Для студентов СПбПУ Петра Великого по предмету ДругиеБиблиотека MIRF Применение для анализа рассеянного склерозаБиблиотека MIRF Применение для анализа рассеянного склероза
2024-06-082024-06-08СтудИзба
Курсовая работа: Библиотека MIRF Применение для анализа рассеянного склероза
Описание
анализа рассеянного склероза
Оглавление
3
Введение
[13] стало понятно, что для создания работающего программного про-дукта из нового метода обработки изображений требуется проделать большой объем сопутствующей работы, как например, преобразование форматов, подготовка изображений к анализу, визуализация результа-тов, генерация отчетов по результатам работы. Многие из этих задач являются общими для класса задач анализа медицинских изображений, и наличие системы, которая бы брала на себя реализацию общих компо-нент и предоставляла механизмы легкой интеграции пользовательского кода, могло бы ускорить внедрение концептов и методов в различные медицинские учреждения. Поэтому было принято решение разработать подобную систему.
Для того, чтобы показать возможности системы, было решено со-здать инструмент для генерации отчетов по рассеянному склерозу – хроническому заболеванию, при котором поражается оболочка нервных волокон головного и спинного мозга. Склероз считается достаточно рас-пространенной болезнью, в среднем диагностируют 20-30 случаев на 100 тысяч населения. Основным способом слежения за развитием бо-лезни является МРТ сканирование мозга раз в 6-12 месяцев. На МРТ склеры – участки поражения – выглядят как области светлее нормы. Новое сканирование сравнивается со старыми снимками и на основе со-поставления специалистом составляется отчет – объем новых участков поражения, изменение объема существующих. Так как очагов может быть несколько десятков, а снимков для сравнения несколько сотен, то составление такого отчета является весьма трудоемкой задачей, и хо-тя бы частичная автоматизация данного
Оглавление
Введение | 4 | ||
1. | Постановка задачи | 5 | |
2. | Обзор существующих решений | 6 | |
3. | Medical Images Research Framework | 8 | |
| 3.1. | Kotlin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 8 |
4. | Архитектура и особенности MIRF | 10 | |
| 4.1. | Core & Features . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 10 |
| 4.2. | Данные............................. | 10 |
| 4.3. | Алгоритмы........................... | 11 |
| 4.4. | Блоки.............................. | 12 |
| 4.5. | Pipeline. PipelineKeeper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 12 |
| 4.6. | Форматы ............................ | 15 |
| 4.7. | Инициализация пайплайна . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 17 |
| | 4.7.1. Особенности создания пайплайна и блоков . . . . | 17 |
| | 4.7.2. Пример установлений связей между блоками . . . | 18 |
| 4.8. | ГенерацияPDFотчетов.................... | 18 |
| | 4.8.1. Изменение внешнего вида параграфов . . . . . . . | 20 |
5. | Применение | 21 | |
| 5.1. | mirfMs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . | 22 |
| 5.2. | Удаленноевыполнение .................... | 23 |
| 5.3. | Пайплайн............................ | 24 |
| 5.4. | Генерацияотчета ....................... | 24 |
6. | Особенности процесса разработки | 27 | |
7. | Результаты | 28 | |
Список литературы | 30 |
3
Введение
- ходе разработки приложения для анализа объема орбиты MISO
[13] стало понятно, что для создания работающего программного про-дукта из нового метода обработки изображений требуется проделать большой объем сопутствующей работы, как например, преобразование форматов, подготовка изображений к анализу, визуализация результа-тов, генерация отчетов по результатам работы. Многие из этих задач являются общими для класса задач анализа медицинских изображений, и наличие системы, которая бы брала на себя реализацию общих компо-нент и предоставляла механизмы легкой интеграции пользовательского кода, могло бы ускорить внедрение концептов и методов в различные медицинские учреждения. Поэтому было принято решение разработать подобную систему.
Для того, чтобы показать возможности системы, было решено со-здать инструмент для генерации отчетов по рассеянному склерозу – хроническому заболеванию, при котором поражается оболочка нервных волокон головного и спинного мозга. Склероз считается достаточно рас-пространенной болезнью, в среднем диагностируют 20-30 случаев на 100 тысяч населения. Основным способом слежения за развитием бо-лезни является МРТ сканирование мозга раз в 6-12 месяцев. На МРТ склеры – участки поражения – выглядят как области светлее нормы. Новое сканирование сравнивается со старыми снимками и на основе со-поставления специалистом составляется отчет – объем новых участков поражения, изменение объема существующих. Так как очагов может быть несколько десятков, а снимков для сравнения несколько сотен, то составление такого отчета является весьма трудоемкой задачей, и хо-тя бы частичная автоматизация данного
Характеристики курсовой работы
Предмет
Учебное заведение
Семестр
Просмотров
2
Размер
473 Kb
Список файлов
Библиотека MIRF Применение для анализа рассеянного склероза.doc