Отзыв на автореферат д.х.н., профессора ЛященкоА.К. (Исследование топологии гидратных оболочек белков)

ОТЗЫВ на автореферат диссертации Рубцовой Екатерины Владимировны «Исследование топологии гидратных оболочек белков», представленной на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.02 — биофизика. Диссертационная работа Е.В.Рубцовой посвящена проблеме строения гидратных оболочек белков различных типов (в первую очередь, молекул коллагена), а также организации растворов на их основе.

Следует отметить, что в данной работе рассматриваются не термодинамические и статистические особенности таких систем, а топологические закономерности их строения. Это интенсивно развивающееся сейчас направление науки, важное для биофизики. При этом роль водной составляющей выступает на первый план, т.к. именно структура исходной воды и ее изменения в ближайшем окружении растворенных частиц задает принцип организации таких растворов и водных биологических объектов. Таким образом, тема настоящего исследования является актуальной.

Его результаты обладают несомненной новизной. В работе было установлено различие распределения собственных геометрических параметров сеток водордных связей в объемной воде и гидратных оболочках белков, показано отсутствие нарушенных переходных слоев в области дальней гидратации, определена плотность распределения молекул воды в гидратных оболочках и ее отличия от объемной воды, а также другие свойства гидратных оболочек. Самостоятельный интерес представляют данные о распределении валентных и торсионных углов и характерных циклах гидратных оболочек и их связи между собой. Таким образом, исследование имеет комплексный характер.

В результате работы показано, что топологический анализ является очень эффективным для целей исследования гидратных оболочек. Становится ясно, что их нельзя рассматривать вне анализа строения остальной воды. Эти интересные результаты фактически показывают, что в среде присутствуют синергетические эффекты, .