Отзыв на автореферат 2 (Атомно-силовая микроскопия сигма(70)-субъединицы РНК-полимеразы E.coli)

отзыв на авторефера~ диссертации Кузьминой Напшьи Викторовны "Атомно-силовая микроскопия сигма1701-субъединицы!'НК-полимеразы Е Сп11", представленной на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. Специальность 03.01.02 - "Биофизика", 03.01.08 - "Биоинженерия". Диссертационная работа посвящена исследованию процесса агрегации а 70 субъединицы РНК-полимеразы ЕСо11. Практический и научный интерес к исследованиям процессов амилоидной агрегации, с одной стороны, обусловлен их связью с нейродегенеративными болезнями Альцгеймера, Паркинсона, Хантинггона, диабетом второго типа и др.

С другой стропы, стабильность амилоидных фибрилл при высоких температурах и их механические свойства делают перспективным их использование в различных биоинженерных направлениях. Таким образом, актуальность выбранной диссертационной темы не вызывает сомнений. Вопросы, связанные с выявлением физико-химических характеристик агрегации о 70 субъединицы РНК-полимеразы Е.Со11 остаются сложными для исследования. Выбор в диссертационной работе в качестве центрального метода исследования метода атомно- силовой микроскопии. позволил существенно продвинуться в направлении определения пространственной структуры агрегатов о -субьединицы РПК-полимеразы Е.Со11, впервые 70 обнаружить амилоидною палочкообразную агрегацию и определить условия, благоприятствующие ее интенсивному формированию.

В работе продемонстрирован методически грамотный подход к проведению экспериментш7ыюго исследования методом атомно-силовой микроскопии. который позволил исключить влияние подложки на процесс агрегации, а также оценить корректность полученных на воздухе результатов по трехмерной морфологии и физическим свойствам агрегатов, путем сравнения их с результатами, полученными в водной среде. Использование дополнительных методов. таких как просвечивающая электронная микроскопия, деполяризованное динамическое рассеяние света, электрофорез, спектрометрия и молекулярная динамика. несомненно повышает достоверность полученных экспериментальных данных о физико-химических характеристиках агрегации и -субьединицы РНК-полимеразы Е.

С1710 70 На основании анализа полученных экспериментальных данных в диссертационной работе предлагается достаточно стройная модель агрегации о7"-субьединицы. которая позволяет интерпретировать наблюдаемый полиморфизм и механизм формирования амилоидоподобных палочкообразных и червеообразных агрегатов о -субъединицы РНК- 70 полимеразы Е. Со!!.

В качестве замечания можно отметить следующее: При оценке результатов, полученных методом атомно-силовой микроскопии„ чрезвычайно ва7кным является корректное масштабирование. Отсутствие признаков масштабирования по вертикали на рис.2, а также по вергикали и латерали на рис. 9 снижает качество представленных результатов. Указанное замечание носит рекомендательный характер и может быль учтено при подготовке доклада. представляемого к защите. В целом, автореферат достаточно полно огражает суть исследований и отвечает требованиям Положения о порядке присуждения ученых степеней в Московском государственным университете имени М.В.

Ломоносова. Профессор„доктор физико-математических наук, Кафедра микро- н наноэлектроникн СПбГЭТУ "ЛЭТИ" Петров А. А. 19737б, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, дом 5 Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет "ЛЭТИ" им. В.И, Ульянова (Ленина) (СПбГЭТУ "ЛЭТИ") тел.: ~812) 234 16 82 егпа11: ре1гоч-с1пзфта1!.п~ .