Пташне - Переключение генов - 1988, страница 28

39. 58, 70, 85, !14. 124 !28 Ген с!1 24, 62, 79, 85, 86, ! 15 - сЯН 24, 62. 67, 79, 85. 86, 115 гто 19, 23, 24. 58, 62, 67„68, 69, 87, 116 промотор см. Промотор Р„ — регуляция 28-33, 37, 39, 41, 58 — 60, 69, 73, 108-113, 1!б САС! лрожжей 145 шг 65, 70, 71, 73, 74-75, 82 !ас ? 89, 94, 108-109. 111, 116, Сн. также р-Гала кгознлаза — )ск А 19, 145, 146 ,х)19, 62, 64. 67, 68, 69, 71, 75, 77, 80 О 67,77 — Д 19, 62, 69, 71, 79 — гссА 19, 1!8 тй 74, 75, 76, 82 Гены гомеозисные 79 регуляция 6, 9, 11„!8 19, 28 30, 38 40. 42. 61.

62. 83, 89. 129, 143 148 хвостового отростка 63, 65, 69 экспрессия 9, 11. 78 79, 82, 143. С.и. н~акжс Транскрипция - и сигналы из окружающей среды 6, 9, ! 1, 18, 62. 79 — 82 — да! 82-83 - !аг, оператор 89. 109 промотор 94, 108-111, !!5, !16 — — репрессор 82, 89 — 90, 109, 110 †!3, 1!5, 116, 119. 120 Гетероиммуиность 86 Димстилсульфат !ДМС) 103, 122, 123. С.и. также ДНК-белковые взаимодействия и Метилирование ДНК б, 11, 12. !3.

14, 42, 43, 119. !22, 129 большой желобок 12, 43, 46, 47. 49, 50, 51, 52, 54, 55, 103, !04, 119, 120, 122, 143, 144 гибкость 56, 120, 146, 147, 148 изменения конйюрмапии 124, 144 — метилированис 103, 104, 122, 123. б'ж. шакжс Диметилсульфат — повреждения 21. 35, 77. 90 — рекоыбинация 35, 76, !29 репликация 13, 14, 20„ 42, 62, 74, 93, 129 структура 12. 13. 43. 56.

106, 119, !44, 145 ДНКаза си. ДНК-белковыс взаимодействия. футпринтинг ДНК-белковыс взаимодействия 17, !8, 42, 47 49. 51-56, 58-60, 1!8, 119, 125-126, 134 †1, !42, 143 †1 . — влияние метилирования на связывание белков 123 †1 — защита от зтилирования ! 05 — конз'акты аминокислот с парами оснований 49, 51 56, !23- 124, 143 — — связывание с нигропеллюлозныки фильтрами 97 98, 1ОО, 105. 1!8, !23 — футпринтинг 102- 105.

107 108, !22, 128 — с использованием димегилсульфата !ДМС) 103-104, !07, 122. 123 ДНКазы 102-103, 107, 125 Егсйсгй)па саб 9, 10, 26, 41, 76, 119, !29, 135, 138 Зигогная инлукция 88 Изопропилтно-Г)-галактозил !ИПТГ) 89, 109, 110, 1! 1, 119 Иммунитет 22, 23, 85. 86-87. 88. !14 — 1!5 Иммунности область 86. 87 Кемпаслю модель 66 Клонирование 93, 116 Кооперативность 31-33, 37-39, 107 -108, 111, 1!2, 113, 129, !38 †1, !44, 147 148.

См. также Белок- белковые взаимодействия Лггзис и лизогения, выбор пути развития !9 22, 23, 61- 62. 65, 71 .73, 81 Лизогсния 20 — 23, 26, 28 ЗО, 33-35, 38, б! 62, 64- 65, 70, 7! 73, 77. 79.80, 85 86, 87 88 Липкие концы (гог) хромосомы фага 63, 64 Литический пусть развития(лизис) 20, 21, 22, 37.

61. 64- 65. 69 70, 71 72. 74- 75, 79, 80 Метилирование см. Диметилсульфат (ДМС). ДНК. ДНК-белковые взанмолействия Мутанты по позитивному контролю гм. Репрессор фага ). и белок ОА1.4 Нитроцеллюаоза с.и. ДН!фбелковые взаимодействия, связанные с нитроцсллюлозными фильтрами Оператор 17, 22, 23. 24, 42-45, 49, 53, 54, 55, 58, 93, 97- 100 — левый (Оь) 24, 43, 44, 45, 69, 71, 105, 108, !17, !29 Оператор левый (О, ), мутации 86, !05 правый (О„) 24, 27, 28, 29, 33,42 45, 58, 71. 73. 103 ! 05, 107 108, 110-113, 116 118, 124-128 связывание с регуляторными белками 17, 28, 31 33, 35 36, 97 100, 103-104, 110-!!4.

!!7, 134-140 симметрия 42-45, 49„104, !05 Плазмилы 93, 94, 109, 11О, 1!6. 120 Промотор 15, !6-17, 22 23. 24, 25, 56-57, 58, 59, 60 Р, 70 71, 73. 74 — Р, 24, 69, 73. 74. 75, 76, !!5 Рк 23, 24, 25, 29.30, 37, 38, 39, 41, 57.60, 108, 109, 110.114, 115-117, 127, 128 — Р,. 69, 70 Рго 70-71, 73 Р,и 23, 24. 25, 28-31, Зб, 41, 57-58, 60, 70 71, 73. 94, 108, ! 10 .114, 1!б-! 18, 125, 126, !27-128 Профаг 20, 22, 26.

61, 66 Рекомбинации область 62, 65, 67 С:и. также ген т! Рентгеиоструктурный анализ 106, 117. 119 120, 124 — комплекса репрессора с оператором фага 434 119-! 20 Репликации область 62, 65, 67. Сч. также Ген О Репрессор. "гибридные" спирали 120 121 - фага Х, выделение 90 94 — лимеризапия 26, 28, 36, 37. 38, 96, 99, 100 — — инактивация 22, 34-35, 37, 40, 61. 77, 81, 118 — как негативный регулятор 29, 31-33, 58, 86, 110, 111, 113, !28 Рспрессор фага Х как позитивный регулятор 29 30, 31- ЗЗ. 57.

58, 86, 110, !11, 1!3, 127 128, 142, 144, !48 контакты с РНК-полимеразой 29 .30, 3 1 33, 34, 58, 124 ! 29. С'м. тажжс Белок-белковыс взаимолсй ствия концентрация в клетке 33 34. 38-39, 90, 98, 99, !10, !11, 134-136, 140, 142 — -- равновесие мономеров и димеров 26, 38, 41 96, 100 101 связывание с ДНК 27, 31 33, 38. 40, 41, 42-45, 48-49, 5! — 56, 9! 92. 153 97 -100, 102- 105, 106 114, 119, 122.127, 129 — .

— "узнаюпзая" спираль 47, 49, 51-55, 119, !21, 123, 125, 127 434 41. 87. 92. 118, 119, 120, !21 — Р22 41, !20. 121, 126-127 Ретрорегуляция 74, 75. 82 РНК матричная(мРНК)!4,!б, 67, 68, 69, 73, 74, 75. См. тикже Транскрипция РНКаза!1! 74 РНК-полимераза 17, 22. 25, 34. 56, 69, 75. 1!4. 117, 124, 129„142, !44 !)-Слои 49- 50 а-Спирали 46-.17.

49 — 50, 104. 119 121. 123, 143 БОБ-ответ 77 78 Транскрипция 13, !5, 16, 17, !8, 25, 56-67. 127.!29. 144, 145 Фаг 434 41, 86, 87, !22. С.и. так;жг Репрессор фага 434 — Р22 41. !20, !22 См. тгжже Репрсссор фага Р22 л. вырезание 1эксцизия) 62, 66, 73, 75. 129. См. лиакже Белок Х)з генетическая карта 63. Сзь также Фаг )., хромосома . — жизненный цикл 19. 20, 61-67, 68. Си. лликже Литический пугь развития . - заражение 10.

20. 61. 90, 114 1!5 — . интеграция 62, 63, 65, 66-67„ 73 — 76, 129. Си. также Белок )п! мутанты Р„„1)р-1 106, !11, 113, 116, 117 - Х иг 85, 92, 105„1!4 — - регуляция генов б. 7, 1!. 18, 19. 20- 23, б! 62, 63, 66„ 71, 73, 77, 78 83 — — хромосома 20 — 23. 61. 62 67, 69-76, 86, 87, 88 Х!тт~з 87 91 92 1!5 Ферменты рестрикции 93, !44 УФ-облучение 35, 77, 90 Участок (сайт) ипй бб, 75. 76.

77 — — игпи бб, 75 )яи! 68, 69, 77 Цллг 70 .гбу 74, 75 - 1)г)Яо 143 146 Эй.ига тест на канцерогениость 78 Эгилнитрозомочевина 105, !23. См. также ДНК-белковые взаимолейсз вия Эукариотические клетки, гены б, 9. 80 81, 143, 145, 148 Эукариозическис клетки. ДНК 140 141 развитие б, 9. 11„ 19, 77-79, 80-83 регуляторный белок 81, 141, 143 148. См.

также Белок б)АЕ4 — — ялро 80-81, 140-141 Оглавление От редактора перевода П редисловие Введение Глава 1. Основные компоненты регуляторного механизма 211 23 25 26 27 Комнонензы переключи гела днк РН К-полимсраза Репрсссор Белок Сто 28 29 29 41 генов. 37 40 41 4! и регупя- 42 Глава 3 Регуляторные механизмы и жизненный цикл фага 6! Краткое описание разьнтия Фага 62 155 Действие репрессора и Сто Негативная рсгузяпия Позитиеыая регуляпня Кооперативное связывание рспрессорл Индукпия †переключен регуляторпого аппарата Кооперативносгзн ус гойч иное г ь и чу негин тел ьносз ь не реки ючателв Действие аеторсгуляппи Другие фягн Лвтератураз обзоры Глава 2 ДНК-белковые взаимодействия ция активности генов Операз ор Репрессор Белок Ого Взаимодействие аминокислот с варами основииий Промотор Регулнпня генов Литература: обзоры 49 51 56 53 60 клеток: возможные 78 78 80 82 89 90 93 94 97 !56 Генетическая карта Циклизация Экспрессия генов Прелрапние Ранние Поздние Интеграция Ре|уляция траскрнпцни Предранняя сталия Ранняя стадия Поздняя стадия зи|нческой инфекции Поздняя стадия зизогснни Принягне ре|нения Регуляция интеграции и эксцнзни Установление зизогении Литнческий рост Индукпия ДРутие фаги ВОЯ-ответ Пути развития фага х н развитие зукариотических аналогии Регу чяторные гены Персключатечи Способы экспрессии генов Механизмы регуляции Литература: обзоры Глава 4, Откуда мы зто знаемг Ключевые зкспери- менты Гипотеза о сушествовании репрессора Прозрачные и внрулентные му|виты Наблюдения Объяснение Иммунносзь и ге| еронммунность Йаблзодения Объяснение Асимметрия бактсриа.|ьной конъюмцни Наблюдения Объяснение Проблема репрессора в начале 60-х гг.

Выделение репрессора и его связывание с ДНК Получение большого количества репрессора Основные положения |л. ! н 2 Репрессор состоит из двух глобулярных доменов, соединенных мостиком примерно из 40 аминокислот Репрессор димеризуется главным образом благодаря взанмодсйстви|о С-концевых доменов Димер репрсссора связывается своими уч-концевыми доменами с операторным участкол| длиной !7 пар оснований 62 63 63 64 64 65 66 67 67 67 69 70 7! 73 73 74 75 76 84 84 84 86 86 86 87 87 87 88 Один операторный участок связывает один лимер рспрессора Димер образуется до связывания с ДНК С ДНК контактирует !Ч-концевой номен Правый оператор состоит иэ трех участков связывания репрсссорв длиной 17 пар оснований каждый Рспрессор и белок Сто связываются с олной и гой же стороны двойной спирали в кажлом участке связыввния Химическое зондирование Мутантные операторы Связывание со свсрхспиральной и линейной ДНК Репрессор свяэывает*я с ~ремя операторными участквми Ох проявэяя при этом альтернативную попарную кооперативность Кооперативность обеспечивается выимодсйствиями между С-концевыми доменами соседних лимеров В лизогенных к тетках репрессор обычно связан с 0„1 и 0«2 Свят шные молекулы репрессора выключают транскрипцию гена г ~ а осуществляющуюся слева направо, и стимулируют транскрипцию гена г1 и гушую справа налево При более высоких коицентра циях репрегсор связывается с Ск 3 и вык ~ючаст ~ ранскрипцию г ! Сто вначале связывается с 0„1 а чатем ь Ох! и 0«2 таким образом он вначале выктючасг Р,„а чатем Р„ Некоторые общие сведения о бечке Сто Белок Сто гп»шо Беэок Сто ш тяго Белок йесА расщепляет репрсььор и тем самым запускает иплулцинэ Связывание Сто с О, 1 эапускает механизм переключения Рспрессор и Сто связываю тся с оператором так как это показано на ргю 2 6 2 8 и 2 1О Рснтгсноструктурный анализ Почученис и свойства «гибридных снираэей» Ро ~ь «рук» х-репрессора Специфические кон~акты аминокисэот с основаниями Рспрсссор активирует транскрипцию гегы г! связываясь с Ок2 и контактируя с полимсразой своим Н-концевым доменом Мутации нарушшошис позитивную регуляцию Позитивная регу ~яция ш тпго !включение .1нгервттрв Обюры Оригиначьнью статьи 97 Кю 102 104 105 !05 106 !07 108 114 П4 !!6 П7 118 П8 119 П9 120 123 124 124 127 !28 130 130 130 эффектив- 157 Приложение 1 Конструирование белка, но связывающегося с ДНК Резюме Специфическое и несцецифическое связывание Увеличение спсцифичност и угвечнчснис концентрации бе ~ка Повышение специфичности Испо гьзовшэис кооперативности ДНК-белковые вэаимолействия у эукариот Лнтервгурвг оригнивльные ствгьи 134 134 134 117 137 117 118 140 141 Приложение 2.

Сильные и слабые взаимодействия. 14 Приложение 3. Единый механизм регуляции транскрипции у зукариот и прокариот .......... 141 Литература: аригииааьные егатан 148 Предметный указатель 150 .