Для студентов КГТУ по предмету ДругиеПостроение генетических карт по неполным и зашумленным даннымПостроение генетических карт по неполным и зашумленным данным
2024-07-262024-07-26СтудИзба
Курсовая работа: Построение генетических карт по неполным и зашумленным данным
Описание
Оглавление
3
Введение
Краткая медицинская энциклопедия [1] даёт следующее определение слову “гене-тика”: наука о наследственности и изменчивости организма. Согласно законам на-следования все основные признаки и свойства любых организмов определяются и контролируются единицами наследственной информации - генами, локализованными
Генетическая карта - это схема или порядок расположения маркеров на хромосоме (здесь и далее подразумевается структурный маркер, т.е.
| Введение | 4 | |||
| 1. | Обзор существующих решений | 7 | ||
| 1.1. | АлгоритмЭлстона-Стюарта.......................... | 8 | ||
| 1.2. | АлгоритмЛандера-Грина ........................... | 9 | ||
| 1.3. | Построение генетических карт по полностью секвенированным участ- | |||
| кам геномов (genmap) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 10 | |||
| 2. | Постановка задачи | 12 | ||
| 3. | Доработка алгоритма | 13 | ||
| 3.1. | Анализ недостатков и их исправление . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 13 | ||
| 3.1.1. | Восстановление расположения маркеров по матрице попарных | |||
| расстояний................................ | 13 | |||
| 3.1.2. | Повышение точности матрицы частот рекомбинаций . . . . . . . | 17 | ||
| 3.2. | Доработанныйалгоритм ............................ | 17 | ||
| 4. | Сравнение алгоритмов | 19 | ||
| 4.1. | Генерациятестовыхданных.......................... | 20 | ||
| 4.2. | Процесссравненияианализа ......................... | 20 | ||
| 4.3. | Обобщённыеданные .............................. | 22 | ||
| Заключение | 24 | |||
| Список литературы | 25 | |||
3
Введение
Краткая медицинская энциклопедия [1] даёт следующее определение слову “гене-тика”: наука о наследственности и изменчивости организма. Согласно законам на-следования все основные признаки и свойства любых организмов определяются и контролируются единицами наследственной информации - генами, локализованными
- специфических структурах клетки - хромосомах [2, 3]. В связи с этим основной задачей генетики является на основе первичной структуры биополимеров (молекул ДНК или РНК) определить фенотип особи, механизмы наследования тех или иных признаков и т.п. Получение информации о первичной структуре ДНК называется се-квенированием [4]. К сожалению, современные методы секвенирования не в состоянии предоставить информацию о полной нуклеатидной последовательности в рамках кон-кретной хромосомы [5]. Сама по себе нуклеатидная последовательность не содержит прямой информации о происхождении того или иного однозначно идентифицируе-мого участка (маркера), и поэтому довольно сложно определить, от какого предка был унаследован тот или иной признак. Для определения шаблонов наследования и выявления его принципов используются генетические карты хромосом [6].
Генетическая карта - это схема или порядок расположения маркеров на хромосоме (здесь и далее подразумевается структурный маркер, т.е.
Характеристики курсовой работы
КГТУСписок файлов
Построение генетических карт по неполным и зашумленным данным.doc
Tortuga
26 июля 2024 в 21:45
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
