительная реакцияв совокупности с активацией системы комплемента и повышением уровня микровезикул ведет к усиленной активации системы свертывания и диссеминированному внутрисосудистомутромбозу.Распознавание клеточной поверхностью ЛПС как в случае клеток эндотелия [185], так илейкоцитами [186], осуществляется при взаимодействии ЛПС с комплексом Толл-подобногорецептора 4 (Toll-like receptor 4, TLR4) и белка MD-2 [187,188].

Распознавание ЛПС происходит после его связывания с ЛПС-связывающим белком (LPS-binding protein, LBP). LBP переносит ЛПС на мембранный белок CD14 [189], который связывается к комплексом LPS-LBPи облегчает перенос ЛПС на белок MD-2, который, в свою очередь, связан с внеклеточным30доменом TLR4 [190]. Связывание с ЛПС способствует димеризации мембранного комплексаTLR4/MD-2, что запускает сигнальные пути, активирующие экспрессию цитокинов [2].Взаимодействие ЛПС с комплексом TLR4/MD-2 существенно зависит от надмолекулярной структуры ЛПС. Из-за их амфифильной природы молекулы ЛПС имеют тенденциюобразовывать агрегаты, биологическая активность которых может во многом превышатьактивность отдельных молекул ЛПС [19, 191]. Существует гипотеза, согласно которой мономеры ЛПС ответственны за активацию комплекса TLR4/MD-2 через связывание с мембранным рецептором CD14, а агрегаты ЛПС могут активировать комплекс без взаимодействияс CD14 [21, 192].

Это предположение косвенно подтверждается тем фактом, что при низких концентрациях ЛПС CD14 оказывается необходим для активации экспрессии цитокиновмакрофагами, в то время как при высоких концентрациях их активация от CD14 не зависит [193, 194].Принципиальную роль в образовании агрегатов и степени биологической активности ЛПСиграет липид А, который отвечает за связывание ЛПС с рецепторами и, тем самым, обеспечивает эндотоксическую активность ЛПС [22, 195–199]. Определяющими факторами уровняагонистической или антагонистической активности липида А является плотность отрицательного заряда на полярных головках, а также угол наклона дисахаридной основы и общаяформа молекулы. Наклон гликозидной связи относительно гидрофобной области определяетто, насколько аномерный фосфат на GlcN I экспонирован за пределы поверхности наружноймембраны. В совокупности с величиной заряда на полярной головке, структура гидрофильной основы липида А определяет специфичность его связывания с целевыми рецепторами [174].

В то же время гидрофобная область в значительной степени определяет последующую активацию иммунного ответа [192]. Только виды, чья первичная структура ЛПС придает коническую форму молекуле, являются эндотоксически активными [200]. Гидрофобнаячасть липида А, в этом случае, имеет большое поперечное сечение и может взаимодействовать с сайтами гидрофобного связывания комплекса TLR4/MD-2, активируя трансмембранную сигнализацию. Виды с липидом А цилиндрической формы не способны индуцироватьсоответствующее механическое напряжение для активации рецепторов [200]. Различия в пространственной структуре липида А также существенно сказываются на структуре и активности образуемых агрегатов. Только молекулы ЛПС, образующие неламеллярные (кубическиеили гексагональные) агрегаты, являются биологически активными [197–199, 201].Полисахаридная составляющая ЛПС также оказывает существенное влияние на форму,структуру и активность надмолекулярных ЛПС-структур.

Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
5224
Авторов
на СтудИзбе
428
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее