49218 (Теоретические основы использования компьютерных программ в биологии), страница 4

2016-07-30СтудИзба

Описание файла

Документ из архива "Теоретические основы использования компьютерных программ в биологии", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "информатика" из 1 семестр, которые можно найти в файловом архиве . Не смотря на прямую связь этого архива с , его также можно найти и в других разделах. Архив можно найти в разделе "курсовые/домашние работы", в предмете "информатика, программирование" в общих файлах.

Онлайн просмотр документа "49218"

Текст 4 страницы из документа "49218"

Поместите объект-микрометр под первый объектив микроскопа в направлении Х и захватите изображение. Затем поместите микрометр в направлении Y и также захватите изображение.

Повторите эти действия для всех имеющихся объективов

Выберите нужную пространственную калибровку для изображения.

Выберите тип измерения.

Длина (Length): Нажмите левую кнопку мыши на первой точке отрезка и перетащите во вторую точку. Доступен масштабируемый просмотр.

Длина по кривой (Curved Length): Нанесите кривую, не отпуская кнопку мыши. При отпускании кнопки сразу появляется результат измерения.

Угол (Angle): Выберите три точки объекта для определения угла между двумя линиями.

Радиус (Radius): Выберите три точки для определения по ним радиуса окружности.

Периметр (Perimeter): Обозначьте мышью контур объекта и, вернувшись достаточно близко к начальной точке, отпустите кнопку мыши. Контур автоматически сомкнется и будет подсчитан его периметр.

Площадь (Area): для определения измеряемого объекта доступны четыре инструмента – Прямоугольник, Окружность, Произвольный Контур, Клавиатура.

a. Прямоугольник (Area Rectangle). Этот инструмент предназначен для быстрого приближенного измерения участка прямоугольной или близкой к прямоугольной формы.

b. Окружность (Area Ellipse). Применимо к объектам округлой формы.

c. Произвольный контур (Area Free Hand). Используется для вычисления площади фигуры произвольной формы. Обозначив указателем контур фигуры и вернувшись достаточно близко к начальной точке

Меню Измерения (Measurements)

Меню размер частиц (Particle Size)

Эта функция позволяет проводить различные измерения определенных частиц на основе их разделения по яркости / монохромным оттенкам. Обнаружение можно проводить вручную или автоматически. Объекты должны иметь яркость / монохромный оттенок, отличный от фона.

Выбор объектов

Доступны три режима выбора объектов по яркости / оттенку:

Вручную (Manual):

Выберите этот режим, если хотите самостоятельно установить диапазон яркости для обнаружения объектов.

Автоматически, яркие объекты (Automatic Bright Object):

Выберите этот режим, если хотите, чтобы программа автоматически обнаружила объекты по яркости / оттенку серого в предположении, что объекты светлее, чем фон изображения.

Автоматически, темные объекты (Automatic Dark Object):

Выберите этот режим, если хотите, чтобы программа автоматически обнаружила объекты по яркости / оттенку серого в предположении, что объекты темнее, чем фон изображения.

Порядок действий

Активизируйте изображение для анализа

Выберите нужную калибровку (т.е. соответствующую увеличению на котором изображение было снято).

Выберите один из трех режимов обнаружения объектов.

В случае ручного выбора, установите диапазон яркости, в котором находятся интересующие объекты. Перемещайте курсор, пока все нужные объекты не будет обозначены псевдоцветами.

В случае Автоматического распознавания Светлых и Темных Объектов, объекты обозначены псевдоцветами согласно определенной яркости / оттенку серого.

Нажмите на интересующем объекте для получения результатов.

Процесс может быть повторен неограниченное количество раз для

получения результатов по каждому интересующему объекту.

Цвета псевдокодирования могут быть выбраны на палитре.

Результаты измерений отображаются в виде параметров: Длина (Length), Ширина (Width), Площадь (Area), Соотношение Размеров (Asp.Ratio), Округлость (Roundness), Форма (Shape), Площадь Прямоугольника (Box Area), Центроид X (Centroid X), Центроид Y (Centroid Y), Удлиненность (Elongation), Ориентация (Orientation), Диаметр Окружности (Circle Diameter), Объем Сферы (Sphere Volume), Большая ось (эллипса) (Major Axis), (Thread Length), (Thread Width), Длина волокон (Fibre Length), Ширина волокон (Fibre Width), Минимальный радиус (Min.Radius), Максимальный радиус Max.Radius) и т.д.

Результаты могут быть распечатаны при нажатии на кнопку Отчет (Report).

Меню сегментация (Segmentation)

Фаза (Phase) в материале описывается как область одного контраста в зависимости от состава образца. Так как Фаза определяется и ее площадь подсчитывается на основе разделения по яркости / оттенку серого, то доступна опция разделения по фазам при помощи гистограммы. Несколько Фаз кодируются в псевдоцвете и условно отображаются на исходном изображении. Результаты и изображения сохраняются в форматах, соответствующих промышленным стандартам. Для успешного разделения по фазам, можно сначала применить фильтры Сглаживания, Устранения Шумов и т.п. Гистограмма создается для монохромных изображений, как только вы открываете модуль Сегментации. На оси Х откладываются оттенки от 0 до 255, а на оси Y – количество пикселей. Эту функцию можно использовать для подсчета, например, соотношения ядер и цитоплазмы.

Гистограмма. Фазовый анализ позволяет пользователю выделять до десяти различных пороговых диапазонов для разделения материала по фазам, и называть каждую фазу нужным именем. Цвет между двумя линиями обозначает псевдоцвет фазы.

Яркость. Диапазон яркости / оттенков серого для текущей фазы отображается в диалоговом окне.

Выбранная фаза. Это свойство позволяет пользователю узнать процентное содержание определенного диапазона яркости лишь по нажатию мыши. Все предыдущие операции должны быть удалены и Предпросмотр (Preview) отключен.

Порядок действий

Загрузите изображение для анализа

Выберите нужную калибровку

Выберите Сегментация (Segmentation) > Фаза (Phase) из главного меню

Появится гистограмма для текущего изображения

На гистограмме будет одна передвигающаяся линия. Чтобы ее переместить, щелкните на ней курсором, который приобретет вид стрелки. Передвиньте линию в нужную позицию, не отпуская кнопку мыши, и затем отпустите кнопку.

Нажмите Новая (New) для второй Фазы. Появится вторая линия. Псевдоцвет второй Фазы можно выбрать в окне палитры.

Вторая и все последующие линии могут быть выставлена таким же методом, как и первая.

Нажмите Удалить (Del) для удаления последней Фазы

Для обновления всей операции нажмите Сбросить

Нажмите Все (All) для просмотра всех выбранных Фаз

Результаты для каждой Фазы отобразятся как Процент Площади (Area%) и Вся Площадь (Area%).

Нажмите на любой Фазе. Выберите для нее имя, которое сохранится по умолчанию до следующего изменения.

Чтобы узнать результаты измерений для одной фазы автоматически, нажмите мышью на интересующем участке изображения. Нажмите Выбранная Фаза (Selected Phase), и появятся результаты.

Нажмите Report (Отчет) для вывода на печать.

Для пересылки результатов в формат таблиц нажмите Ms Excel (To Excel).

Для построения графика распределения измеренных фаз нажмите Graph.

Отчет (Report)

Все модули содержат кнопку Отчет (Report). Для получения распечатки или передачи результатов на любую другую платформу или для сохранения результатов кликните Отчет (Report).

База данных (Database):

Для переноса результатов в базу данных кликните по кнопке Add to Data (Добавить к данным), расположенной в Информация о препарате (Sample Information).

Появится сообщение об успешном переносе результатов.

Закройте все формы, которые открыли.

Кликните по пункту Company (Название компании), расположенной в панели текст.

Кликните по пункту Copy Database ( Копировать базу данных )

Результаты будут переданы в базу данных.

Результаты могут быть просмотрены при нажатии на кнопку Database Option (Опции базы данных).

Полный отчет доступен для предварительного просмотра в каталоге Show Report (Просмотр отчетов).

База данных всех отчетов доступна в формате MS Excess.

Заголовок для Отчета (Header For Report):

Перейдите к названию компании в панели текст (Text Bar).

Кликните по пункту Name & Other Details (Название и другие детали).

Текстовое поле появится

Кликните по пункту

Эта информация будет оставаться по умолчанию, заданным

Окно (Window)

Это меню управляет открытыми в программе BioVision окнами. При открытии этого меню появляются список всех открытых окон и следующие пункты:

Каскад (Cascade) – располагает открытые окна каскадом.

Разделить (Tile) – разделяет активное окно пополам.

Закрыть все (Close All) – закрывает все открытые окна.

Клавиши быстрого доступа (Shortcut Keys)

1. New Новый Ctrl+N

2. Open Открыть Ctrl+O

3. Save Сохранить Ctrl+S

4. Image Properties Свойства изображения Ctrl+I

5. Show Capture Показать изображение Ctrl+U

6. Close Capture Закрыть изображение Ctrl+L

7. Save Single Frame Сохранить изображение Ctrl+F

8. Exit Выход Ctrl+E

9. UNDO Отменить Ctrl+Z

10. REDO Повторить Ctrl+Y

11. Cut Вырезать Ctrl+C

13. Paste Вклеить (вставить) Ctrl+V

14. Select ALL Выбрать все Ctrl+A

15. Zoom IN Приблизить F11

16. Zoom OUT Удалить F12

Помощь (Help)

Для получения дополнительных сведений нажмите клавишу Помощь (Help). В меню Help есть два пункта: About (О программе) и Help Topics (Помощь, содержание). Щелкните по каждому из них и появятся следующие окна: Окно с информацией о программе и производителе. Окно помощи, где можно находить информацию по содержанию, предметному указателю и искать по введенному вами слову. Если нужна информация по конкретному термину (слову), нажмите кнопку Предметный указатель, появится окно, в котором нужно ввести это слово, затем Показать, откроется нужный раздел.

Таким образом, программа Bio Vision, используемая в биологии позволяет отобразить все параметры научных исследований по биологии. Программа имеет удобный однооконный интерфейс, поддерживает любые платы ввода изображения, камеры, микроскопы.


1.2 Возможности Office Excel 2007


Microsoft Office Excel 2007 включает в себя широкий спектр возможностей для анализа, представления, обмена и управления информацией, позволяющих с одного взгляда выявить важнейшие тенденции в бизнесе и принять взвешенное решение. Благодаря динамическим представлениям сводных таблиц новая версия Excel вооружает пользователя мощными средствами для упорядочения и анализа деловых данных. Новые возможности условного форматирования позволяют отобразить информацию об эффективности работы предприятия в наглядном графическом виде, а интуитивно понятные галереи превращают итоги такого анализа в профессиональные диаграммы. Новые возможности в создании формул в ячейке рабочего листа включают в себя панель формул изменяемого размера и функцию контекстно-зависимого автозавершения текста формулы, обеспечивающую ускоренный ввод однажды набранной на листе формулы. Кроме того, формулы и функции могут ссылаться на именованные диапазоны и таблицы. Количество ссылок на другие ячейки теперь ограничено только объемом доступной памяти компьютера.

Строка формул автоматически расширяется при показе больших сложных формул, не закрывая при этом данных рабочего листа. Количество вложения функций увеличено до 64, но только при использовании новых форматов файла рабочей книги. Использование формата файла, совместимого с предыдущими версиями, по-прежнему не позволяет строить формулы более чем с семью вложениями функций. Поддержка работы с таблицами однородных данных позволяет ссылаться в формулах на таблицы. Заголовки столбцов таблиц при прокрутке остаются на виду, а функция автонаполнения автоматически расширяет такую таблицу при ее заполнении данными. Применение тем и стилей позволяет быстро выполнить форматирование данных на рабочем листе Office Excel 2007. Набор тем — общий для всех приложений Office 2007, включая Microsoft Office Word и Microsoft Office Power Point, в то время как набор стилей специально предназначен для форматирования собственных объектов Excel, таких как таблицы, графики, сводные таблицы, диаграммы и фигуры. И темы, и стили могут настраиваться пользователем, что дает ему возможность создавать документы на профессиональном уровне, с фирменными наборами цветов, шрифтов, рамок и заливок. Единственное, что не подлежит здесь самостоятельной настройке, это стили графиков, в которых можно выбирать только из заранее предопределенных наборов. Как и в Excel 2003, к выделенным диапазонам ячеек можно применить стиль ячеек. Поскольку большинство стилей ячеек не связано с темами, легко создать свой собственный набор стилей оформления отдельных таблиц.

Условное форматирование ячеек расширено богатыми схемами визуализации данных, что облегчает задание условий для выявления различных тенденций, шаблонов или исключений в данных на рабочих листах. При этом число условий ничем не ограничено. Office Excel 2007 теперь поддерживает 16 млн. оттенков цвета и неограниченное число вариантов форматирования в одной рабочей книге. Арсенал средств визуализации данных в Office Excel 2007 содержит цветные градиенты, столбики данных и значки. Применение условного форматирования (например, трехцветного градиента) позволяет выделить актуальные значения в наборе данных и получить более четкое представление о положении этих значений во всем диапазоне рассматриваемых данных. После этого данные можно переупорядочить сообразно различным условиям сортировки, таким как Sort by Smallest to Largest («От наименьших к наибольшим») или Cell Color («Цвет ячейки»). При этом поддерживается до 64 уровней сортировки данных, в том числе возможность сортировки по цвету фона ячейки или шрифта. Новый интерфейс построения сводных таблиц позволяет получить результат несколькими щелчками мыши, поскольку не требует перетаскивания полей в макете. Кроме того, облегчается форматирование и настройка сводной таблицы благодаря размещению этих инструментов на панели задач. При этом поддерживается откат для большинства действий, связанных с изменениями сводной таблицы. Аналогично таблицам рабочего листа, применение стилей к сводным таблицам позволяет быстро оформить их необходимым образом. Поддерживаются условное форматирование ячеек сводной таблицы, а также настройка режимов сортировки и фильтрации ее данных. Эти же нововведения доступны и для сводных диаграмм. Общие интуитивно понятные средства построения диаграмм и графиков в Office Excel 2007, Office Word 2007 и Office Power Point 2007 помогают обеспечить единообразный вид документов, электронных таблиц и презентаций, упрощая создание профессионально выглядящих графиков и позволяя форматировать оси, надписи и другие метки на графике посредством меньшего числа щелчков мышью. При этом данные рабочего листа Excel могут быть сохранены как в документе, так и в презентации, позволяя выполнять дальнейшие манипуляции с диаграммой. Основанные на выбранной теме стили диаграмм включают в себя специальные объемные эффекты, падающие тени и прозрачность. Поскольку для их поддержки используется инструментарий OfficeArt, то почти все эти инструменты доступны для форматирования элементов диаграмм. Новый интерфейс дает возможность быстрого доступа к заголовкам, осям, меткам данных, легенде, линиям тренда и другим компонентам диаграммы в случае их изменения, форматирования или удаления. При копировании диаграмм Excel в другие приложения Office 2007 они автоматически изменяются на тип объекта, соответствующий документу или презентации. Команда Paste Special («Специальная вставка») позволяет выбрать тип объекта по усмотрению пользователя с установлением связи с источником данных либо созданием копии объекта. В презентациях Office PowerPoint 2007 любые элементы вставляемой диаграммы могут быть анимированы, позволяя докладчику выполнять ее динамическую демонстрацию.

Поддержка новых форматов файлов позволяет сократить размер хранимых рабочих книг, обеспечивая при этом обмен информацией между различными приложениями. Основным форматом в Office Excel 2007 выступает основанный на XML-представлении формат с расширением (.xlsx). Другой формат поддерживает использование макросов в книге Excel и имеет расширение (.xlsm). Для шаблонов Office Excel 2007 применяют форматы (.xltx) и (.xltm) для обычных книг и книг с поддержкой макросов. В дополнение к этим форматам в Office Excel 2007 представлен новый бинарный формат (BIFF12) с расширением (.xlsb) для компактного хранения рабочих книг большого объема с возможностью обратной совместимости с предыдущими версиями Excel. Поскольку предыдущие версии не поддерживают новые свойства данного приложения, можно использовать специальный инструмент для проверки присутствия данных свойств в рабочей книге. Для предыдущих версий доступны обновления и конвертеры, позволяющие редактировать файл, подготовленный в Office Excel 2007, без потери нового функционала. В остальных случаях можно сохранить рабочую книгу в формате, понятном для версий 97-2003, с обычным расширением (xls). Улучшенные свойства печати обеспечивают соответствие между изображением на экране и версией таблицы, выводимой на принтер. Для этого добавлено новое представление Page Layout («Разметка страницы»). В нем визуально можно создавать и редактировать колонтитулы страницы, управлять размером полей, размещением объектов и другими элементами настройки печатной страницы. Подобно другим приложениям Office 2007, рабочую книгу можно сохранить в статических форматах Portable Document Format (PDF) или XML Paper Specification (XPS), позволяющих познакомиться с ее видом пользователям, не имеющим на компьютере Office Excel 2007. Таким образом, возможности Excel очень высоки: это обработка текста, создание электронных таблиц, диаграмм, управление базами данных. Такие программы на сегодняшний день представляют собой один из наиболее мощных и гибких инструментов, созданных для компьютера и используемых для написания научных работ.


Глава II. Экспериментальная работа по использованию компьютерной программы по биологии


Использование программы BioVision

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Нет! Мы не выполняем работы на заказ, однако Вы можете попросить что-то выложить в наших социальных сетях.
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
4098
Авторов
на СтудИзбе
667
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее